王军
- 作品数：3 被引量：3H指数：1
- 供职机构：山东大学化学与化工学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中国博士后科学基金山东省博士后创新项目更多>>
- 相关领域：理学更多>>
- 恢复蛋白Recoverin正则模式分析的理论研究被引量：1
- 2009年
- 采用旋转平移块方法对Ca2+/豆蔻酰基开关进行了正则模式分析(NMA).研究结果表明,恢复蛋白(Recoverin)的T态的N-末端与C-末端易于发生刚体逆向旋转,一旦结合Ca2+,很容易发生构象变化,形成具有双向构象转变特征的I态.I态是一个中间结构,既可以发生构象回转到T态,又可以继续相对旋转到R态,使豆蔻酰基完全暴露,从而行使其信号传导生物功能.从低频振动模式分析可以看出,恢复蛋白具有构象转变这一本质属性.
- 李吉来耿彩云步宇翔陈效华王军黄旭日孙家锺
- 关键词：信号传导低频振动
- 与DNA空穴迁移有关的负解离能态相关性质研究
- 长程的DNA空穴迁移是现在研究的一个热点话题。单电子氧化的DNA形成的空穴能够通过π堆积效应沿着DNA链迁移,由于鸟嘌呤的电离势在四个碱基中最小,氧化破坏的位置一般在鸟嘌呤碱基上。氧化破坏的鸟嘌呤被认为是突变和致癌作用的...
- 王军
- 关键词：质子转移溶剂化效应密度泛函
- 文献传递
- 与蛋白质调控DNA空穴迁移相关的具有负离解能特征的亚稳态氢键（英文）被引量：2
- 2015年
- 利用密度泛函理论方法研究了作为空穴迁移载体的蛋白质复合的DNA三聚体(Protonated arginine…guanine…cytosine,Arg H+-GC)的氢键性质.结果表明,空穴迁移通过该载体单元时此类氢键表现为亚稳态,且具有明显的负离解能.正常情况下Arg H+基团在大小沟均能与GC碱对形成氢键,且具有正的离解能.然而,当空穴转移至此将削弱氢键至亚稳态,使之具有一定的离解势垒和负的离解能.这种势垒抑制的负离解能现象意味着由于空穴俘获导致此三聚体结构单元在它的Arg H+…N7/O6键区储存了一定的能量(约108.78 k J/mol).该氢键离解通道受控于此键区两个相关组分之间的静电排斥和氢键吸引之间的平衡以及这两个相反作用随氢键距离不同的衰减速率.基于电子密度分布的拓扑性质以及键临界点的Laplacian数值分析澄清了此类特殊的能量现象主要源自通过高能氢键(Arg H+…N7/O6)连接的授受体间的静电排斥.进一步空穴俘获诱导的G→C质子转移可扩展负离解能区至Arg H+…N7/O6和Watson-Crick(WC)氢键区.另外,Arg H+结合到GC的大小沟增加其电离势,因此削弱其空穴传导能力,削弱程度取决于Arg H+与GC的距离.推而广之,在protonated lysine-GC和protonated histidine-GC体系也可观察到类似的现象.显然,此类性质可调的亚稳态氢键可调控DNA空穴迁移机理.此工作为理解蛋白质调控的DNA空穴迁移机理提供了重要的能量学信息.
- 王梅王军步宇翔
- 关键词：空穴俘获
