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陕西省急性弛缓性麻痹病例中柯萨奇病毒A组4型的基因特征被引量：14: 2016年; 阐明从陕西省2006~2010年急性弛缓性麻痹（Acute Flaccid Paralysis,AFP）病例中分离的柯萨奇病毒A组4型（Coxsackievirus A4,CV-A4）VP1编码区的基因特征,探索其在我国流行的优势基因型及其与AFP病例之间的关系。本研究通过逆转录-聚合酶链反应（Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR）对连续5年从AFP病例中分离的68株非脊灰肠道病毒（non-polio enteroviruses,NPEVs）进行分子定型,其中7株鉴定为CV-A4（7/68,10.3%）;使用特异性引物扩增CV-A4VP1编码区并进行核苷酸序列测定分析和基因进化分析,将CV-A4划分为A（基因组1）、B（基因组2）和C三个基因型,其中C基因型又划分为C1（基因组3）和C2（基因组4）两个基因亚型。中国分离的CV-A4均位于第4基因组,属于C2基因亚型,提示其可能为中国大陆CV-A4的优势基因亚型;7株陕西CV-A4毒株依据分离年代的不同位于不同的三个小进化分支里,且和来自山东和吉林两省的邻近年份的CV-A4毒株位于同一小分支,提示7株陕西CV-A4分离株和它们存在共同进化和共循环。在无脊髓灰质炎时代应进一步加强监测CV-A4在AFP病例NPEV所占的比例和动态变化。; 王东艳徐艺张勇祝双利司源严冬梅朱晖杨倩冀天娇许文波; 关键词：急性弛缓性麻痹病例

青海省2013年手足口病病原特征和人肠道病毒A组71型基因特征被引量：4: 2015年; 目的对青海省2013年手足口病（Hand,Foot and Mouth Disease;HFMD）的病原谱和人肠道病毒A组71型（Human Enterovirus Group A Type 71,HEV_（A71））的基因特征进行分析。方法对青海省2013年送检的HFMD标本,用荧光定量逆转录-聚合酶链反应（Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR）方法进行筛查,对HEV_（A71）阳性标本进行病毒分离,对分离到的病毒提取核酸,用RT-PCR方法对VP1编码区进行扩增及核苷酸序列测定和整理分析,并与HEV_（A71）各基因型和基因亚型的代表株序列构建亲缘关系进化树。结果对青海省2013年分离的62株HEV_（A71）进行VP1编码区核苷酸序列测定后,分析发现它们在VP1编码区核苷酸水平和氨基酸水平的同源性分别为95.5%-100.0%和99.0%-100.0%。与其他各基因型和基因亚型的HEV_（A71）代表株构建的亲缘进化树中显示,青海省HEV_（A71）分离株与C4亚型代表株聚为一簇,属于C4基因亚型C_（4a）进化分支。与2008年、2012年在青海省分离的HEV_（A71）在核苷酸和氨基酸水平的同源性分别为95.8%-97.5%和99.0%-99.7%。结论2013年,C_（4a）亚型HEV_（A71）在青海省持续传播并占有绝对优势,且存在两条传播链的流行。; 杨倩赵生仓檀晓娟张勇祝双利冀天娇范丽霞杨维雄刘桂香安洪秋许文波; 关键词：手足口病

2010年江西省急性出血性结膜炎病原体鉴定及基因进化分析被引量：3: 2015年; 为鉴定引起2010年江西省急性出血性结膜炎（Acute hemorrhagic conjunctivitis,AHC）疫情的病原体,并对其进行基因进化分析,本研究采集了20份门诊AHC患者眼结膜拭子,对其进行病毒分离,随后通过逆转录-聚合酶链式反应（Reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR）方法分别检测阳性分离物中肠道病毒70型（Human enterovirus type 70,EV70）、柯萨奇病毒A24变异株（Coxsackievirus A24variant,CV-A24v）和腺病毒。并对CV-A24v分离株进行VP1区和3C区全序列测定,分析其与全球流行CV-A24v的基因进化关系。20份标本中有10份病毒分离阳性,PCR检测证明引起本次AHC流行的病原体为CV-A24v。基于3C区构建的基因进化树表明10株江西CV-A24v与全球2010年后分离到的其它CV-A24v同属于GenotypeⅣ基因型的Cluster 5群（GⅣ-C5）,而且在GⅣ-C5内江西CV-A24v又分属于A和B两个传播链。基于VP1区构建的基因进化树将全球2000年后分离到的CV-A24v分成5组Group1~5（G1~5）,江西CV-A24v属于G5,这些毒株在VP1区进化树中同样分属于A和B两个传播链。本研究表明2010年至少有两个CV-A24v传播链在江西同时流行。VP1区基因进化树对全球2000年后分离到的CV-A24v的组群划分与3C区基本一致,而且与3C区呈现同样显著的年代聚集性。; 严冬梅熊英张勇杨倩张曙霞龚甜祝双利王东艳朱晖许文波; 关键词：急性出血性结膜炎

