王晓龙
- 作品数：2 被引量：1H指数：1
- 供职机构：西北农林科技大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 糜子miRNAs的生物信息学预测及实验验证被引量：1
- 2012年
- microRNA是一类在转录后调控中发挥重要作用的非编码小RNA,其靶标参与高等植物的发育、代谢、胁迫应答等生物学过程.糜子是一类重要的禾谷类作物,但目前还未见与其相关的miRNA报道.通过基于表达序列标签和miRNA前体二级结构的同源搜索,鉴定到43个新的miRN As.这些miRN As不均匀地分布于11个miRNA家族.利用psRNAtarget对这些miRN As分析表明,它们调控68个靶标基因.11个miRN As家族中的10个参与了RNA调控,表明了它们在糜子转录后调控中的基本作用.利用Northern blot对8个家族的miRN As进行了鉴定,表明本实验的预测方法是有效的.
- 武永军杜江峰王晓龙方晓峰单卫星梁宗锁
- 关键词：MICRORNA糜子靶标
- 寄生疫霉菌侵染拟南芥相关microRNA靶标调控网络分析
- 2011年
- 【目的】分析寄生疫霉菌侵染胁迫下拟南芥表达的microRNA,为探明microRNA对应靶标基因的调控网络及其可能的病理学和生物学功能奠定基础。【方法】以寄生疫霉菌(Phytophthora parasitica)和模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)为材料,鉴定在病菌侵染胁迫下拟南芥表达的microRNA,构建其靶标调控网络,并进行Gene Ontology和蛋白质结构域富集分析。【结果】在寄生疫霉菌侵染拟南芥的Solexa测序文库中鉴定39条拟南芥microRNA,筛选出了5个转录因子相关的调控网络;Gene Ontology富集结果表明,在生物学过程中,转录调控相关的基因显著富集;蛋白质结构域富集结果表明,靶基因中转录因子显著富集。【结论】拟南芥响应寄生疫霉菌microRNA靶标基因的功能主要集中在转录因子的调控功能上。
- 张伟徐珂王秦虎王晓龙单卫星
- 关键词：MICRORNA生物胁迫调控网络
