李梦寻 作品数:14 被引量:44 H指数:4 供职机构: 石河子大学动物科技学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国际科技合作与交流专项项目 教育部留学回国人员科研启动基金 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
猪lncRNA-ENSSSCT00000018610的克隆及其在猪卵泡中的表达 被引量:3 2018年 为了探究lncRNA-ENSSSCT00000018610在猪卵泡发育过程中的作用,本研究采用RACE技术对lncRNA-ENSSSCT00000018610的全长序列进行了扩增克隆,用Real-time PCR进行组织表达谱分析,并分析其在梅山猪和杜洛克猪卵泡中的表达情况以及采用顺式和反式两种方法对lncRNA-ENSSSCT00000018610靶基因进行预测。结果表明,克隆获得了lncRNA-ENSSSCT00000018610全长序列1 731bp;lncRNA-ENSSSCT00000018610在肌肉、心、肝、脾、肺、肾、十二指肠、卵巢、输卵管、子宫、垂体、黄体、下丘脑中均有不同程度的表达,其中以肾、肺、子宫、卵巢表达量相对较高;lncRNA-ENSSSCT00000018610在杜洛克猪S、L卵泡中的表达量显著高于梅山猪(P<0.05),在杜洛克猪M1和M2卵泡中的表达水平极显著高于梅山猪(P<0.01)。lncRNA-ENSSSCT00000018610的潜在靶基因TNIP1、CYP2J2、SCARB1、IBSP等与猪产仔性状相关,并且参与猪的卵泡发育。提示其可能通过对靶基因的调控间接参与卵泡发育过程。 李梦寻 黄涛 马力鹏 刘乙 李涛 公红斌 邱梅玉 谢苏 孙晓梅关键词:卵泡 表达量 母猪 猪FOXO3基因的多态性和生长性状关联分析 被引量:4 2016年 为了探讨猪FOXO3基因SNPs位点及其与猪生长性状的关联性,采用基因克隆并测序的方法检测FOXO3基因的多态位点,并对其与生长性状进行关联分析。结果显示:该基因共存在3个SNP位点,为:G82316A、T60086C和A64011G,分别命名为:P1、P2和P3。在群体中均表现出3种基因型,3个位点对生长性状的影响表现为:P1位点AA基因型个体校正背膘厚显著高于AG基因型个体(P<0.05)以及GG基因型个体(P<0.05);P2位点CC基因型个体背膘厚显著高于TT基因型个体(P<0.05)以及TC基因型个体(P<0.05);P3位点AG基因型个体100 kg日龄显著低于AA基因型个体(P<0.05)以及GG基因型个体(P<0.05)。结论:P1、P2变异位点对大白猪的背膘厚及生长速度具有负选择作用,P3位点对大白猪的背膘厚和生长速度具有正选择作用。此3个多态位点可作为猪分子遗传育种的选择性标记。 陈亚楠 黄涛 唐中林 翟腾蛟 马立鹏 李梦寻 沈永巧关键词:多态性 生长性状 TGFβRⅠ、TGFβRⅡ、FSH和TGFβ1对猪颗粒细胞增殖凋亡的影响 2023年 为研究TGF-β通路对猪颗粒细胞增殖、凋亡的影响,本研究对TGF-β通路基因进行调控处理,设计并筛选可高效干扰TGFβRⅠ及TGFβRⅡ表达的载体,转染不同干扰载体及添加10 ng/m L TGFβ1和25 ng/m L FSH,采用Westernblot、MTT和流式细胞法检测不同处理对颗粒细胞TGFβ RI和TGFβ RII蛋白表达量和细胞增殖凋亡的影响。