2014～2015年重庆市手足口病的流行病学及病原学特征被引量：11: 2016年; 通过对2014-2015年重庆市手足口病（Hand-foot-mouth disease,HFMD）的流行病学、肠道病毒（Enterovirus,EV）病原构成和肠道病毒71型（Enterovirus A71,EV-A71）VP1区编码基因分析,为制定重庆市HFMD防控策略提供科学依据。2014-2015年全市报告HFMD共100176例,其中重症284例,死亡37例;全市39个区县（自治县）均有病例报告,且主城区报告发病率（298.83/10万）显著高于郊区（103.37/10万）,5岁及以下的儿童占报告发病数95.64%,3岁及以下占83.21%,每年的4-7月为发病高峰期,每年的10-11月为发病小高峰期。重症和死亡病例在3岁和5岁及以下的年龄组中分别占86.97%、94.59%和96.83%、100%。其中重症病例主要集中在万州区、梁平县、涪陵区3个区县中,占全部重症病例的74.65%;死亡病例分布广泛,散在17个区县内。7503份HFMD临床标本的EV核酸检测结果,EV-A71、CV-A16、非EV-A71/CV-A16其他EV分别占23.54%、33.21%、43.25%;非EV-A71/CV-A16的其他EV成为导致重庆市HFMD的优势病原,但重症和死亡病例仍以EV-A71为绝对优势病原。对55株2014年和2015年重庆EV-A71代表毒株VP1编码序列测定和分析,提示54株均属于C4a,1株属于B5。本研究为重庆市制订HFMD防控策略,降低EV-A71引起的重症和死亡提供了重要的流行病学和病原学基础资料。; 顾新蕊赵华冀天娇李勤凌华祝双利张勇杨倩宋洋黄为许文波; 关键词：手足口病重症肠道病毒71型流行病学病原学

广东省2008～2015年手足口病流行病学特征及病原学监测分析被引量：65: 2016年; 为阐明广东省手足口病（Hand,foot,and mouth disease,HFMD）的流行病学特征及病原学构成,探索全省HFMD发病风险变化的趋势。本研究利用广东省2008-2015年HFMD监测数据、人口数据和地理资料,采用描述流行病学方法,对全省的HFMD发病趋势、人群分布特征以及病原构成等进行了系统分析。结果显示：广东省2008-2015HFMD报告人数2 133 722,重症人数5 066,死亡人数259;各地市均有不同严重程度的病例报道,尤以珠三角区域为重点高发区域;发病曲线呈双峰分布,春夏季是主高峰,秋季是次高峰;5岁以下儿童在全部发病人群、重症及死亡病例中比例分别为90.58%、95.93%和97.30%,其中3岁以下年龄组分别占65.24%、77.32%和81.85%;男性高发于女性。不同年份和不同季节的优势病原呈现动态变化,2009年主要以CV-A16流行为主;2013和2015年以非EV-A71非CV-A16其他肠道病毒为主,特别是2015年,其他EV占71.97%;但EV-A71一直是导致广东省重症病例和死亡病例的优势病原和绝对优势病原。本研究提示应继续加强广东省HFMD流行病和实验室监测,为广东省进一步完善HFMD防控策略提供科学数据支持。; 冀天娇谭小华刘冷顾新蕊刘俐郑焕英曾汉日杨倩李晖许文波; 关键词：手足口病流行病学特征病原学监测

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杨倩

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