邹勇
- 作品数:7 被引量:5H指数:2
- 供职机构:西北农林科技大学动物科技学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金青海省科技厅基金国家级大学生创新创业训练计划更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- A型产气荚膜梭菌青海分离株tetA(P)耐药基因序列分析及蛋白结构预测被引量:2
- 2015年
- 应用PCR技术对A型产气荚膜梭菌青海分离株的tetA(P)耐药基因进行扩增、测序,利用生物软件对tetA(P)基因进行序列分析与蛋白结构预测。结果表明,A型产气荚膜梭菌青海分离株的tetA(P)基因长度为1 263bp,编码420个氨基酸。与参考菌株EHE-NE18、Wakayama、CW92的核苷酸序列同源性依次为100%、99.8%和98.7%,氨基酸序列同源性依次为100%、100%和98.3%。分离株TetA(P)蛋白疏水性较强,具有10个跨膜区,含有4个N-糖基化位点,1个cAMP和cGMP依赖性蛋白激酶磷酸化位点,5个蛋白激酶C磷酸化位点,1个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,1个酪氨酸激酶磷酸化位点,12个N-豆寇酰化位点,三级结构主要是由α-螺旋和无规则卷曲形成。研究结果可为A型产气荚膜梭菌tetA(P)基因功能研究提供依据。
- 冶贵生马玉花张爽张晓芬韩志辉邹勇贾跃宁
- 关键词:A型产气荚膜梭菌蛋白结构
- 猪蛔虫GST蛋白编码基因克隆及序列分析
- 2017年
- 为预测并分析猪蛔虫(Ascaris suum)谷胱甘肽S-转移酶(glutathione S-transferase,GST)蛋白编码基因的结构特征及其B细胞抗原表位,采用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增猪蛔虫GST蛋白编码序列(coding sequence,CDS),将纯化的DNA与pMD19-T载体连接并转化入JM109感受态细胞,并将阳性菌液测序后进行序列分析、结构预测和抗原表位预测。结果表明,获得的猪蛔虫GST蛋白CDS序列与参考基因(Y10613.1)相比,在第243和248位核苷酸处发生变异,并导致第83位氨基酸由甲硫氨酸(Met)变异为苏氨酸(Thr);其优势B细胞抗原表位可能位于肽段29-38、43-47、80-87、114-120、129-131、143-145、190-194、201-204区域内或附近,其中最可能位于肽段43-46和201-204区域内或附近。研究结果为猪蛔虫基因工程疫苗的研发奠定了理论基础,同时为后续猪蛔虫GST基因功能和耐药相关性研究提供了基础资料。
- 吴飞边青青王丹邹勇胡雄峰任世斌芮聪李坤杨莹林青
- 关键词:猪蛔虫GST基因克隆
- A型产气荚膜梭菌四环素耐药基因的PCR检测被引量:2
- 2015年
- 为了检测A型产气荚膜梭菌四环素耐药基因,试验采用Oligo 6.0软件设计tet A(P)、tet B(P)四环素耐药基因的特异性引物,片段大小分别为1 263 bp和1 959 bp,提取A型产气荚膜梭菌质粒DNA,配制PCR反应体系,设置PCR反应条件,用PCR扩增产物进行1%琼脂糖凝胶电泳。结果表明:特异性引物能有效扩增A型产气荚膜梭菌tet A(P)和tet B(P)基因,目的基因大小与预期片段相符。
- 冶贵生张爽张晓芬贾跃宁邹勇
- 关键词:A型产气荚膜梭菌四环素耐药基因PCR
- 餐厨废水中A型产气荚膜梭菌的分离与鉴定
- 2014年