结果表明:成功筛选出干扰效率最高的p OSP1-TGFβRⅠ-sh5和p OSP1-TGFβRⅡ-sh3载体,对TGFβRⅠ和TGFβRⅡ的抑制率分别为78.00%和84.10%;转染后TGFβRⅠ干扰组的TGFβRⅠ蛋白表达量显著低于其阴性对照组;TGFβRⅡ干扰组、TGFβ1组和FSH组的TGFβRⅡ蛋白表达量显著低于其阴性对照组;TGFβ RI干扰组、TGFβ RII干扰组的增殖抑制率极显著高于PLL3.7空载体组,TGFβ 1组细胞增殖抑制率极显著高于空白对照组且FSH组的增殖抑制率显著高于空白对照组;TGFβRⅠ干扰组和TGFβRⅡ干扰组细胞凋亡率极显著高于PLL3.7空载体组;TGFβ1组和FSH组细胞凋亡率极显著高于空白对照组。总之,RNAi介导的TGFβRⅠ和TGFβRⅡ沉默和外源因子(10 ng/m L TGFβ1和25 ng/m L FSH)引起的TGFβRⅡ蛋白下调,均会减弱TGF-β信号传导通路对卵泡颗粒细胞的促进作用,进而抑制卵泡颗粒细胞的增殖,促进其凋亡。 李清春 李梦寻 徐梦思 孙义姗 黄涛关键词:卵巢颗粒细胞 长链非编码RNA H19、Neat1、Meg3、Gas5在梅山与杜洛克猪卵泡及各组织中的差异表达分析 被引量:1 2017年 为探讨lnc RNA在卵泡及组织中的表达规律,采用荧光定量RT-PCR检测lncRNA H19、Neat1、Meg3、Gas5基因在杜洛克与梅山猪各级卵泡和猪不同组织中的表达量变化。结果表明:H19基因在杜洛克猪各级卵泡S、M1、M2、L中的表达量分别是梅山猪的3.61、0.57、4.19、3.27倍,各级卵泡品种间差异极显著(P<0.01);Neat1基因在杜洛克猪各级卵泡中的表达量分别是梅山猪的3.94、1.16、1.63、1.44倍,其中S卵泡品种间差异极显著(P<0.01);Meg3基因在杜洛克猪各级卵泡中的表达量分别是梅山猪的2.78、1.12、10.65、1.41倍,S、M2卵泡品种间差异极显著(P<0.01);Gas5基因在杜洛克猪各级卵泡中的表达量分别是梅山猪的4.53、1.40、6.31、1.14倍,S、M2卵泡品种间差异极显著(P<0.01),M1卵泡中差异显著(P<0.05)。组织表达分析结果表明,各基因在下丘脑、垂体、子宫、卵巢等组织中均有表达。此研究表明,4个lnc RNA基因在杜洛克和梅山猪中表达量存在较大差异,可能影响卵泡的增殖、发育和成熟。 马力鹏 黄涛 刘乙 李梦寻 李涛 沈永巧 孙敬礼 鲁慧文关键词:H19 猪circ0015292的鉴定及其在卵泡中的表达研究 被引量:3 2019年 试验旨在通过高通量测序及生物信息学分析circRNA在猪卵泡发育过程中的作用及其可能的机制,为进一步探索circRNA对猪卵泡发育的调控机理奠定生物学基础。采集梅山和杜洛克猪不同级别的卵泡及各组织样本,提取总RNA,采用RNA-Seq技术对卵泡中差异表达的circRNA进行筛选,同时验证并分析其在梅山猪和杜洛克猪卵泡中的表达情况,并用实时荧光定量PCR进行组织表达谱分析。结果显示:试验证实了circ0015292的存在,且其在肌肉、心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、卵巢、输卵管、子宫、垂体及下丘脑中均有不同程度的表达,在心脏、脾脏、肺脏、卵巢中的表达量相对较高;circ0015292在梅山猪S卵泡中的表达量极显著高于杜洛克猪(P<0.01),在杜洛克猪M1、M2、L卵泡中的表达量均显著高于梅山猪(P<0.05);其潜在靶基因GADD45G、CCR2、IL20RB、CFL1、LAMB3与猪的卵泡发育相关。综合试验结果,circ0015292在不同组织、不同时期卵泡中均有不同水平的表达;部分靶标基因参与细胞周期及卵巢发育相关信号通路,提示其可能通过对靶基因的调控作用间接参与卵泡发育过程,这为猪繁殖机理的研究提供了新思路。 