张丽娜
- 作品数：2 被引量：0H指数：0
- 供职机构：福建农林大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：福建省科技计划项目国家自然科学基金福建省自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 植物线粒体和质体双定位蛋白质的带电特性分析
- 2016年
- 蛋白质亚细胞定位分析是揭示蛋白质功能的关键步骤。1个蛋白质分子能被定位到2个亚细胞位置,这一现象被称为蛋白质的"双定位"。本研究首先从Uniprot、MitoP2、MGI、TAIR、DBMLoc等蛋白质数据库及已发表文献中收集双定位于线粒体与质体的植物蛋白质数据,共获得703个双定位蛋白质,组成测试数据集。再从Uniprot数据库中选取唯一定位于线粒体的829个和唯一定位于质体的6 376个植物蛋白质,组成参照数据集,分析双定位于线粒体与质体的植物蛋白质的带电特征。结果表明,与单定位于线粒体或质体的植物蛋白质相比,双定位线粒体与质体的植物蛋白质具有更低的净电荷量;此外,双定位蛋白质电荷分布较为集中对称,线粒体蛋白质次之,质体蛋白质最为分散。本文研究结果将为揭示植物蛋白质双定位的分子机制奠定理论基础。
- 林授锴傅晓菲黄健陶欢徐超群刘伟张丽娜艾育芳何华勤
- 关键词：植物线粒体质体
- 基于叶绿体基因组重建中国野生葡萄的系统发育关系
- 2022年
- 野生葡萄类群有一半以上分布在中国.学者们基于形态特征和核基因组对其系统发育关系进行了研究,但结果存在比较大的冲突,类群间的亲缘关系仍未明确.为探究基于叶绿体基因组重建的中国野生葡萄的系统发育关系与前人基于形态特征或核基因组的研究结果是否一致,本研究从已公布的重测序数据中组装出26个中国野生葡萄的叶绿体基因组,并使用联合分析和溯祖理论重建了这26个类群的系统发育关系.联合分析的结果将中国野生葡萄分成了3个分支,这与前人的研究结果也存在较大冲突;而基于溯祖理论的分析没有得到较高分辨率的系统发育关系,这可能是由于单个基因的系统发育信息比较低,限制了该理论的应用.另外,相对于编码区和非编码区数据,叶绿体全基因组数据对中国野生葡萄系统发育关系的解析能力较好.
- 张丽娜何华勤田甜王亚男吴题郑英杰
- 关键词：叶绿体基因组系统发育葡萄属
