赵清泉
- 作品数：4 被引量：10H指数：2
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- 茜素红处理下偏肿革裥菌细胞色素P450基因表达分析被引量：2
- 2020年
- 用蒽醌类染料茜素红在0(ck),3(QSH1),7(QSH2),10 h(QSH3)分别处理白腐菌偏肿革裥菌,构建转录组,为研究白腐菌的细胞色素P450(CYP450)基因在脱色降解茜素红机制中的作用提供理论支持。采用高通量测序技术对茜素红处理下的菌丝样本进行转录组测序,利用功能注释筛选出CYP450基因。结果表明:4个转录组共得到26.17 Gb的有效数据,与参考基因组的比对效率为71.23%~73.66%,通过功能注释搜索所有基因,共得到96个CYP450基因。通过ck与QSH1、ck与QSH2、ck与QSH3的分组比较,对所有的CYP450基因进行差异表达筛选。其中,有3个基因(gene24255、gene18992、gene7490)在3组对比中都出现。将这3个基因的0~10 h的表达量与茜素红脱色率进行比较,得出这3个基因的表达量与脱色率呈正相关。通过对KEGG通路进行分析,发现gene25488被注释到芳香化合物降解通路,初步印证了CYP450基因可能参与了偏肿革裥菌对茜素红染料的脱色。该研究从转录水平初步分析了偏肿革裥菌的CYP450基因及其产物可能参加了对茜素红降解脱色的相关代谢途径和生物学过程,获得的结果可为后续研究茜素红的降解机制提供参考。
- 张健池玉杰赵清泉冯连荣
- 关键词：细胞色素P450茜素红脱色率
- 环境因素对节杆菌株Ha1降解阿特拉津效果的影响被引量：1
- 2014年
- [目的]明确菌株Ha1降解阿特拉津(AT)的最适环境因素。[方法]采用液相色谱法测定降解体系中阿特拉津的残留量。[结果]K+和Mg2+对菌株Ha1降解阿特拉津有促进作用,Cu2+、Cd2+等离子则抑制其降解功能的发挥;溶液的缓冲性、p H、温度、供氧方式、反应体系、菌株的浓度和氰尿酸(CA)对菌株Ha1降解阿特拉津有影响。[结论]该研究结果为生物修复被阿特拉津污染的水环境奠定了理论基础。
- 魏晓爱赵清泉周博如
- 关键词：阿特拉津降解速率
- 东北地区榛树病虫害防治研究进展被引量：6
- 2017年
- 榛子因富含多种人体所需的营养且具有良好的口感而受到青睐。随着榛子产业的快速发展,东北地区作为榛子主产区,近些年榛树病虫害的种类与发生面积有扩大的趋势。本文对40年来东北地区榛树病虫害的发生规律和最新的防治措施进行了综述。东北地区榛树的主要虫害为榛实象甲、榛卷叶象甲、蒙古灰象甲、铜绿丽金龟、苹毛丽金龟、东方绢金龟、榛黄达瘿蚊、疣纹蝙蝠蛾、木蠹蛾,主要病害为榛白粉病、榛子果苞干腐病、榛子叶斑病、黑煤病、榛子东部枯萎病,并对榛树病虫害分别从发生规律、生活习性和防治措施等方面进行了介绍,为进一步制定榛树病虫害综合防治技术体系提供了依据。
- 李朝阳赵清泉马玲
- 关键词：榛子病虫害
- 偏肿革裥菌在木质环境下转录组构建与相关基因表达分析被引量：2
- 2019年
- 【目的】对白腐菌偏肿革裥菌在木质和非木质环境下的转录组进行测序,为白腐菌降解木材的机制研究提供支持。【方法】采用高通量测序技术对木屑和非木屑处理条件下的菌丝样本进行转录组测序。利用eggNOG、GO、KEGG等数据库对转录本进行注释和比较分析,预测和筛选出偏肿革裥菌与木材降解有关的基因。应用荧光定量PCR(qPCR)检测mnp2等11个与木质素降解相关的差异基因在木屑处理5天条件下的表达量,结合转录组数据对这些基因的表达量变化趋势进行分析。【结果】偏肿革裥菌转录组测序共得到38.9 Gb Clean Data,各样品Clean Data平均达到6.49 Gb,各样品的Reads与参考基因组的比对效率在71.23%~74.25%之间。使用edgeR软件进行差异表达分析,得到差异表达基因898个,其中上调351个、下调547个。差异基因被注释到GO数据库的有251个,注释到KEGG数据库的有223个,注释到eggNOG数据库的有704个。eggNOG分析表明,差异基因表达多聚集在能量产生和转换、转录后修饰、蛋白质代谢、伴侣关系、次生代谢物的生物合成、碳水化合物的运输和分解代谢等功能分类下。GO分析表明,显著性富集与频率较高的生物过程是丙酮酸代谢过程、类异戊二烯生物合成过程、天冬氨酸家族氨基酸代谢过程和木质素分解过程。在KEGG通路分析中,差异基因分布到86个不同的生物途径,差异基因显著富集的代谢通路主要为:碳代谢、柠檬酸循环、芳香化合物降解、乙醛酸代谢。qPCR结果表明在木屑处理条件下基因mnp2、mnp3、lip9、lip2、laccase1和nadp的表达量明显上调;mnp10 s、mrp、cyp450-1、GroES1和GroES2的表达量明显下调,qPCR与转录组测序结果在表达量差异倍数上存在较小偏差,但整体趋势一致,可以证明转录组测序结果是正确可靠的。【结论】偏肿革裥菌降解木材与碳代谢、芳香化合物降解等通路密切相关;与
- 赵清泉池玉杰张健冯连荣
- 关键词：白腐菌转录组木质素降解