谢苏 李梦寻 邱梅玉 公红斌 孙义姗 孙晓梅 孙晓梅关键词:组织表达谱 RNA-SEQ 梅山猪和杜洛克猪卵泡中差异表达lncRNA克隆鉴定及与miRNAs相关性分析 2024年 【目的】通过克隆鉴定梅山猪和杜洛克猪卵泡期第4天M2卵泡中差异表达的lncRNA-ALDBSSCT0000005583,分析其在猪颗粒细胞与miRNAs表达量的相关性,为探究lncRNA调控miRNA在母猪卵泡发育过程中的作用提供理论依据。【方法】对课题组前期在梅山和杜洛克M2卵泡中筛选出的差异表达lncRNA-ALDBSSCT0000005583,进行RT-qPCR验证,并利用RACE克隆其全长序列;根据编码潜力评估工具CPAT、CPC对该lncRNA的编码能力进行预测,原核表达试验进一步鉴定其编码能力;核质分离试验对lncRNA-ALDBSSCT0000005583进行亚细胞定位,RT-qPCR检测其在各组织中的表达水平;利用miRBase网站查找猪的miRNA数据库,结合RNAhybrid、miRanda在线软件预测与lncRNA-ALDBSSCT0000005583有相互作用的物种间保守miRNA,使用TargetScan和miRanda预测与lncRNA-ALDBSSCT0000005583具有相互作用miRNA的靶基因,并对其靶基因进行GO富集和KEGG信号通路分析;通过过表达以及干扰lncRNA验证其对miRNA表达量的影响。【结果】lncRNAALDBSSCT0000005583在杜洛克猪M2卵泡中的表达量显著高于梅山猪,lncRNA 5’RACE和3’RACE片段大小为569 bp和546 bp,测序分析表明lncRNA-ALDBSSCT0000005583大小为588 bp。生物信息学预测其编码潜能较低,同时原核表达试验结果进一步证明其不编码蛋白质。组织表达谱分析表明,lncRNA-ALDBSSCT0000005583在肾上腺、脾肝和卵巢中表达量较高,在下丘脑和心脏中的表达量较低,亚细胞定位结果显示该lncRNA主要存在于细胞质中。生物信息学分析后共筛选出9个物种间保守的miRNA与lncRNA-ALDBSSCT0000005583具有潜在的相互作用,其中有两个与卵巢发育相关的miRNA:miR-193a-5p、miR-361-3p;KEGG和GO富集分析显示miR-193a-5p、miR-361-3p的靶基因与系统进程和细胞与细胞信号传导等生物学过程有关,并显著参与到催产素、Ras、NF-κB、促性腺激素释放激素分泌等通路。随后在颗粒细胞中过表达lnc RNA- 张化鹏 张庆泽 何凡 祁梦凡 符彬彬 李清春 李梦寻 马力鹏 刘乙 黄涛关键词:卵泡 颗粒细胞 大白猪OPN与FSH-β基因多态性对其繁殖性能的影响 被引量:3 2019年 为探讨OPN和FSH-β基因多态性与大白母猪繁殖性状的相关性,研究采用了PCR和琼脂糖凝胶电泳技术对1 011头大白猪群体中OPN和FSH-β基因的多态性进行检测,并对不同基因型的总产仔数、产活仔数、健仔数、木乃伊胎、死胎、窝重等繁殖性状进行了关联性分析。分析结果表明,经产母猪中OPN基因AB型个体的总产仔数和健仔数显著比AA型个体少0.35头/胎和0.23头/胎(P <0.05);经产母猪FSH-β基因AB型的总产仔数显著高于BB型0.2头/胎(P <0.05)。在初生窝重性状上AB基因型显著高于AA基因型0.54 kg/胎(P <0.05);经产母猪中合并基因型BBAA型的总产仔数比ABBB型多0.45头/胎。大白猪OPN-FSHβ合并基因型中最优分子标记组合为BBAA,OPN和FSH-β基因对大白猪的繁殖性状有一定的影响。 