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娄永锋
作品数:
1
被引量:1
H指数:1
供职机构:
四川大学化学工程学院
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发文基金:
国家自然科学基金
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相关领域:
理学
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合作作者
肖蓉
四川大学化学工程学院
杨明理
四川大学华西医院
向明礼
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1篇
2012
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新型多苯并咪唑环芳识别氨基酸甲酯的分子动力学和密度泛函研究
被引量:1
2012年
采用Gaussian 03在B3LYP/6-31G(d)水平上分别优化新型多苯并咪唑环芳(MBICP)受体和氨基酸甲酯(AAME)配体,再用基于模拟退火的分子动力学方法 CDOCKER将配体与受体对接,对每一个复合物获得了一组最低能量的初始构象。最后用Turbomole在BLYP/def-TZVP水平对初始构象进一步优化,并对收敛后的复合物最低能量构象作NBO分析。以密度泛函理论计算获得的相互作用能作为核心参数,采用组合策略建立了表达MBICP-AAME复合物结合常数的定量关系模型,计算了该类复合物的结合常数。对MBICP受体和AAME配体间的作用模式以及影响MBICP受体识别AAME配体的主要因素,作了深入讨论。
娄永锋
肖蓉
向明礼
杨明理
关键词:
分子动力学
密度泛函理论
分子识别
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