胡星星
- 作品数：6 被引量：16H指数：2
- 供职机构：上海海洋大学海洋科学学院更多>>
- 发文基金：上海市教育发展基金会“曙光计划”项目教育部科学技术研究重点项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学天文地球更多>>
- 南极独角雪冰鱼(Chionodraco hamatus)miR-7132对红细胞发生的作用研究
- microRNA为短链非编码RNA,通过与靶基因3′UTR序列互补在转录后水平发挥作用。南极冰鱼是目前已知的唯一仅具有无功能性红细胞的脊椎动物。研究提示,独角雪冰鱼(Chionodraco hamatus)头肾中高表达的...
- 胡星星王丛丛产久林许强华
- 文献传递
- COⅠ和16S rRNA基因在高原裂腹鱼物种鉴定中的应用被引量：14
- 2015年
- 针对裂腹鱼种类繁多、种间形态学差异不明显的特点,利用分子标记对高原裂腹鱼进行准确的物种鉴定具有重要价值。对采集的60尾高原裂腹鱼进行了COⅠ和16S rRNA基因的部分序列测定,并通过Gen Bank数据库进行鱼种鉴定;运用邻接法(NJ)构建系统发育树,对实验鱼进行群系划分;通过DNASP软件分析比较实验鱼COⅠ和16S rRNA基因的序列变异;依据MEGA 6.0的Kimura-2-parameter模型计算实验鱼的种内遗传距离和种间遗传距离,并对COⅠ和16S rRNA基因在高原裂腹鱼物种鉴定中的适用性进行探讨。结果表明,采集的样本包含3属、5种裂腹鱼,分别为尖裸鲤属的尖裸鲤(Oxygymnocypris stewartii)、裸鲤属的软刺裸鲤(Gymnocypris dobula)、裂腹鱼属的拉萨裂腹鱼(Schizothorax waltoni)、巨须裂腹鱼(Schizothorax macropogon)和异齿裂腹鱼(Schizothorax oconnori)。在COⅠ基因构建的系统发育树中,5种高原裂腹鱼均形成独立的一支,而16S rRNA基因不能准确地对裂腹鱼属的3个鱼种实现区分。研究显示,5种高原裂腹鱼COⅠ基因核苷酸的变异水平(Pi)和单倍型多样性指数(Hd)均高于16S rRNA基因;COⅠ基因计算得到实验鱼种间遗传距离和种内遗传距离平均值分别为0.025和0.002,种内和种间的最大遗传差异约为13倍;16S rRNA基因得出结果为0.026和0.005,而种内和种间的最大遗传差异约为6倍。综合COⅠ和16S rRNA基因能有效鉴定高原裂腹鱼物种,而在单个基因的选择上,COⅠ基因具有更高的适用性。
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- 关键词：RRNA物种鉴定
- 独角雪冰鱼与贝氏肩孔南极鱼头肾小分子RNA组的比较研究
- Micro RNAs(mi RNAs)是在真核生物中的一类内源性的具有调控功能的非编码RNA,其大小长约20~25个核苷酸,mi RNA通过与靶基因序列结合对其产生翻译抑制或降解从而参与一系列重要的生物过程。在血细胞发生...
- 胡星星许强华
- 关键词：小分子RNA血红细胞
- 文献传递
- 斑马鱼对急性低氧的应答及转录组初步分析
- 低氧被定义为水体中溶解氧（dissolved oxygen,DO）含量小于2.0 mg/L的现象。低氧影响鱼类的生长和繁育,严重低氧会导致其死亡。本研究以正常氧浓度（6.7 mg/L DO）为对照,应用第二代高通量测序技...
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- 关键词：低氧斑马鱼高通量测序凋亡
- 文献传递
- 南极独角雪冰鱼(Chionodiraco hamatus)miR-7132对红细胞发生的作用研究
- microRNA为短链非编码RNA,通过与靶基因3'UTR序列互补在转录后水平发挥作用。南极冰鱼是目前已知的唯一仅具有无功能性红细胞的脊椎动物。研究提示,独角雪冰鱼(Chionodraco hamatus)头肾中高表达的...
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- 南极独角雪冰鱼(Chionodraco hamatus)miR-7132对红细胞发生的作用研究被引量：2
- 2016年
- micro RNA为短链非编码RNA,通过与靶基因3′UTR序列互补在转录后水平发挥作用。已有研究表明,micro RNA在红细胞发生过程中起着重要的调控作用。南极冰鱼是目前已知的唯一仅具有无功能性血红细胞的脊椎动物。前期研究提示,独角雪冰鱼(Chionodraco hamatus)头肾中高表达的micro RNAs可能抑制着冰鱼红血球的发生。本研究针对南极冰鱼头肾中高表达的miR-7132,运用斑马鱼显微注射、双荧光素酶报告系统,并结合靶基因预测等手段研究了miR-7132对血红细胞发生的作用机制。结果表明:斑马鱼胚胎注射miR-7132后,固蓝染色显示斑马鱼胚胎红细胞中血红蛋白的表达显著下降,这表明miR-7132的过表达抑制了血红细胞生成。通过转录组数据结合比对冰鱼的全基因组序列,获得了独角雪冰鱼血红细胞生成的血红素生物合成的限速酶(5′-aminolevulinate synthase 2,ALAS2)基因3′UTR序列。构建含ALAS2基因3′UTR序列的双荧光素酶报告质粒,并与miR-7132共转染293T细胞检测荧光素酶活性变化;构建包含绿色荧光蛋白(green fluorescent protein,GFP)的表达质粒与miR-7132共同注射斑马鱼胚胎,检测GFP荧光强度与蛋白表达量变化。结果显示,转染miR-7132的293T细胞荧光素酶相对活性显著降低,ALAS2基因是miR-7132的一个靶基因。斑马鱼体内注射miR-7132的GFP荧光强度显著降低,且GFP蛋白表达量显著减少。本研究揭示了miR-7132对血红细胞生成的抑制作用,miR-7132通过抑制ALAS2基因的表达而抑制南极冰鱼血红细胞的发生。
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