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张立奎: 作品数：12 被引量：14H指数：2; 供职机构：扬州大学环境科学与工程学院更多>>; 发文基金：江苏省自然科学基金国家自然科学基金江苏省教育厅自然科学基金更多>>; 相关领域：生物学天文地球文化科学轻工技术与工程更多>>

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极端嗜热古菌尿嘧啶DNA糖苷酶的研究进展: 2020年; 高温会加快碱基脱氨基反应形成损伤碱基的速率,进一步对脱氨基的碱基进行复制会导致突变。因此,极端嗜热古菌基因组的稳定性面临着其生存高温环境的挑战。胞嘧啶脱氨基形成尿嘧啶,是常见的脱碱基类型,复制DNA中尿嘧啶会造成GC→AT的突变。尿嘧啶DNA糖苷酶(Uracil DNA glycosylase,UDG)是修复DNA中尿嘧啶的关键酶。基于识别底物的特异性,UDG分为6个家族,广泛分布在细菌、古菌、真核生物以及一些病毒中。基因组序列显示,极端嗜热古菌至少编码一种UDG。目前,对于细菌和真核生物的UDG已进行了大量的研究,但是关于极端嗜热古菌UDG的研究相对较少,尚处于初期阶段。本文综述了极端嗜热古菌UDG的研究进展,并对今后的研究提出了展望。; 甘琪姜董豪张立奎; 关键词：极端嗜热古菌尿嘧啶DNA糖苷酶碱基切除修复

古菌RecJ蛋白的研究进展: 2023年; RecJ蛋白属于aspartate-histidine-histidine(DHH)磷酸酯酶超家族,存在于细菌、真核生物和古菌中。细菌RecJ蛋白是一种5′→3′ssDNA外切酶,参与错配修复、同源重组、碱基切除修复等生物学过程。真核生物cell division cycle 45(Cdc45)蛋白是细菌RecJ核酸酶的同源物,但不具有核酸酶活性。Cdc45蛋白能够与minichromosomemaintenance(MCM)和Go-Ichi-Ni-San(GINS)形成Cdc45-MCM-GINS(CMG)复合物,是真核生物DNA复制的重要组分。在古菌中,几乎所有基因组已测序的古菌均编码一种或多种RecJ蛋白同源物。与细菌RecJ核酸酶不同,古菌RecJ蛋白具有多样化的核酸酶活性,并且能够与MCM和GINS形成类似于真核生物CMG的复合物。因此,古菌RecJ蛋白是参与古菌DNA复制、修复和重组的重要成分。基于目前古菌RecJ蛋白的研究报道,本文综述了古菌RecJ蛋白的活性、结构与功能方面的研究进展,聚焦于不同古菌RecJ蛋白以及它们与细菌RecJ核酸酶和真核生物RecJ同源物的异同点,并对古菌RecJ蛋白未来的研究方向进行了展望。; 施静茹张立奎; 关键词：古菌 DNA修复 DNA复制

极端嗜热古菌DNA修复核酸内切酶的研究进展被引量：2: 2019年; 极端嗜热古菌由于生活在高温环境,其基因组DNA面临着严重的挑战,因此,它们如何维持其基因组稳定是本研究领域最为关注的科学问题之一。极端嗜热古菌具有与常温微生物相似的自发突变频率,暗示着它们比常温微生物具有更加有效的DNA修复体系进行修复高温所造成的基因组DNA损伤。目前,极端嗜热古菌DNA修复的分子机制尚不清楚。核酸内切酶在DNA修复途径中发挥着重要的作用。基因组序列显示极端嗜热古菌编码多种DNA修复核酸内切酶,但是其研究尚处于初期阶段。本文综述了极端嗜热古菌DNA修复核酸内切酶Nuc S、Endo V、Endo Q、XPF和Hjc的研究进展,并对今后的研究提出了展望。; 李玉婷史昊强张立奎; 关键词：极端嗜热古菌核酸内切酶 DNA修复

