王美琴
- 作品数：3 被引量：9H指数：2
- 供职机构：首都医科大学生物医学工程学院更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划北京市教委科技计划面上项目更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 阿尔茨海默病的基因组学研究进展被引量：6
- 2015年
- 本文主要介绍遗传因素参与阿尔茨海默病(AD)发病机制的研究进展,阐述近年来国内外研究较多的与AD发病机制相关的易感基因,通过对易感位点的进一步研究,尤其是通过旁路分析可以更好地认识迟发性阿尔茨海默病(LOAD)的发生、进展,从而发现重要的枢纽基因,为临床预防、诊断和治疗提供靶点。由于遗传变异信息的分散性,需要借助详细的文献、网上搜索和一些生物信息学分析方法,归纳LOAD的致病基因和信号转导通路。本文以3个常用数据库为来源,采用多手段、多途径的分析和挖掘数据方法,充分利用已有AD数据资源,为AD基因学的进一步研究和临床治疗方面的应用提供理论依据。
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- 关键词：阿尔茨海默病通路数据库
- 基于数据整合策略挖掘阿尔茨海默病易感基因被引量：2
- 2015年
- 目的阐明阿尔茨海默病(AD)已知致病基因的作用与新发现的相关基因,对研究阿尔茨海默病的发病机理有非常重要的作用,为临床预防、诊断和治疗提供靶点。方法从网站数据库(OMIM、Alz Gene)搜集有关阿尔茨海默病的基因数据信息;运用多种致病基因预测工具(Endeavour、Gene Prospector、GLAD4U、Proph Net)进行生物分析,从而预测致病基因,并通过GENE、Pub Med数据库进行结果验证。结果从两个数据库中直接获取阿尔茨海默病致病基因,利用4种工具软件获取阿尔茨海默病相关基因(筛选出基因出现次数≥3的基因),将数据信息进行整合,得到一个含有25个基因的列表,这些基因包括CALHM1、ABCA7、A2M、CLU、SORL1、HFE、CD2AP、APP、ACE、PICALM、APOE、NOS3、MS4A6A、PLD3、CR1、ADAM10、MS4A4E、BLMH、PSEN1、CD33、PSEN2、MPO、APBB2、BIN1和PLAU。结论 CALHM1、ABCA7、A2M、CLU等基因与阿尔茨海默病有一定的相关性,为阿尔茨海默病基因学的进一步研究和临床治疗方面的应用提供理论依据。
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- 关键词：阿尔茨海默病数据库资源易感基因
- 基于数据融合算法的精神分裂症易感基因排序及其信号通路研究被引量：1
- 2015年
- 目的利用已有的研究结果,采用数据融合分析方法,对与已知的精神分裂症易感基因有密切关系的候选基因进行统计分析,得出基因排序及其信号通路的结果,以此证明数据融合算法能够有效筛选精神分裂症易感基因。方法根据已知的与精神分裂症相关的基因,利用Endeavour工具,通过数据融合算法将候选基因排序,并用DAVID数据库对基因排序结果进行功能注释和富集分析。结果利用数据融合算法获得的排序较高的基因与已有研究进行比较,证实排名第二的NRG3和排名第三的AKT1与精神分裂症有密切联系。其他排名较高的基因可以作为潜在的疾病易感基因,为精神分裂症的研究提供参考。结论数据融合算法能够准确评价候选基因与精神分裂症的联系,使用该方法能有效地对精神分裂症易感基因进行筛选和判定。
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- 关键词：数据融合算法基因排序
