王雪
- 作品数:5 被引量:23H指数:2
- 供职机构:中央民族大学生命与环境科学学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家大学生创新性实验计划更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 沙冬青属植物种系特异性miRNA的鉴定和功能预测
- 沙冬青属植物是我国温带荒漠区域罕见的常绿阔叶灌木,具有极高的逆境耐受能力,但其逆境耐受机制尚不清楚。作为一类内源调控性RNA分子,miRNA可能在沙冬青属植物的逆境耐受中发挥重要作用。另外,虽然很多miRNA在植物物种间...
- 高飞王雪马丹丹麦尔哈巴·阿布拉马鹏举冯金朝周宜君
- 关键词:沙冬青非生物胁迫MIRNA
- 文献传递
- 沙冬青属植物种系特异性miRNA的鉴定和功能预测
- 高飞王雪马丹丹麦尔哈巴·阿布拉马鹏举冯金朝周宜君
- 关键词:沙冬青非生物胁迫MIRNA
- 蒙古沙冬青基因组调查及SSR分析被引量:8
- 2017年
- 蒙古沙冬青是第三纪冰川孑遗物种,具有极强的耐逆性,是研究植物耐逆分子机制的良好材料。利用高通量测序技术和生物信息学工具预测蒙古沙冬青的基因组大小及杂合度,进行SSR分子遗传标记的初步鉴定。蒙古沙冬青基因组大小约为812 Mb,杂合率为0.506%,基因组杂合度较高。对基因组进行拼接,进行SSR分子遗传标记分析,共鉴定183 102个SSR,不同类型核苷酸重复差异较大,其中,二核苷酸重复中的AT/TA含量最高,四核苷酸重复最少,共占总数的1.48%。
- 周佳熠王雪高飞周宜君
- 关键词:基因组大小杂合度SSR
- 新疆沙冬青基因组调查测序与基因组大小预测被引量:16
- 2018年
- 新疆沙冬青是中国荒漠地区代表性常绿阔叶植物,属于第三纪孑遗植物。其极强的逆境耐受性受到了研究者的广泛关注,但由于缺乏基因组序列,分子生物学研究水平进展缓慢。本研究对新疆沙冬青进行了基因组调查测序,共得到65 Gb大小的双端测序数据。结合基于K-mer分析和流式细胞分析的方法,预测基因组大小、杂合率和GC含量等特征,估计基因组大小为770~787 Mb。测序数据拼接构建得到contigs的N50为684 bp,总读长为0.538 Gb;进一步组装后scaffolds的N50为12.09 kb,总读长为0.602 Gb。对拼接数据进行SSR分子标记预测,共得到151858个SSR,其中二核苷酸重复单元比例最高为56.39%,在二核苷酸重复单元中,AT/TA组成形式占多数。本研究首次报道了荒漠植物新疆沙冬青的基因组特征,为后续基因组学研究提供参考。
- 王雪周佳熠孙会改禹瑞敏高飞周宜君
- 关键词:基因组大小流式细胞分析SSR分子标记
- 蒙古沙冬青AmDREB2.1表达载体构建及其结合活性鉴定被引量:2
- 2017年
- 以蒙古沙冬青为试材,以AmDREB 2.1为研究对象,采用构建植物表达载体和叶盘法进行了AmDREB 2.1转烟草研究,采用Gateway和酵母单杂交技术研究了AmDREB 2.1转录因子的结合活性。结果表明:以BamH I和Sac I酶切位点成功构建了pPZP212-AmDREB 2.1表达载体,通过叶盘法获得了T0转AmDREB 2.1烟草株系。成功构建了pDEST22-AmDREB 2.1的酵母单杂交载体,分别转化YH4271-mDRE和YH4271-wDRE 2种酵母菌株,在Trp^-His^-Ade^-三缺培养基(3-AT浓度为0、20mmol·L^(-1))上筛选获得了阳性克隆,检测其β-半乳糖苷酶活性为阳性,显示AmDREB 2.1具有转录因子的结合活性。
- 夏波林高飞韦善君王雪周宜君
- 关键词:植物表达载体结合活性