- 为了对餐厨废水中的产气荚膜梭菌进行鉴定,试验采用TSC培养基进行厌氧培养、显微镜检等常规方法进行分离,并提取细菌基因组,设计、合成产气荚膜梭菌α、β、ε与ι毒素基因引物,配制PCR反应体系并设置反应条件,对扩增产物进行电泳检测。结果表明:分离菌在TSC培养基上产生黑色菌落,经琼脂糖凝胶电泳只有α毒素基因得到良好扩增。说明此次分离菌为A型产气荚膜梭菌。
- 冶贵生邹勇
- 关键词:A型产气荚膜梭菌
- A型产气荚膜梭菌tetB(P)耐药基因核苷酸序列与蛋白结构分析被引量:1
- 2015年
- 为了对产气荚膜梭菌tetB(P)耐药基因进行分析,通过生物软件设计引物,扩增A型产气荚膜梭菌tetB(P)耐药基因,测序后对tetB(P)基因核苷酸序列与蛋白结构进行分析.结果表明:分离株tetB(P)基因长度为1 959bp,编码652个氨基酸.与参考菌株CW92、EHE-NE18的核苷酸序列同源性依次为99.7%、99.9%,氨基酸序列同源性依次为99.4%、99.8%.分离株tetB(P)蛋白亲水性氨基酸较多,无跨膜区,含有4个N-糖基化位点,1个cAMP和cGMP依赖性蛋白激酶磷酸化位点,9个蛋白激酶C磷酸化位点,12个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,7个N-豆寇酰化位点,1个ATP/GTP结合位点基序,1个翻译型鸟苷酸结合域,三级结构主要是由α-螺旋、β折叠和无规则卷曲形成.
- 冶贵生马玉花张爽梅成和张晓芬韩志辉贾跃宁邹勇
- 关键词:A型产气荚膜梭菌蛋白结构
- A型产气荚膜梭菌青海分离株α毒素基因分析及其蛋白结构与抗原表位预测被引量:2
- 2014年
- 应用PCR技术对A型产气荚膜梭菌青海分离株的α毒素基因进行扩增,并进行测序,利用生物软件对α毒素基因序列进行分析,对蛋白结构、B细胞抗原表位进行预测。结果表明,A型产气荚膜梭菌青海分离株的α毒素基因长度为1 110bp,编码370个氨基酸。与参考菌株T0、S16、NRRLB-23744、KZ211和CER89L1216的α毒素基因核苷酸序列同源性依次为99.9%、99.9%、99.9%、99.9%和99.7%,氨基酸序列同源性均为100%。综合α毒素蛋白亲水性、表面可能性、抗原指数及二级结构预测结果显示在26-29、71-78、111-114、182-185、189-192、264-268、272-275、282-285、294-297、362-365位氨基酸残基存在可能的B细胞抗原表位,结合三级结构预测结果显示,α毒素294位-297位氨基酸残基形成表位并结合抗体的可能性较高。研究结果可为A型产气荚膜梭菌表位疫苗的设计与研制提供基础。
- 冶贵生马玉花韩志辉邹勇贾跃宁
- 关键词:A型产气荚膜梭菌Α毒素表位蛋白结构
- 西北部分地区猪蛔虫rDNAITS基因序列测定及遗传变异分析
- 2016年
- 为了摸清西北部分地区猪蛔虫内转录间隔区(ITS)的遗传变异特点,扩增了猪蛔虫ITS基因,进行测序,依据GenBank公布的ITS序列将测序结果截为ITS1、5.8S及ITS2三段,分析比对各段序列的差异性。结果显示,所有样品ITS序列长约1 000bp,其中ITS1、5.8S和ITS2的长度分别为450bp^453bp、159bp、272bp,种内差异分别为0~0.2%、0、0。基于ITS1的种系发育分析表明,23个猪蛔虫样品均位于同一分支,而与贝蛔属蛔虫分属两个不同分支。ITS1序列不能作为区分西北不同地区猪蛔虫的种内分子标记,但可以作为区分蛔属蛔虫与贝蛔属蛔虫的种间分子标记,研究结果为猪蛔虫的鉴定和分子流行病学调查提供了基础资料。
- 邹勇吴飞郭雅旭耿晓蕊张文慧王玉霞李希来林青
- 关键词:猪蛔虫核糖体DNA转录间隔区