陈颖
- 作品数：2 被引量：6H指数：1
- 供职机构：南昌师范学院更多>>
- 发文基金：江西省自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 江西省3个地方鸡种遗传多样性分析被引量：5
- 2020年
- 为探究江西省3个地方鸡种的遗传多样性,为江西省家禽群体遗传资源的合理利用和种质资源保护提供依据,利用飞行质谱分型技术对宁都黄鸡、白耳黄鸡、安义瓦灰鸡3个群体(463只个体)1号染色体上的25个单核苷酸多态性(SNP)位点进行基因型分型,计算每个SNP位点的等位基因频率、表观杂合度、期望杂合度、多态信息含量及群体间Nei氏标准遗传距离。结果显示,所有位点在3个群体中的平均有效等位基因数、期望杂合度和多态信息含量分别为1.636、0.367和0.291,其中白耳黄鸡的平均有效等位基因数、期望杂合度和多态信息含量最高(1.684、0.387和0.303),安义瓦灰鸡最低(1.562、0.328和0.262)。遗传距离和系统聚类结果显示,3个群体的遗传相似性都比较高,安义瓦灰鸡和白耳黄鸡2个群体聚为一类,宁都黄鸡单独聚为一类。
- 谭玉文饶友生刘慧琳肖月玲徐霞陈颖朱学农
- 关键词：地方鸡种种质资源单核苷酸多态性
- 江西省三个地方鸡种群体有效规模的估算被引量：1
- 2016年
- 在鸡1号染色体(GGA1)的Contig.060226.1上一个500 kb的区域选取30个SNP位点,研究江西省三个地方鸡种(宁都黄鸡、白耳黄鸡、安义瓦灰鸡)的单核苷酸多态性及连锁不平衡模式,估算其不同世代的群体有效规模大小。结果显示:在鸡驯养的较早期阶段(t=769),各品种的群体有效规模较大,宁都黄鸡、白耳黄鸡、安义瓦灰鸡分别为4 074、3 090、1 480;在鸡驯养的较晚期阶段,宁都黄鸡(t≤59)的群体有效规模为550,白耳黄鸡、安义瓦灰鸡(t≤45)分别为300、277。使用Sved模型对连锁不平衡系数r^2及传递的物理距离进行拟合,结果发现:宁都黄鸡、安义瓦灰鸡拟合状况良好(P=0.0272,R2=0.9196;P=0.0193,R^2=0.7276);白耳黄鸡虽未达到显著水平(P=0.3837,R^2=0.2541),但也表现出逐步递减的趋势,其r^2总变异方差的25.41%是由传递距离引起的。表明对宁都黄鸡、安义瓦灰鸡群体有效规模的估算相对准确,对白耳黄鸡群体有效规模的估算可能有偏。研究结果对于江西省三个地方鸡种特别是宁都黄鸡、安义瓦灰鸡的原位保存有重要的理论指导意义。
- 王樟凤朱学农饶昕昊肖月玲陈颖柴学文张仁颠饶友生
- 关键词：宁都黄鸡白耳黄鸡