一株抗硅藻附着的海绵附生菌的鉴定及发酵条件优化: 2016年; 为了从海绵共附生微生物中寻找天然高效抗污损活性物质,本文针对前期研究获取的4株具有显著抗硅藻附着的活性菌株进行活性验证和比较,选出其中最优菌株进行菌种鉴定及发酵条件优化.比较了活性菌株对小新月菱形藻(Nitzschia closterium)、咖啡双眉藻(Amphora coffeaeformis)、碎片菱形藻(Nitzschia frustulum)附着的抑制活性,确定菌株UST050418-715为最优菌株;通过16S r DNA的测序分析,结合平板的菌落形态和扫描电镜下菌体特征,鉴定活性菌株UST050418-715为短小芽孢杆菌(Bacillus pumilus).为优化该菌株的培养条件,选择了酵母粉、蛋白胨、Na Cl、p H值进行四因素三水平的正交实验,对菌株培养条件进行优化.发现选择的4个因素对应的菌株发酵产物对硅藻附着的抑制活性大小不同,影响显著性顺序是酵母粉>蛋白胨>Na Cl>p H值,综合菌株发酵产物活性、粗提物产量和菌株生长情况进行分析,确定菌株UST050418-715基于海洋2216E培养基的最佳发酵条件为:蛋白胨含量7.5 g/dm3,酵母粉含量3 g/dm3,Na Cl含量10.45 g/dm3,p H值9.5.; 刘书宇俞思羽夏翊腾靳翠丽张立奎周晓见; 关键词：海洋生物学海绵共附生微生物菌株鉴定发酵条件优化正交试验

极端嗜热古菌核酸内切酶Ⅲ的研究进展: 2022年; 胸腺嘧啶乙二醇(thymine glycol,Tg)是常见的氧化性DNA损伤碱基之一。DNA中的Tg能够分别阻止DNA聚合酶和RNA聚合酶进行DNA复制和转录,导致相应的生物学过程终止,进而会引起细胞的死亡,因此DNA中的Tg需要被修复。核酸内切酶Ⅲ(endonucleaseⅢ,EndoⅢ)是一种双功能DNA糖苷酶,能够切除DNA中的Tg,从而启动碱基切除修复途径进行修复DNA中的Tg。细菌、古菌和真核生物的基因组序列中均存在有EndoⅢ蛋白的编码基因。目前,源自于细菌和真核生物的EndoⅢ已有较多的研究,而古菌EndoⅢ的研究相对较少。基于目前已有的极端嗜热古菌EndoⅢ的研究报道,本文综述了极端嗜热古菌EndoⅢ的研究进展,并展望了今后的研究方向。; 汤承轩李祎禧张立奎; 关键词：极端嗜热古菌碱基切除修复

极端嗜热古菌8oxoG DNA糖苷酶的研究进展: 2021年; 7,8二氢-8-氧鸟嘌呤(7,8-dihydro-8-oxoguanine,8oxoG)是一种常见的DNA损伤碱基。由于8oxoG能够与腺嘌呤配对,在DNA中的8oxoG被修复之前进行复制,DNA将会产生GC→TA的突变,从而造成基因组的不稳定。目前,碱基切除修复(Base excision repair,BER)是修复DNA中8oxoG的经典途径,其中8oxoGDNA糖苷酶(8-oxoguanineDNAglycosylases,OGG)是启动BER途径的关键酶。研究发现,OGG能够识别和切除DNA中的8oxoG,从而阻止细胞内GC→TA突变的积累。目前,OGG分为3个家族:OGG1、OGG2和AGOG (archaeal 8oxoG DNA glycosylase),广泛分布于细菌、古菌和真核生物。古菌基因组的序列表明,它们至少编码一种OGG。目前,对源自细菌和真核生物的OGG已进行了大量的研究,但是关于极端嗜热古菌OGG的研究相对较少,尚处于初期阶段。本文综述了极端嗜热古菌OGG的研究进展,并对今后的研究提出了展望。; 吴颖陈鸿迅张立奎; 关键词：极端嗜热古菌碱基切除修复

