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樊凯
作品数:
1
被引量:2
H指数:1
供职机构:
杭州电子科技大学
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发文基金:
浙江省教育厅科研计划
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相关领域:
医药卫生
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钱苗苗
杭州电子科技大学校医院
李小平
杭州电子科技大学校医院
周林福
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2017
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2016年杭州地区肠道病毒71型VP1基因序列测定及进化分析
被引量:2
2017年
目的通过测定和分析肠道病毒71型毒株VP1区序列,掌握了EV71的流行情况及种系进化关系,为手足口病毒所致疾病的预防和治疗提供支持和依据。方法利用RT-PCR的方法扩增EV71病毒VP1区核苷酸序列,测序后利用DNASTAR和Primer Premier 5.0进行序列比对分析,并用Mega 3.1软件建立检测样本VP1区序列与Gen Bank上EV71基因型参考毒株基因序列的系统发育树。结果随机选取的21株EV71分离株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为95.6%~100%和99.2%~100%;通过系统进化树分析显示,21株EV71均属于C4a基因亚型。结论 2016年杭州地区EV71毒株的基因亚型与当前国内外某些地区的分型结果一致,故它们有望成为疫苗候选株并作进一步研究。
李小平
樊凯
吴亦栋
周俊
周林福
钱苗苗
关键词:
手足口病
肠道病毒71型
VP1
系统进化分析
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