陈健美
- 作品数：16 被引量：30H指数：4
- 供职机构：赣南师范大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金江西省科技支撑计划项目江西省教育厅科学技术研究项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 一种鉴定M25脐橙的分子标记及其应用
- 本发明公开了一种鉴定M25脐橙的分子标记及其应用，其中分子标记CsChr3‑DG的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，用于扩增分子标记CsChr3‑DG的引物对位于M25脐橙Chr3染色体上，方便M25脐橙苗木的快速...
- 陈健美黄旭琴林怡万书贝袁壬生陈琼
- 甜橙SPL基因家族的鉴定及其在成花诱导中的表达分析被引量：4
- 2022年
- SQUAMOSA promoter binding protein-like(SPL)基因家族在植物成花转变与花器发育中起重要调控作用。该研究基于甜橙(Citrus sinensis)基因组数据,对甜橙SPL家族成员及其启动子区进行生物信息学分析,并采用qRT-PCR检测其在甜橙不同花期、不同品种花芽和叶片的表达特异性,为深入探讨CsSPLs基因在甜橙成花诱导中的功能奠定基础。结果表明:(1)共鉴定出15个含有SBP保守结构域的甜橙SPL基因,分别命名为CsSPL1~CsSPL15,且分布在6条染色体上。(2)CsSPL1~CsSPL15基因编码的氨基酸长度为130~1075 aa,分子量为14.73~118.75 kD;系统发育分析将15个CsSPLs分成8个亚族,除CsSPL4外,其他CsSPLs均与拟南芥SPL家族成员聚类。(3)顺式作用元件分析表明,CsSPLs启动子中含有大量光响应元件,推测CsSPLs可能在甜橙响应光调控过程中发挥重要作用。(4)转录组数据分析显示,CsSPLs在甜橙愈伤组织、花、叶片和果实中均有表达,其中CsSPL3、CsSPL4、CsSPL7、CsSPL8、CsSPL12、CsSPL13、CsSPL14和CsSPL15在花和叶片中较高表达。(5)qRT-PCR检测显示,CsSPLs在甜橙不同花期、不同品种花芽和叶片组织中的表达均有显著上调趋势,且采样各时期下早花品种‘赣南早’花芽和叶片中CsSPLs的表达量均高于对照品种‘纽荷尔’。研究认为,甜橙成花组织内CsSPLs基因的高表达是其花期提前的主要因素。
- 杨杰陈蓉胡文娟吴巧玲陈健美李兴涛
- 关键词：甜橙生物信息学基因表达成花诱导
- 一种脐橙鲜果品质综合评价方法及系统
- 本发明涉及一种脐橙鲜果品质综合评价方法及系统，属于脐橙鲜果品质综合评价技术领域。先获取目标区域内多个脐橙鲜果样品中每一脐橙鲜果样品的各个品质指标的取值，品质指标包括果皮亮度、可溶性固形物含量、维生素C含量、单果重、横径、...
- 米兰芳王青芸马冬李航许赛冰习建龙陈健美钟八莲赖晓桦
- ‘赣南早’脐橙在干旱胁迫下的生理及转录组研究被引量：2
- 2022年
- 我国脐橙产区的季节性干旱对脐橙产量和品质影响较大。‘赣南早’脐橙作为一个新品种脐橙,目前在我国脐橙产区已大面积推广。为深入了解这个新品种的耐旱性,探究早熟品种‘赣南早’脐橙应对干旱胁迫的调控机制,以‘赣南早’脐橙与‘纽荷尔’脐橙(对照)为材料,测定比较不同干旱胁迫程度下二者光合作用、干旱相关生理指标等差异,并通过RNA-Seq分析比较转录水平差异及抗氧化物酶基因表达调控。结果表明:干旱胁迫下‘赣南早’脐橙净光合速率(P_(n))、蒸腾速率(T_(r))、气孔导度(G_(s))均显著高于‘纽荷尔’脐橙;随着干旱胁迫程度增加,‘赣南早’脐橙叶片较‘纽荷尔’脐橙更舒展,‘赣南早’脐橙相对电导率和丙二醛含量显著低于‘纽荷尔’脐橙,而保护酶超氧化物歧化酶(SOD)和过氧化物歧化酶(POD)活性变化幅度更大;‘赣南早’脐橙和‘纽荷尔’脐橙叶片可溶性糖含量无显著性差异,复水后,‘纽荷尔’脐橙叶片中可溶性糖含量极显著高于‘赣南早’脐橙。转录组测序分析表明,干旱胁迫0、10、20 d时,‘赣南早’脐橙和‘纽荷尔’脐橙间DEGs数量分别为1266、683、658个。GO富集分析显示,在干旱胁迫过程中‘赣南早’脐橙差异基因主要集中在细胞蛋白修饰过程、高分子修饰作用、含磷化合物代谢过程、蛋白修饰过程等通路,而‘纽荷尔’脐橙未见明显富集。KEGG富集分析显示,除了富集于淀粉及蔗糖通路和氨基酸及核苷酸糖代谢途径,‘赣南早’脐橙其他差异基因富集途径与‘纽荷尔’脐橙基本一致。差异基因转录因子分析显示二者在ERF家族、MYB家族、NAC家族、MYB_related家族、WRKY家族、bHLH家族、HB-other家族、HSF家族、B3家族和bZIP家族均有分布,此外,‘赣南早’脐橙特异分布于GRAS家族。根据转录组分析筛选出抗氧化酶相关基因30个,其中上调表达
- 刘林芝欧阳欢李兴涛陈健美
- 关键词：脐橙干旱胁迫光合作用酶活性丙二醛
- 一种用于鉴定易剥皮脐橙M28的分子标记及其应用
- 本发明公开了一种用于鉴定易剥皮脐橙M28的分子标记及其应用，该分子标记命名为CsChr8‑M28，核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，位于脐橙Chr8染色体上；其中Chr8染色体第32509814位点之后插入DNA转...
