张丹
- 作品数:105 被引量:147H指数:8
- 供职机构:上海市农业科学院更多>>
- 发文基金:国家科技支撑计划国家现代农业产业技术体系建设项目上海市科技兴农推广项目更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 一种金针菇蓝光受体蛋白FfCry-DASH基因及其应用
- 本发明公开了一种金针菇蓝光受体蛋白FfCry‑DASH及其编码基因,以及金针菇蓝光受体蛋白FfCry‑DASH基因用于调控金针菇生长的应用。本发明的FfCry‑DASH基因是一种蓝光受体蛋白基因,其在金针菇中超量表达,可...
- 刘建雨尚晓冬李婧霆宋春艳王瑞娟陆欢李巧珍于海龙李玉周峰张丹杨慧
- 一种金针菇上研2号菌种及其SSR标记指纹图谱的鉴定方法和构建方法与应用
- 本发明公开了一种金针菇上研2号菌种及其SSR标记指纹图谱的鉴定方法和构建方法与应用,包括该指纹图谱由6对SSR标记组成。构建方法包括:(1)菌丝培养;(2)基因组DNA的提取;(3)SSR分子标记的检测;(4)毛细管电泳...
- 尚晓冬王瑞娟陆欢徐珍刘建雨张丹宋春艳杨慧
- 文献传递
- Label-free定量蛋白质组学技术揭示MeJA对金针菇菌丝体次级代谢的影响被引量:3
- 2020年
- 通过在液体培养基中添加100μmol·L-1茉莉酸甲酯培养金针菇(Flammulina filiformis)菌丝,利用Label-free非标记定量蛋白质组学技术研究茉莉酸甲酯对金针菇菌丝体次级代谢的影响,并测定了代谢产物的含量。结果显示:与对照组比较,267个蛋白质的表达量上调,156个蛋白质的表达量下调,共有423个差异表达蛋白质;表达差异大于2倍的蛋白质中,32个蛋白质之间存在相互作用。KEGG富集分析显示,差异表达蛋白质主要富集于次级代谢途径,包括次级代谢产物、甾醇类化合物生物合成途径;其中,苯丙氨酸解氨酶和细胞色素P450单加氧酶分别上调3.92、7.54倍,呈极显著差异。三个萜烯类物质(齐墩果酸、熊果酸和山楂酸)的含量比对照组显著提高;激素类物质中,茉莉酸、茉莉酸异亮氨酸复合物、茉莉酸甲酯的含量分别是对照的18.84、33.53、3.18倍。研究结果为进一步探究茉莉酸甲酯对金针菇次级代谢的调控机制和信号转导提供参考。
- 崔海洋蒋佩钰徐珍李巧珍李玉周峰尚晓冬孙伟明刘建雨张丹
- 关键词:茉莉酸甲酯蛋白质组学次级代谢苯丙氨酸解氨酶
- 一种金针菇川黄菌种的SSR标记指纹图谱与应用
- 本发明涉及一种金针菇川黄菌种的SSR标记指纹图谱与应用,该指纹图谱由6对基于金针菇基因组序列开发的SSR标记的特异等位片段组合而成。应用包括:对金针菇菌种进行SSR标记扩增,将得到的带型与指纹图谱对照,与该指纹图谱一致即...
