- 红麻线粒体基因NAD3和COB的RNA编辑与表达分析被引量:2
- 2016年
- 以红麻细胞质线粒体近等基因系UG93A(不育系)、UG93B(保持系)及UG93A×福红992(恢复系)的F1代为材料,研究花药线粒体基因NAD3和COB的转录与表达。结果发现,在3种供试材料中,基因NAD3的CDS区在DNA水平和RNA编辑水平上均无差异;不育系与保持系的COB基因DNA编码序列无差异,但在RNA水平上发生了编辑,8个位点的编辑均发生于密码子的第一或第二位碱基,且导致氨基酸种类变化,主要为亲水性氨基酸转变为疏水性氨基酸;COB基因在UG93A中的RNA编辑频率低于UG93B;NAD3和COB基因在3种材料中的转录本大小基本相同,但在表达水平上表现为不育系显著低于保持系和F1代。由此推测NAD3和COB基因在红麻花药发育过程中有着重要的作用。
- 刁勇廖小芳郑杰孔祥军陈鹏赵艳红周瑞阳
- 关键词:红麻RNA编辑COB
- 从红麻花药和花瓣中提取高质量总RNA的方法
- 2015年
- 红麻(Hibiscus cannabinus L.)花药和花瓣因含有较多的多糖、酚类等物质而较难提取高质量的RNA,本研究探索一种适用于红麻花药和花瓣高质量总RNA的方法以进行c DNA文库构建等后续试验。通过借鉴植物DNA的CTAB提取法,结合RNA的理化性质,在提取液中加入6%的β-巯基乙醇,并在开始裂解时加入1/10体积的5 mol·L-1 KAc和1/10体积的无水乙醇对去除多糖特别有效。结果显示,利用该方法得到的RNA质量高,条带清晰完整,检测OD260/280在1.8~2.1之间,OD260/230在2.0~2.6之间,产量为花药987.3 ng·μL-1,花瓣752.1 ng·μL-1。该方法提取的总RNA可直接用于m RNA纯化,c DNA文库构建及RTPCR等后续分子试验。
- 周瑶瑶陈春妍陈鹏刁勇周瑞阳
- 关键词:红麻花药花瓣RNA提取
- 红麻细胞质雄性不育系UG93A和保持系UG93B cox1的克隆和表达分析被引量:1
- 2016年
- 利用hiTAIL-PCR技术扩增红麻cox1全长及侧翼序列,结果表明,在红麻不育系UG93A和保持系UG93B中分别获得长度为2 149和3 244bp的序列,包含cox1基因CDS全长及其5′和3′部分侧翼序列,通过分析得出不育系和保持系中cox1的CDS序列长度为1 602bp,编码533个氨基酸残基,分子量为58.31ku。BLAST序列比对发现,UG93A和UG93Bcox1的CDS序列虽然存在4个碱基差异,但推导的氨基酸序列一样,并且UG93A和UG93Bcox1两端侧翼序列结果一致。RNA Blot分析显示cox1基因在红麻UG93A、UG93B和F1(UG93A/992)的转录本大小基本相同,推测cox1基因不是导致红麻CMS(cytoplasmic male sterility)的直接因子。qRT-PCR结果表明,UG93A中cox1的表达量显著低于UG93B和F1(UG93A/992),推测cox1在红麻花粉发育能量代谢过程中有着重要的作用。
- 廖小芳刁勇邱爱华赵艳红周步进陈鹏周瑞阳
- 关键词:红麻