关于“极端环境下的微生物”知识点的教学体会: 2020年; 极端环境下的微生物是微生物学课程中微生物的生态这一章的重要组成部分,尤其是环境类专业本科生必须掌握的重要知识点。极端微生物不仅在基础理论研究方面具有重要的科学意义,而且在实际中具有巨大的应用前景。为了提高环境微生物学中“极端环境下的微生物”教学单元的教学效果,本文采取问题导向教学方法,向学生梳理极端微生物的种类、分布、适应机制、活性物质及其在生态系统中的功能和在环境保护方面的作用。本文总结了“极端环境下的微生物”知识点的教学体会,以便在今后的教学过程中能够使学生较好地理解和掌握极端微生物,培养学生将来从事极端微生物相关研究的兴趣、素质和能力。; 张立奎董昆明缪莉涂传灯; 关键词：极端微生物问题导向教学生物地球化学作用生物活性物质

几种海洋抗污损化合物的单一与联合毒性效应评价被引量：2: 2017年; 本文研究了目前广泛应用的防污涂料毒性添加剂3-(3,4-dichlorophenyl)-1,1-dimethylurea(Diuron)、2-methylthio-4-t-butylamino-6-cyclopropylamino-s-triazine(Irgarol 1051)、triphenylborane pyridine(TPBP)、Zinc pyrithione(Zn-Pt)、Zinc bis(dimethyl thiocarbamate,Ziram)、Cu^(2+)的单一毒性和二元混合毒性.结果表明:对卤虫而言,6种化合物单一毒性按强弱排序为TPBP>Diuron>Ziram>CuSO_4>Irgarol 1051>Zn-Pt,它们对卤虫48 h的LC50分别为CuSO_49.1μg/cm^3、Diuron 8.0μg/cm^3、Irgarol 1051 12.0μg/cm^3、TPBP 0.07μg/cm^3、Zn-Pt 30.9μg/cm^3、Ziram 8.2μg/cm^3.对卤虫的二元联合毒性实验采用混合毒性指数法(MTI)评价,结果显示:共有8个组合具有协同效应,包括Irgarol 1051/Diuron、Irgarol 1051/TPBP、Irgarol 1051/Ziram、Irgarol 1051/Zn-Pt、Irgarol 1051/CuSO4、Diuron/TPBP、Ziram/CuSO_4以及Zn-Pt/CuSO_4.其中Irgarol 1051/Ziram组合的MTI值高达2.740,Zn-Pt/CuSO_4组合更高达5.621.发现8个协同效应组合中有5个和Irgarol 1051有关,表明Irgarol 1051在基于毒性的防污涂料配方中有其良好的适应性,但进入海洋环境的Irgarol 1051具有引起较强生物毒性的环境风险.另有5个组合Diuron/Zn-Pt、Diuron/CuSO_4、TPBP/Ziram、TPBP/ZnPt、Ziram/Zn-Pt表现为一定程度拮抗作用,应在防污涂料配制中尽量避免同时使用.; 靳翠丽许明景胡波朱鸿辰张立奎周晓见; 关键词：海洋生物学卤虫

高等学校开设《海洋科学导论》公选课的必要性和教学初探被引量：4: 2015年; 高等学校的学生对海洋科学的知识相当匮乏,这和我国建设海洋强国的背景极不相符,因此在高等学校开设全校性公选课《海洋科学导论》适应我国现阶段经济及社会发展的需要。本文从《海洋科学导论》课程教学的必要性、紧迫性、可能性开始,进而讨论了该课程教学内容和教学体系编排以及创新性,最后讨论了我校在将此课程作为学院公选课进行教学的探索及经验总结。; 缪莉董昆明周晓见靳翠丽张立奎; 关键词：教学

海洋生物基因工程学教学的探索与实践被引量：1: 2013年; 海洋生物基因工程是扬州大学新增设的海洋生物资源与环境专业的重要课程之一。鉴于目前还没有海洋生物基因工程的课程教材,如何讲授这门课程是值得探讨的教学课题。本文主要围绕开设海洋生物基因工程课程的重要性、课堂教学的内容、方法及实验教学的设置等三个方面对如何上好该门课程进行探索。; 张立奎周晓见王宏归封克; 关键词：海洋生物基因工程课堂教学

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