- 谭琦陆欢王瑞娟章炉军徐珍张丹尚晓冬
- 文献传递
- 镉在香菇子实体不同部位及不同生长发育阶段的分布研究被引量:1
- 2023年
- 以9株香菇菌株为供试材料,通过添加外源镉的方式研究香菇子实体不同部位、不同出菇潮次、子实体不同发育阶段镉含量的差异。结果表明:子实体不同部位镉含量从高到低依次为菌褶>菌盖>菌柄;第一潮菇子实体菌盖的镉含量高于第二潮菇子实体菌盖的镉含量;不同发育阶段菌盖的镉含量依次为原基期>生长期>成熟期>开伞期。建议后续研究中香菇重金属镉的取样时期为第一潮菇子实体成熟阶段的菌盖部位。
- 于海龙翟丹丹张美彦张美彦章炉军张丹尚晓冬李巧珍
- 关键词:香菇镉子实体发育阶段
- 利用常压室温等离子体诱变选育工厂化金针菇新菌株被引量:3
- 2023年
- 为确定金针菇常压室温等离子体处理的诱变致死率,创制工厂化金针菇新种质,本研究以上研1号菌株作为亲本,收集其孢子进行常压室温等离子体诱变后,采用多孢自交技术获得新菌株,再经工厂化小试初筛和中试复筛,最终获得新种质。结果表明,从108个突变自交菌株中获得出芽快且整齐、产量高、商品性状优良(菌盖厚实、菌柄较粗)的金针菇新品种上研A130,该品种为白色,菌盖呈球形、内扣,菌柄基部绒毛少,子实体干品中必需氨基酸总含量为2.57×10^(4)mg·kg^(-1)。工厂化栽培条件下,菌丝培养温度为20℃,子实体生长发育温度为4~18℃,瓶栽菌丝培养周期为22 d,子实体生育时间为26 d,平均单瓶产量为每瓶456.41 g。本研究结合新型诱变技术和传统选育方法,提高了亲本的突变率,为筛选具有目标性状的工厂化金针菇新菌株提供了数据支撑,对金针菇产业持续发展具有实践价值。
- 陆欢刘建雨杨慧张丹宋春艳谭琦王瑞娟尚晓冬
- 关键词:金针菇新品种选育
- 一种双孢蘑菇遗传转化的方法
- 本发明公开了一种双孢蘑菇遗传转化的方法,涉及双孢蘑菇分子遗传转化技术领域。本发明公开的方法包括:将双孢蘑菇液体菌丝接种至米粒培养基中,置于20‑25℃条件下进行预培养,培养至米粒表面长出双孢蘑菇菌丝;其中,预培养期间每天...
- 刘建雨尚晓冬宋春艳谭琦徐珍李巧珍张丹王瑞娟于海龙章炉军张美彦杨慧李玉周峰姜宁
- 文献传递
- 基于金针菇全基因组的赖氨酸合成途径关键酶分析被引量:9
- 2016年
- 【目的】以金针菇全基因组测序数据为基础研究其L-赖氨酸的从头合成途径及其关键基因。【方法】采用Illumina Hiseq2000和Roche454 FLX+两种方法完成金针菇单孢菌株Dan3的基因组测序,基于全基因组序列筛选金针菇中赖氨酸生物合成的关键基因,并分析这些基因编码的蛋白质基本理化性质;预测其亚细胞定位情况及蛋白的二级结构。【结果】金针菇Dan3全基因组序列长度为34.17 Mb,预测到8个参与α-氨基己二酸途径的关键基因,这些基因都含有多个内含子和外显子,二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成,有3个蛋白定位于线粒体。【结论】金针菇是通过α-氨基己二酸途径合成赖氨酸,基因组中预测到与该途径相关的几乎所有的酶。
- 刘建雨王瑞娟张丹尚晓冬谭琦
- 关键词:金针菇
- 金针菇单核体DAN3和M与其杂交双核体G1菌丝阶段基因表达差异的转录组初步分析
- 2016年
- 以金针菇(Flammulinavelutipes)单核菌株DAN3的基因组为参考,完成单核体DAN3和M及其杂交双核体G1在菌丝阶段的转录组测序与数据分析,比较两个样本间的差异基因,并对差异基因进行GO功能分析和KEGG pathway分析。结果表明:两个样本中共有显著性差异表达的基因86个,其中,在G1中呈上调、下调表达的基因数分别为41、45个,有2个基因在G1中特异表达。GO功能分析结果表明,86个差异基因中有40个基因比对上了GO功能注释,其中18个基因在G1中呈上调表达;单一生物过程和催化活性为显著性富集的功能,相关基因在G1中呈上调表达。KEGG pathway分析结果表明,22个差异基因被定位到17条Pathway,其中10个基因在G1中呈上调表达,包括赖氨酸代谢途径对应基因,3_M和G1菌丝样品中赖氨酸含量分别为1.70×103 ng/mg和1.06×103 ng/mg,说明G1中上调的基因可能与之降解相关;DNA复制是显著性富集的代谢途径,相关基因在G1中呈下调表达。
- 徐珍刘建雨张丹王瑞娟潘迎捷谭琦尚晓冬
- 关键词:菌丝转录组差异表达基因
- 一种用于鉴定香菇同一菌株不同单核体交配型B的InDel分子标记及方法
- 本发明公开一种用于鉴定香菇同一菌株不同单核体交配型B的InDel分子标记及方法,所述InDel分子标记的碱基序列选自:SEQ ID NO.1;鉴定香菇同一菌株不同单核体交配型B的方法包括以下步骤:S1、获取香菇的DNA;...
- 于海龙沈秀芬章炉军张美彦尚晓冬宋春艳谭琦李巧珍刘建雨张丹
- 文献传递