张春城
- 作品数：2 被引量：1H指数：1
- 供职机构：北京工业大学生命科学与生物工程学院更多>>
- 发文基金：北京市自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：理学生物学更多>>
- 基于设计模板的BRD-like折叠类型综合分类方法
- 2016年
- 蛋白质折叠规律研究是生命科学重大前沿课题,折叠类型分类是蛋白质折叠研究的基础。构建BRD-like折叠类型模板数据库,建立了基于多模板的综合分类方法,并用于该折叠类型的分类。对实验集的12 117个样本进行检验,结果的敏感性、特异性分别为0.923和0.997,MCC值为0.72;对独立检验集2 260个样本的检验,结果发现:敏感性、特异性分别为0.941和0.998,MCC值为0.86.结果表明:基于多模板的综合分类方法可用于蛋白质折叠类型分类。
- 张春城李晓琴
- Bromodomain-like折叠类型模板的设计被引量：1
- 2016年
- 针对折叠类型分类中所选天然模板普适性不足的问题,提出了Bromodomain-like折叠类型模板的设计方法.选SCOPe Astral 2.03序列相似度小于40%并且分辨率高于0.25 nm的52个可用Bromodomain-like折叠样本,基于多结构比对结果及数据分析,建立了折叠类型家族模板的设计方法.利用系统聚类方法构建了家族模板的系统聚类图,提出了蛋白质折叠类型模板的设计方法,并用于该折叠类型的模板设计.结果表明:设计模板具有普适性,可用于蛋白质折叠类型分类.
- 李晓琴张春城
- 关键词：系统聚类
