刘文彬
- 作品数:6 被引量:23H指数:3
- 供职机构:北京市农林科学院玉米研究中心更多>>
- 发文基金:国家科技支撑计划北京市农林科学院科技创新能力建设专项更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 玉米品种京科968纯度鉴定引物的确定被引量:6
- 2017年
- 为了确定一套京科968玉米品种纯度鉴定的引物组合,本研究从现有的玉米40对SSR引物中根据多态性、等效扩增、染色体分布挑选出15对候选引物。综合考虑多重电泳,对扩增产物片段大小相差10 bp以下的10对引物分别进行非荧光和荧光标记毛细管电泳;对扩增产物片段大小相差10 bp以上的引物跑琼脂糖凝胶电泳。最终根据三种电泳方式确定了相对应的纯度鉴定引物组合。此套纯度鉴定组合适于京科968玉米品种的纯度鉴定。并为其他玉米大品种的纯度鉴定提供了思路、尤其是对主要经营一些玉米大品种的企业尤为适用。
- 冯博许理文王凤格蔚荣海易红梅刘文彬葛建镕田红丽侯振华王璐任洁王元东赵久然
- 关键词:纯度鉴定分子标记
- 快速多重SSR法在玉米种子纯度鉴定中的分析被引量:3
- 2022年
- 近几年,随着中国玉米品种数量的激增,对制种基地玉米种子纯度质量检测提出了新的挑战。为更快、更准确地鉴定玉米种子纯度中的自交苗和异型株,本研究采用9对优异SSR引物,建立了快速PCR程序,可在28 min内完成PCR扩增。采用TaKaRa Multiplex PCR assay kit体系,基于快速PCR和多重PCR,建立了快速9重PCR体系,结合碱裂解DNA提取法和荧光毛细管电泳,1 h 30 min内可完成SSR纯度鉴定基因分型全流程。采用快速9重PCR体系对一份96粒‘郑单958’检测样品进行纯度鉴定,共检测出93个正常个体,2个自交个体,1个异型株,鉴定结果与常规PCR结果完全一致。该快速PCR体系扩增结果稳定、重复性强、节约成本、峰型易判断,能大大提高检测工作效率,对种子纯度鉴定、品种真实性检测以及SSR基因型检测有较高应用价值及前景。
- 任星旭易红梅刘丰泽许理文刘文彬葛建镕高玉倩王凤格
- 关键词:玉米种子纯度多重PCR
- 非优异SSR原因分析及解决方案被引量:1
- 2017年
- SSR标记在真实性检测、纯度鉴定、以及指纹库构建中起着至关重要的作用。在其筛选过程中会遇到许多具有N+1峰等异常峰型、非特异性峰、多态性低、不适于软件自动分析等非优异SSR引物。为了解并掌握非优异SSR引物表现以及形成原因,本研究以22份初筛材料、27套三联体材料及95份自交系对新型SSR引物进行评估筛选,从中选取有代表性的11对SSR引物,现在已对10种非优异SSR引物表现进行描述,分析形成原因,通过测序对一对引物进行重新设计,并获得较好效果。
- 刘文彬许理文冯博易红梅任洁田红丽赵涵吕远大蔚荣海赵久然王凤格
- 关键词:测序
- 基于60K芯片的玉米回交群体精准背景选择策略
- 2023年
- 利用Maize 6H-60K芯片对京724/京92/京92的BC_(1)代群体进行分子标记辅助背景选择,结合SNP数据特征和回交群体分离特征,开发出一套精准背景选择策略(ABSS:Accurate Background Selection Strategy)及相关算法。从统计结果中选取背景回复程度最高的一批单株作为下一代回交群体的亲本材料。基于Maize 6H-60K芯片分析和筛选产生的28910个多态性位点,可以对727个样品的背景回复程度进行精细排序,样品背景回复率大部分分布在0.30~0.75(约占样品总数的94.1%),背景回复率在0.75及以上的样品比例为1.8%。通过分析回交群体重组交换规律以及背景回复率与株高的相关性,进一步验证Maize 6H-60K芯片数据和ABSS的准确性。利用Maize 6H-60K芯片结合ABSS可以精细选择背景回复程度高、重组交换频率相对较低的单株,显著提高背景选择效率,为设计玉米回交群体规模提供参考价值。
- 朱少喜张云龙赵怡锟许理文刘文彬徐翠葛建镕霍永学易红梅路运才王凤格
- 关键词:玉米回交群体
- 玉米InDel标记20重PCR检测体系的建立被引量:7
- 2017年
- 为构建玉米多重PCR检测体系,提高分子标记检测效率,利用10份代表性玉米材料对238对InDel引物进行单重PCR评估,共得到192对扩增效率高、稳定性好的引物。根据软件评估结果、扩增质量、产物范围、染色体均匀分布原则从192对引物中优选出30对综合表现较好的引物形成扩增产物范围在80~200 bp和200~400 bp的两组核心引物组合,每套组合中有10对引物分布在不同染色体上。在核心引物组合的基础上综合考虑染色体分布、碱基片段范围、引物荧光颜色,逐一添加引物,最终形成两组玉米20重PCR体系,一组40重荧光标记毛细管电泳。
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- 关键词:玉米INDEL多重PCR
- 基于两种荧光毛细管电泳平台筛选评估玉米新型SSR引物被引量:9
- 2017年
- 以93份代表自交系及27套包括杂交种及双亲在内的三联体材料为试材,分别用Qiagen和ABI3730两种DNA分析仪,从111对新型玉米SSR引物中筛选出多态性高、稳定性好、适于自动化分型的引物9对,确定1套适合SSR引物评估筛选的方案,可以为今后引物设计至评估入选提供高效的筛选方案提供参考。
- 刘文彬许理文王凤格赵久然冯博赵涵吕远大蔚荣海
- 关键词:玉米