芮蕊
- 作品数：6 被引量：20H指数：3
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- 发文基金：云南省重点学科资助项目国家自然科学基金博士科研启动基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 筇竹钾离子通道QtSKOR1基因的克隆及表达分析
- 2024年
- 【目的】外向整流型钾离子通道SKOR(Stelar K+outward rectifier)家族是参与植物钾离子转运和分配的重要通道,且K+在植物生理过程和响应非生物胁迫中有决定性作用。旨在研究外向整流型钾离子通道SKOR在富含钾元素的筇竹(Qiongzhuea tumidinoda)发育及受到盐胁迫过程中的功能。【方法】利用RACE技术从筇竹的幼苗中获得SKOR基因并命名为QtSKOR1(基因号:MT078984),并对其进行生物信息分析及表达特征分析。【结果】QtSKOR1基因开放阅读框(1923 bp)编码了641个氨基酸。QtSKOR1蛋白存在环核苷酸(cNMP)和锚蛋白重复结构域(ANK)属于Shake亚家族,其相对分子质量为157.27 kD,理论等电点为4.94,含有3个跨膜区但不存在信号肽,属于疏水性蛋白。亚细胞定位分析表明QtSKOR1蛋白主要定位于线粒体(30.4%)和细胞质(26.1%)中。同源分析和进化分析显示,QtSKOR1与二穗短柄草(Brachypodium distachyum)和玉米(Zea mays)的同源性较高,分别为89.06%和87.91%。qPCR结果显示,QtSKOR1基因在筇竹所有组织中均有表达,且表达量从高到低依次为叶、根、茎、笋。与对照相比,随着钾胁迫时间的增加,QtSKOR1的表达量在根中显著增加,而在茎叶中显著降低。随着钠胁迫时间的增加,QtSKOR1的表达量在根茎叶中均呈下降趋势。【结论】QtSKOR1基因属于Shake亚家族,均参与了筇竹各个组织特别是叶的钾运输。同时,在钾胁迫下QtSKOR1基因在根中发挥了积极作用。
- 陈叶丹赵小艳黑晶莹王澍芮蕊
- 关键词：筇竹基因克隆
- 筇竹Na+/H+逆向转运蛋白基因克隆与表达分析被引量：3
- 2021年
- 为明确液泡型Na+/H+逆向转运蛋白在竹类植物耐盐中发挥的重要作用。本研究从筇竹中克隆出液泡膜Na+/H+逆向转运蛋白基因,命名为QtNHX1(基因登录号:MT078987),并分析该基因表达特征。结果表明,QtNHX1基因全长为2075 bp,包含1632 bp的开放阅读框(编码544个氨基酸),其相对分子量为59.43 kD,理论等电点(pI)为8.83。QtNHX1具有10个跨膜区域,且与水稻同源性最高,达到90.59%。另外,QtNHX1基因在在筇竹不同组织器官(竹笋,根,茎,叶)均有表达,说明QtNHX1为组成型表达。筇竹根中QtNHX1基因的表达量最高,在竹笋表达量最低。对筇竹进行不同时间(6,12,24 h)的NaCl胁迫处理,发现QtNHX1基因的表达量随着处理时间的延长而上升,表明QtNHX1基因在调控筇竹耐盐性中发挥着重要作用。
- 李玥肖如雪芮蕊王澍
- 关键词：克隆
- 不同无土栽培基质微生物DNA提取方法研究被引量：2
- 2012年
- 用4种DNA提取方法对3种栽培基质中微生物的DNA浓度、腐殖酸去除率、16S rDNA的PCR扩增、扩增片段限制性内切酶和变性梯度凝胶电泳结果进行比较。结果表明:采用含CaCO3的缓冲液预洗,用CTAB缓冲液和蛋白质酶K共同作用以裂解细胞,同时添加2%CaCl2可有效去除腐殖酸;用PEG 8000沉淀DNA和Sephadex G-200纯化,可提高DNA质量;所得DNA适用于PCR扩增及ARDRA技术的限制酶切分析;在DGGE分析中此方法更能显示微生物种群的多样性。
- 王澍芮蕊蔡婷邵云剑樊国盛
- 关键词：基质PCR扩增变性梯度凝胶电泳
- 不同氮肥对番茄根际土壤真菌多样性的影响被引量：5
- 2012年
- 真菌是土壤生物量的重要组成部分,在农业生态系统中起着重要的作用。利用18S rDNA的PCR-DGGE图谱分析,对不同氮素形态(NO3-、NH4+、Gly)下土壤中真菌群落的多样性进行比较。结果表明,施用不同形态有机氮肥的土壤真菌多样性从高到低排序为,施Gly>施NH4Cl>施KNO3>未施肥的土壤。聚类分析显示,所测序的真菌大部分属于子囊菌纲(Ascomycota),占真菌总数的28.125%,其次为担子菌纲(Basidiomycota),占真菌总数的21.875%。研究结果为番茄生产中施用不同形态的氮肥提供理论依据。
- 王澍芮蕊樊国盛林开文
- 关键词：番茄真菌多样性氮肥变性梯度凝胶电泳
- 中华大节竹K^+通道蛋白β亚基的克隆及序列分析被引量：1
- 2012年
- 用RACE法从中华大节竹幼苗中克隆了K+通道蛋白β亚基,命名为KIB1(基因登录号:JX900132)。序列分析表明,该基因全长1 211 bp,开放读码框为987 bp,编码329个氨基酸多肽。经氨基酸同源性和聚类分析证实,KIB1与拟南芥(KAB1)和水稻(KOB1)钾离子通道蛋白的序列同源性较高,其同源性分别为85.06%和82.32%。亚细胞定位结果表明,该蛋白主要存在于线粒体中(86.1%)。
- 王澍芮蕊陈戈岩纪微樊国盛
- 关键词：克隆
- 不同基质对玛咖种子发芽及幼苗生长的影响被引量：9
- 2017年
- 以黑色玛咖和黄色玛咖的种子为试材,分析比较了不同基质(腐殖土、进口基质、椰糠和河沙)对玛咖种子发芽和幼苗生长的影响。结果表明:不同基质处理对黄色和黑色玛咖发芽有显著的影响,均以腐殖土处理的基质效果最好,黄色和黑色玛咖的发芽率分别为90.33%和86.33%,发芽势分别为72.83%和64.50%,发芽指数分别为83.58%和80.21%,且均高于其它基质处理。同时,不同基质处理对玛咖株高影响很大,以腐殖土处理的玛咖株高最高,达到18.53mm(黄)和16.53mm(黑)。另外,不同基质处理下,黄色玛咖种子萌发的各项指标均大于黑色玛咖种子。
- 芮蕊朱玉婷杨自云王澍
- 关键词：玛咖基质发芽率
