刘飞
- 作品数：3 被引量：7H指数：2
- 供职机构：河北农业大学动物科技学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 西门塔尔牛饱和脂肪酸含量的低密度芯片基因组预测
- 2016年
- 旨在探索低密度芯片标记的筛选方法并评估不同低密度芯片的准确性。本研究采用BovineHD高密度芯片,检测西门塔尔牛基因组的SNP位点及其与饱和脂肪酸含量的关联性,根据P值或效应值筛选标记构成低密度芯片,使用IBS聚类分组和随机分组进行交叉验证,估计基因组育种值并评估其准确性。结果表明,在14号染色体的MYC基因附近有5个位点与饱和脂肪酸性状显著相关,可考虑作为西门塔尔牛脂肪酸含量的候选基因进行后续研究。根据P值筛选标记并使用IBS聚类分组进行交叉验证时,估计基因组育种值准确性最高,芯片密度达到7K时准确性趋于稳定。因此,本研究发现的标记位点可能对西门塔尔牛的脂肪酸含量存在一定影响,并且为低密度芯片标记位点的筛选提供参考资料。
- 齐欣张静静樊惠中李娟胡鑫刘飞朱波高雪陈燕张路培高会江李俊雅
- 关键词：全基因组关联分析SNP
- 蒙荷杂交牛与荷斯坦母牛生长发育及体型特征的对比研究被引量：4
- 2014年
- 为了克服荷斯坦牛近交系数不断增高带来的疾病增多、繁殖力低、利用年限少等问题,提高其耐粗饲及乳肉综合经济效益,本试验以蒙贝利亚乳肉兼用牛为父本,荷斯坦牛为母本进行杂交,对其F1母牛与荷斯坦纯种母牛的生长发育规律及品种体型特征进行了对比研究。在测定了F1母牛(80头)及同期出生的荷斯坦母牛(73头)从出生至18月龄各阶段体重和15月龄体尺基础上,通过构建线性模型、拟合生长曲线、主成分分析及多元线性回归分析等对影响体重和生长发育规律的因素作了系统深入的研究。结果表明:蒙荷杂交一代母牛从出生至18月龄各阶段体重均大于纯种荷斯坦牛,15月龄以前的体重差异显著或极显著,其后差异不显著;乳肉兼用杂种母牛生长发育的拐点为8.94月龄,早熟于纯种荷斯坦母牛0.38个月;F1母牛15月龄尻宽、管围均极显著高于荷斯坦母牛(P<0.01),而体高、体斜长显著低于荷斯坦母牛的(P<0.05)。综合分析表明,对乳肉兼用F1母牛体重影响最大的体尺因素为胸围和尻宽,其体型特征为粗而宽、骨量大;而对荷斯坦母牛影响最大的为体斜长和胸围,其体型特征为阔而长。
- 何淑静孙少华朱波刘飞孔令娜
- 关键词：杂交生长发育体型特征荷斯坦牛
- 牛多个组织microRNA Solexa测序与生物信息学分析被引量：3
- 2015年
- 本研究旨在发掘牛更多的microRNA(miRNA)信息及新的miRNA序列,为进一步研究miRNA的生物学功能奠定理论基础。运用高通量测序技术对来自一头西门塔尔公牛和一头荷斯坦母牛的多个组织的小RNA进行混池测序,对测序结果进行了生物信息学分析。随机选取了一条成熟miRNA:bta-miR-2346-5p和两条新预测的miRNAs:novel_miR-48和novel_miR-86,采用茎环RT-PCR进行验证。共鉴定了604条miRNAs,其中429条为牛的已知miRNAs,175条为新预测的miRNAs。通过茎环RT-PCR发现选取的这3条miRNAs在背最长肌、心肌、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、大肠、小肠中均有表达,证明了高通量测序结果的准确性。本试验得到的数据在一定程度上丰富了牛miRNA的数量和种类,为后续牛或其他物种的miRNA相关生物学研究提供了更加详实的信息。
- 刘飞杨继业孙志颖胡鑫李娟孔令娜梁瑞圆宋振宇张路培陈燕高雪李俊雅孙少华
- 关键词：MICRORNA高通量测序
