孙文婷
- 作品数:4 被引量:31H指数:4
- 供职机构:北京林业大学生物科学与技术学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金长江学者和创新团队发展计划北京市与中央在京高校共建项目更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- Distance在样线法和样点法鸟类调查中的结果差异研究被引量:9
- 2012年
- Distance作为动物种群密度调查方法,得到了越来越广泛的应用。2011年夏季,在大丰麋鹿国家级自然保护区进行了鸟类调查,对比了传统的固定距离样线法、固定半径样点法与Distance计算结果的差异。通过对样点法和样线法在鸟类多样性、有效半径、鸟的密度等方面的比较可知,样线法能得到较多的鸟种,同时在调查鸟类密度方面也很实用。样线法与样点法调查的鸟类体长相近。另外,固定距离样线法与固定半径样点法距离/半径的选取可以以鸟的体型作为参考因素,体型越大的鸟半径的取值可随之增大。
- 孙文婷赵思琪马莉丽刘垚李忠秋
- 关键词:样线法
- 刺槐EST-SSR标记PCR反应体系的优化被引量:6
- 2014年
- 为建立一套适用于刺槐EST-SSR标记的PCR反应体系,采用L16(45)正交试验设计结合单因素试验,对刺槐EST-SSR PCR反应体系中的5个主要因素:引物、DNA模板、dNTPs、Mg2+和Taq DNA聚合酶进行优化试验。结果表明:在20μL反应体系中,各反应因素的最佳水平为0.5μmol/L引物、30 ng模板DNA、0.15 mmol/L dNTP、0.5 mmol/L Mg2+、1.0 UTaq DNA聚合酶。利用随机挑选的3个刺槐优良无性系品种和7对EST-SSR引物对优化体系进行验证,结果均能获得稳定、清晰的条带,证明该体系稳定可靠。此优化体系的建立为刺槐EST-SSR标记的开发以及利用EST-SSR标记深入研究和利用中国刺槐种质资源奠定基础。
- 赵克奇董黎王少明孙宇涵孙文婷袁存权荀守华张江涛王玉玲李云
- 关键词:刺槐EST-SSRPCR反应体系
- 北京市华北落叶松优树群体遗传多样性分析被引量:10
- 2016年
- 利用SSR分子标记对北京市华北落叶松人工林5个群体的220棵优树进行遗传多样性和群体结构分析。20对SSR引物共检测到81个等位基因,每个位点等位基因数2~8个不等,平均4.05个。群体观测和期望杂合度平均值分别为0.429和0.440,Shannon信息指数和多态性信息含量分别为0.756和0.380。5个群体中,百花山和云蒙山遗传多样性水平最高,雾灵山遗传多样性水平最低。AMOVA分析结果显示,2.65%的遗传变异来自于群体间,剩余97.35%的遗传变异来自于群体内。遗传分化系数仅为0.023,表明北京市华北落叶松优树群体遗传分化程度很低。基于Nei's遗传距离可以将5个群体划分为3个类群,四海镇和雾灵山归为第Ⅰ类,松山归为第Ⅱ类,百花山和云蒙山归为第Ⅲ类。STRUCTURE群体结构分析结果与上述聚类分析结果大体一致。以上研究为华北落叶松人工林遗传多样性评价和优良种质资源收集、保护和利用提供理论依据。
- 董明亮高嘉玥孙文婷范英明袁定昌张金凤
- 关键词:华北落叶松SSR标记优树
- 华北落叶松种子园控制授粉子代遗传多样性分析被引量:6
- 2016年
- 以华北落叶松控制授粉群体的全部子代为材料,母本相同的个体视为同一家系,利用18对SSR分子标记对7个家系257个个体进行扩增,分析其遗传多样性及其遗传分化水平。结果表明:(1)18个SSR位点共检测到72个等位基因,平均等位基因数4个,有效等位基因数(Ne)为1.247~3.411。(2)7个家系的平均有效等位基因数为2.135个,观测杂合度(Ho)为0.518,期望杂合度(He)为0.502,Shannon信息指数0.846,其中55号家系遗传多样性水平最高,56号的遗传多样性水平最低。(3)遗传分化系数(GST)为0.113,各家系群体处于中等遗传分化水平,AMOVA分析结果显示82%的遗传变异存在于家系内,18%的遗传变异存在于家系间。(4)聚类分析结果表明,55号与59号家系的遗传距离最近,具有较近的亲缘关系,49号家系与其他家系的遗传距离最远。(5)结合遗传多样性及遗传分化水平结果,估算获得选择核心家系数及核心个体数,选择5个家系均可获得96%以上的遗传多样性,对于个体数较少的家系,选择15~20个个体;对于个体数较多的家系,选择35个个体,即可获得96%以上的遗传多样性。该研究结果对华北落叶松种子园育种群体的选择及其遗传多样性的保护具有重要意义。
- 孙文婷于大德董明亮赵健王小平张鸿景张金凤
- 关键词:华北落叶松家系SSR分子标记