余文英
- 作品数：5 被引量：14H指数：3
- 供职机构：福建农林大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家教育部博士点基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 禾谷镰刀菌Homeobox转录因子FgHtf1敲除突变体基因差异表达分析被引量：4
- 2015年
- 禾谷镰刀菌是引起小麦赤霉病的主要病原真菌。分生孢子在侵染过程中起关键作用。先前研究表明同源异型盒(Homeobox)转录因子FgHtf1特异调控分生孢子的产生。为明确其调控产孢的分子机制,本研究采用高通量RNA测序技术(RNA-Seq),对ΔFghtf1突变体菌株和野生型PH-1菌株进行测序,结果显示其中591个基因转录上调,549个基因下调。对这些基因进行功能预测并聚类分析发现:上下调基因中分别有约30%和22%参与新陈代谢和能量转运。运用荧光定量PCR,检测10个基因的表达,验证了RNA-Seq的结果是可靠的。运用同源重组方法敲除明显下调的基因FGSG_10565和FGSG_07629,表型分析结果显示,相比野生型,ΔFGSG_10565和ΔFGSG_07629的生长速率和产孢量均不变,说明两个基因的表达受FgHtf1调控,但功能上不直接参与分生孢子的形成。
- 张红红郑文辉骆琼乔向威陈阿海余文英王宗华
- 关键词：禾谷镰刀菌产孢同源异型盒基因
- 稻瘟病菌中一个假定Rho GTP酶激活蛋白与Rho族蛋白的互作关系被引量：1
- 2013年
- Rho族蛋白是重要的分子开关,受GTP酶激活蛋白(GAP)调控。MGG_09303在稻瘟病菌中编码一个假定的Rho GTP酶激活蛋白。为探讨其与Rho族蛋白的互作关系,本文首先将基因MGG_09303与酵母中RhoGAPs蛋白序列进行多重比对,结果表明MGG_09303与酿酒酵母中的RhoGAP蛋白的氨基酸同源性较高的有BEM3(29%)、BEM2(28%)、LRG1(27%),而相似性较高的有RGD2(53%)、LRG1(52%),还发现MGG_09303与酿酒酵母中的RhoGAP具有共同的保守的精氨酸。据此初步预测它有可能与Rho1和Rho3存在互作,本研究构建了pGADT7-MGG_09303捕获表达载体,利用酵母双杂交技术将捕获载体pGADT7-MGG_09303分别与Rho族蛋白持续激活态(CA)和失活态(DN)诱饵载体共转AH109酵母细胞,进行双杂交实验。结果表明,MGG_09303蛋白与Rho1和Rho3的持续激活态(CA)互作,而不与其负显性失活态(DN)互作,研究结果验证了预测的结果,为进一步研究RhoGAP蛋白对Rho族蛋白负调控的分子机制奠定了重要的基础。
- 叶文雨陈四妙陈晓林艺娟汪洋余文英鲁国东陈继圣王宗华
- 关键词：稻瘟病菌酿酒酵母RHOGAP酵母双杂交
- RhoGAP结构域家族蛋白的研究进展被引量：3
- 2017年
- 真核生物中RhoGTP酶激活蛋白(RhoGTPase activating proteins,RhoGAPs)编码一大类具有RhoGAP活性的基因家族,作为分子开关,可以极大地提高Rho族蛋白内在的RhoGTPase活性。本综述主要就RhoGAP家族蛋白的结构、调控机制及其功能多样性进行了简述,目的在于阐明RhoGAP与RhoGTP酶信号传导途径的内在联系,为深入研究RhoGAP蛋白的调控机理及其功能提供一定的参考和理论依据。
- 叶文雨余文英鲁国东
- 稻瘟病菌RhoGAP基因表达特征及其生物信息学分析被引量：4
- 2013年
- Rho GAPs(GTPase activating proteins)是真核生物中Rho GTP酶的负调控因子之一,通过激活Rho GTP结合蛋白内在的GTP酶活性,使其加速水解成结合GDP的失活态。全基因组分析指出稻瘟病菌有8个Rho GAP成员(MoRhoGAP),但是其功能不清。本研究利用在线工具分析了其蛋白MoRhoGAP蛋白结构域及其定点突变后的三级结构,以及MoRhoGAP的互作蛋白网络,构建了系统发育树;利用基因芯片和公共数据库分析了在稻瘟病菌不同发育和侵染阶段Rho GAP的基因表达情况,为进一步研究稻瘟病菌RhoGAP的功能提供了理论依据。
- 叶文雨胡芳辉连璧陈晓余文英鲁国东陈继圣王宗华
- 关键词：生物信息学基因表达稻瘟病菌
- 基因表达分析稻瘟病菌中8个假定RhoGAP蛋白与几丁质合酶的关系被引量：3
- 2016年
- 通过分析稻瘟病菌Rho GAP家族基因与几丁质合酶家族基因的表达关系,研究该家族基因对细胞壁形成的影响。利用不同生物信息学软件对Rho GAP家族进行序列分析,运用RT-PCR技术获得了该家族基因的部分c DNA序列,通过实时荧光定量技术分析Rho GAP基因与几丁质合酶基因的表达关系。结果表明,稻瘟病菌数据库中8个Rho GAP基因均含有保守的GAP结构域,且为水溶性蛋白,蛋白分子量相对较大,系统进化分析结果显示,16个Rho GTP酶激活蛋白可分为两类;不同的几丁质合成酶基因在不同Rho GAP基因突变体中的表达量不同,总的趋势是上调的。说明Rho GAP基因家族蛋白可能参与了稻瘟病菌不同阶段细胞壁的合成,本结果为进一步研究Rho GAP家族基因参与多样性的代谢途径奠定了基础。
- 叶文雨豆献英陈美莲牛晓庆杨雪余文英鲁国东
- 关键词：稻瘟病菌RHOGAP生物信息学
