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陈立根
作品数:
2
被引量:14
H指数:1
供职机构:
华南农业大学动物科学学院
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相关领域:
农业科学
生物学
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合作作者
李如意
华南农业大学动物科学学院
张宇
华南农业大学动物科学学院
张静
华南农业大学动物科学学院
蔺文成
华南农业大学动物科学学院
谢青梅
华南农业大学动物科学学院
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华南农业大学
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陈立根
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中国家禽
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H9N2亚型禽流感病毒河南分离株的全基因克隆及序列分析
被引量:1
2017年
为了研究H9N2亚型禽流感病毒的基因组变异情况,试验以一株2015年在河南省分离的H9N2亚型Ck/HN/12/15为研究对象,用RT-PCR方法扩增病毒基因组的8个基因片段并进行克隆和测序,将测序结果与Gen Bank公布的H9N2参考毒株序列进行比对分析,绘制各基因片段的进化树。结果表明:分离株的PB1、PA、NP、NS基因与1998年中国上海鸡源毒株Ck/SH/F/98(H9N2)归于同一进化分支,核苷酸序列同源性分别为93.57%、90.48%、87.66%和86.64%。分离株的HA、NA基因与1997年中国香港鸭源毒株Dk/HK/Y280/97(H9N2)属同一个进化分支,核苷酸序列同源性分别为87.62%和85.32%。该毒株裂解位点处的序列是PSRSSR,符合低致病性禽流感病毒的分子特点。该株HA基因的226位(对应H3亚型位置)氨基酸为Leu,更易与哺乳动物唾液酸受体结合。说明应该做好对此类H9N2亚型禽流感病毒免疫防控工作,避免在人和禽类之间传播。
张静
雷小亚
李昕键
张宇
陈立根
孙乾晋
李如意
白牧原
蔺文成
谢青梅
关键词:
禽流感病毒
H9N2
核苷酸
1997~2015年我国不同地区H9N2亚型禽流感病毒流行情况研究
被引量:13
2016年
为了揭示H9N2亚型禽流感病毒的遗传进化规律,为H9N2亚型禽流感的防控提供参考,研究从Gisaid以及NCBI下载1997~2015年我国各地区H9N2亚型禽流感病毒HA基因序列,按时间、地域、物种等信息进行统计,并从中选取873株具有代表性的毒株,利用Mega7.0等软件对我国8个地区H9N2亚型禽流感病毒HA基因进行遗传进化分析。结果发现,我国H9N2亚型禽流感病毒经过了四次大暴发(2001、2007、2011、2013年),主要来源于华南和华东地区。呈现出以鸡群为主、多种宿主并存的现象,并以h9.4.2.5和h9.4.2.6亚分支为主要流行分支。结果说明,H9N2亚型禽流感病毒进化持续进行,禽流感的暴发以养禽密集地区为主且具有一定周期性,宿主范围不断扩大,使得H9N2亚型禽流感的防控在我国面临着越来越严峻的挑战。
张静
陈立根
张宇
孙乾晋
李如意
白牧原
蔺文成
谢青梅
关键词:
禽流感病毒
HA基因
H9N2亚型
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