设计一个抗缺氧诱导因子-1α(HIF-1α)mRNA的锤头状核酶为构建它的基因表达载体选择靶点,以便用于肿瘤的基因治疗。从GenBank寻找缺氧诱导因子-1αmRNA的全序列,用RNA结构分析软件预测HIF-1αmRNA的二级结构并选择合适的核酶作用靶点,从而设计相应的锤头状核酶。HIF-1αmRNA的577位含有GUC三联体,可以作为核酶的切割靶点,设计的核酶包括22nt的催化活性中心和16nt的侧翼序列。计算机辅助预测证明此位点为合适的靶点,用Basic Local Alignment Search Tool(BLAST)筛选以确定的靶点序列的唯一性。成功设计抗HIF-1αmRNA锤头状核酶基因表达载体,为进一步运用核酶切割HIF-1αmRNA基因来抑制肿瘤生长铺平了道路。