孙义姗 黄涛 孙敬礼 胡九英 李梦寻 来红霞关键词:OPN 繁殖性能 骨桥蛋白和视黄醇结合蛋白基因多态性对母猪繁殖性状的影响 被引量:8 2017年 为了研究猪繁殖性状候选基因骨桥蛋白(osteopontin,OPN)和视黄醇结合蛋白4(Retinol-binding proteins,RBP4)的多态性在大白猪群体中的遗传效应,采用PCR和PCR-RFLP技术在大白猪群体中对与繁殖性能相关的候选基因OPN和RBP4的基因多态性进行检测,并对不同基因型的总产仔数、产活仔数及健仔数进行关联性分析。结果显示:OPN和RBP4基因的优势基因都是B等位基因,在初产母猪中OPN基因AA型比BB型个体在总产仔数、产活仔数及健仔数上分别高0.80、0.22和0.28头(P>0.05);RBP4基因AA型比BB型个体分别高0.11、0.46、0.29头(P>0.05)。在经产母猪中OPN基因AA型比BB型个体总产仔数高0.05头(P>0.05),而产活仔数和健仔数分别低0.10头(P>0.05)和0.22头(P<0.05);RBP4基因BB型比AA型个体在总产仔数、产活仔数和健仔数分别高0.12、0.08和0.02头(P>0.05)。在合并基因型中,初产母猪合并基因型总产仔数和产活仔数最高的ABAB型比最低的BBAB型个体多3.26头(P<0.05)和3.16头(P<0.05),健仔数最高ABAB型比最低ABBB型个体多3.08头(P<0.05);经产母猪合并基因型在总产仔数、产活仔数和健仔数最高ABAA型比最低AAAA型个体多0.67(P>0.05)、1.1(P>0.05)和1.45头(P<0.05)。本试验结果可为猪分子标记辅助育种提供依据。 马力鹏 黄涛 刘乙 李梦寻 李涛 沈永巧 胡九英 汪德明 王忻 来红霞关键词:骨桥蛋白 视黄醇结合蛋白4 繁殖性状 猪背膘厚度与肌内脂肪含量的相关性研究 被引量:4 2019年 为了研究猪背膘厚度与肌内脂肪含量之间的关系,试验用超声波测膘仪测定了102头“杜长大”三元杂交猪的活体背膘厚度,利用索氏抽提法测定其肌内脂肪含量,并将所得的两组数据对应进行相关及回归分析。结果表明:背膘厚度与肌内脂肪含量之间存在极显著相关性和回归关系(P<0.01),且r为0.833。当背膘厚度范围在11~13 mm时,对应肌内脂肪含量在2.86%~4.28%之间,此时肉的品质风味相对较好,脂肪含量适中对人身体健康有利,也是生猪出栏最佳时间。以活体测定背膘厚度为自变量,屠体肌内脂肪含量为因变量,建立回归方程:Y=3.7757×10^-3×X^2.7650(7 mm≤X≤16 mm),即可用于预测育肥猪适宜出栏时间。 孙义姗 李梦寻 闫冲 李亚强 黄涛关键词:背膘厚度 肌内脂肪含量 FSH-β、PRLR和FUT1基因多态性与母猪繁殖性状的关联性分析 被引量:2 2018年 为探讨FSH-β、PRLR和FUT1基因多态性与母猪繁殖性状的相关性,采用PCR-RFLP检测技术在269头大白猪群体中进行FSH-β、PRLR和FUT1基因的多态性检测,并对不同基因型的总产仔数、产活仔数、健仔数、窝质量等繁殖性状进行了关联性分析。结果显示,在试验群体中FSH-β和FUT1的优势等位基因均为B基因,PRLR的优势等位基因为A基因。在试验群体中FSH-β基因不同基因型对各繁殖性状的影响均不显著。PRLR基因多态性对大白猪总产仔数有显著影响,AA、AB型比BB型分别高2.07、1.30头/胎(P<0.05)。FUT1基因AA型弱仔数显著低于AB、BB型,畸形仔猪数极显著高于AB、BB型。合并基因型分析发现,大白猪繁殖性状FSH-β-PRLR最优分子标记组合为AAAA,FSH-β—PRLR—FUT1最优分子标记组合为BBAABB。 李梦寻 胡九英 孙敬礼 鲁慧文 汪德明 王忻 刘乙 马力鹏 李涛 沈永巧 来红霞 黄涛关键词:母猪 PRLR 繁殖性状 关联性分析 基因多态性