- 陈健美林怡万书贝袁壬生陈琼
- 脐橙早熟新品种‘赣脐4号’的选育被引量：5
- 2016年
- ‘赣脐4号’是从‘纽荷尔’脐橙芽变中选育的脐橙新品种。该品种果实圆形或偏扁圆形,单果质量220~240 g,成熟果实外观漂亮,品质优,果肉脆嫩化渣,易剥皮,可溶性固形物含量12.1%,总酸含量0.47%,维生素C含量633.0mg·L^(-1)。树势中等,坐果率高,早结丰产性好。多点区域试验和品种比较试验表明,该品种成熟早,成熟期在9月下旬至10月上旬。
- 米兰芳汪爱云钟八莲陈健美苏华楠彭婷钟日芬林石鑫
- 关键词：脐橙芽变
- 一种用于鉴定赣南早脐橙的分子标记及其应用
- 本发明公开了一种用于鉴定赣南早脐橙的分子标记及其应用，脐橙Chr9染色体第29470212和第29470213之间位置插入DNA转座子，形成分子标记CsChr9‑GNZ，用于扩增所述分子标记CsChr9‑GNZ的引物对为...
- 陈健美林怡钟八莲万书贝黄旭琴米兰芳
- 一种用于鉴定晚熟脐橙WS22的分子标记及其应用
- 本发明公开了一种用于鉴定晚熟脐橙种质WS22的分子标记及其应用，该分子标记命名为CsChr4‑WS22，核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，位于脐橙的Chr4染色体上，其中Chr4染色体第5095156‑675795...
- 陈健美林怡万书贝袁壬生陈琼
- 甜橙NHX基因家族的鉴定及功能分析被引量：3
- 2022年
- Na^(+)/H^(+)逆向转运(Na^(+)/H^(+)exchange or antiporter, NHX)蛋白家族的氨基酸序列具有Na^(+)/H^(+)exchange蛋白结构域,在植物生长发育和非生物胁迫应答中发挥重要作用。为探究甜橙(Citrus sinensis)NHX基因家族的生物学特性,本研究从甜橙基因组中鉴定出6个NHX基因家族成员,并对其理化性质、基序组成、进化关系、表达谱等进行分析。结果显示,CsNHXs编码蛋白的长度为407~543个氨基酸,分子量为44.71~59.97 ku;所有CsNHXs非均匀地分布在5条染色体上,均具有保守的Na^(+)/H^(+)exchange结构域;蛋白质二级结构分析结果表明,甜橙NHX蛋白主要以α-螺旋和无规则卷曲为主。与拟南芥(Arabidopsis thaliana)、水稻(Oryza sativa)的NHX蛋白一起构建的系统进化树聚类为3个亚群,甜橙NHX蛋白分布在Endo和Vac亚群中。顺式作用元件预测分析结果表明,CsNHXs启动子区域包含多个植物的生长发育响应元件、激素响应元件和逆境响应元件。转录组数据分析结果表明,CsNHXs在甜橙不同组织中的表达存在差异性,总体上分为特异性表达和普遍性表达。本研究系统分析了甜橙NHX基因家族,为进一步阐明甜橙NHX基因家族的功能提供了理论依据。
- 杨杰陈蓉胡文娟吴巧玲佟晓楠李兴涛李兴涛
- 关键词：甜橙生物信息学顺式作用元件
- 脐橙早熟芽变及其早熟性状回复型材料的AFLP和MSAP分析被引量：1
- 2022年
- 【目的】探究不同成熟期的脐橙在基因组、甲基化修饰水平和变异模式方面的差异,为挖掘早熟性状分子标记,探讨脐橙早熟芽变性状与DNA甲基化的关系及早熟性状相关候选基因的筛选奠定基础。【方法】以纽荷尔脐橙、纽荷尔早熟芽变品种赣南早脐橙及赣南早的早熟性状回复型突变体(性状回复型)为试材,采用扩增片段长度多态性技术(amplified fragment length polymorphism,AFLP)和甲基化敏感扩增多态性分析(methylation sensitive amplification polymorphism,MSAP)对其在基因组、甲基化修饰水平和变异模式方面的差异与脐橙早熟性状之间的关系进行探究。【结果】采用AFLP与MSAP技术均发现较多多态性条带,其中AFLP的多态性占比(5.5046%~5.5556%)高于MSAP(1.3699%~3.2110%),发现7对引物共8条多态性条带与脐橙熟期性状共分离。试材DNA甲基化发生频率为13.7614%~16.8182%,平均14.9116%,全甲基化为主要的甲基化方式。试材超甲基化发生频率显著高于去甲基化发生频率,性状回复型果实熟期回复推测与CHG去甲基化相关。【结论】在基因层面证明性状回复型为赣南早的回复型突变体。脐橙果树在形成不同熟期芽变材料过程中,基因组DNA的超甲基化与去甲基化同时发生,但以超甲基化为主。本研究为进一步阐明脐橙果实熟期性状的发生发展机制提供指导。
- 赖春旺周小娟米兰芳陈健美欧阳欢钟八莲
- 关键词：脐橙芽变AFLPMSAP
