公共文化服务平台

基于单标记和单倍型的肉牛全基因组关联分析: 近年来随着高通量测序技术的飞速发展,使得通过SNP与数量性状之间的关联分析来实现基因的精细定位成为可能。这项技术不仅在人类疾病应用方面实现了巨大突破,其他经济动物全基因组关联研究也飞速发展。相比于单标记分析,全基因组单倍...; 吴洋樊惠中齐欣陈燕高雪张路培李俊雅高会江; 关键词：全基因组关联分析单倍型单核苷酸多态性; 文献传递

一步法进行表型缺失数据的基因组育种值估计研究: 随着大数据时代的到来,基因组选择作为一种取代传统动物育种工作的新兴育种技术,引起全世界动物育种界的广泛关注。相对于奶牛基因组选择,由于我国奶牛DHI报告的实施以及中国荷斯坦青年公牛联合后裔测定规程的发布,奶牛表型数据的采...; 朱波吴洋牛红张静静陈燕张路培高雪高会江李俊雅; 关键词：肉牛基因组育种值估计一步法; 文献传递

利用混合线性模型和BayesCPi进行QTL-MAS2011公共数据集的全基因组关联分析被引量：1: 2014年; 本研究利用MTDFREML对QTL-MAS2011公共数据集的模拟性状进行方差组分估计,遗传力估计约为0.29。主成分分析显示,群体内不存在显著的群体分层现象,然后用2种模型进行全基因组关联分析研究。利用GAPIT程序包中的混合线性模型对QTL-MAS2011公共数据进行全基因组关联分析,共得到10个显著的单核苷酸(SNP)位点(P<0.05),其中,4个显著的SNPs在1号染色体上,4个显著的SNPs在3号染色体上,2个显著的SNPs在5号染色体上。使用HAPLOVIEW软件对1~3号染色体上88个SNPs进行连锁不平衡(Linkage disequilibrium,LD)分析,确定2个QTLs(QTL1和QTL5)分别在1号和3号染色体上,2、4、5号染色体没有检测到QTL。利用BayesCPi模型进行全基因组关联分析研究,通过基因组窗口效应方差图谱确定1个QTL在1号染色体上,2个QTL在2号染色体上,1个QTL在3号染色体上。; 朱波吴洋齐欣牛红张静静王延晖陈燕张路培高会江高雪李俊雅孙少华; 关键词：混合线性模型贝叶斯模型全基因组关联分析单核苷酸多态性

利用SNP标记估计西门塔尔牛亲缘关系系数的准确性被引量：5: 2016年; 本研究旨在利用SNP标记估计西门塔尔牛亲缘关系系数,以期准确确定估计个体间亲缘关系系数所需的SNPs数量。研究以1 059头出生于2008-2012年的西门塔尔牛为试验群体,利用Illumina bovineHD(770k)芯片,根据最小等位基因频率(MAF)区间,分别选择100、500、1 000、1 500、2 000、2 500和3 000个SNPs用于个体间亲缘关系系数的估计。结果显示,随着标记数目的增多,估计的亲缘关系系数准确性逐渐增加。且当SNP标记数目达到2 500时,所估计的亲缘关系系数与利用所有标记估计的个体间亲缘关系系数差异不显著,二者相关系数达到0.89以上。同时,利用不同等位基因频率区间内标记估计的个体间亲缘关系系数差异不显著。由此可以看出,当所选标记数目达到2 500以上时,可以得到较高的亲缘关系系数估计准确性。本研究为基于SNP标记信息估计亲缘关系系数的进一步研究提供了理论基础,同时为西门塔尔牛群体个体间亲缘关系的研究提供依据。; 张静静高会江吴洋朱波齐欣高雪张路培陈燕; 关键词：SNP

一种改进的基于通路的全基因组关联分析算法: 本发明公开了一种改进的基于通路的全基因组关联分析算法，首次使用主成分分析法和最大均值法来构建基因统计量，剔除了SNP之间的互作效应，有效的解决了基因内部SNP连锁的问题，我们将这种策略应用于西门塔尔肉牛GWAS数据中，找...; 高会江樊惠中李俊雅夏江威吴洋张路培高雪陈燕郭鹏; 文献传递

中国西门塔尔牛肉用群体重要经济性状遗传参数估计被引量：12: 2016年; 本研究旨在对出生于2008-2013年的中国西门塔尔牛肉用群体的重要经济性状进行遗传参数和方差组分估计,该群体大小为2 939头。采用非求导约束最大似然法估计遗传力、遗传相关和方差组分。结果显示,初生重、断奶重、出栏重、胴体重、屠宰率和净肉率的遗传力估计值分别为0.48、0.44、0.43、0.38、0.31、0.39。其中,初生重和断奶重的遗传相关估计结果为0.57,出栏重和胴体重的遗传相关为0.94,屠宰率和净肉率的遗传相关为0.89。该群体的生长和屠宰相关性状均属于中高遗传力性状,且性状之间具有较高的遗传相关。本研究对中国西门塔尔牛肉用群体重要经济性状的遗传参数做了系统评估分析,为将来制定育种方案和遗传评估奠定基础。; 牛红宝金山吴洋朱波张文刚夏江威宋禹昕郭鹏徐凌洋陈燕高雪张路培高会江李俊雅; 关键词：方差组分

中国肉牛育种新技术研究的进展: 随着人民生活水平的提高,膳食结构得到很大改善,人们对肉牛育种的需求已经不仅仅满足于过去的量的提高,追求牛肉品质已经成当今肉牛育种产业一个重要的主题,这对保持社会安定团结具有重要的战略意义。本文对我国现阶段肉牛育种相关技术...; 薛景龙吴洋朱波牛红高会江李俊雅; 关键词：MOET MAS 转基因技术克隆技术 GS; 文献传递

利用SNP标记估计西门塔尔牛亲缘关系系数的准确性: 本研究旨在利用SNP标记估计西门塔尔牛亲缘关系系数,以期准确确定估计个体间亲缘关系系数所需的SNPs数量。研究以1 059头出生于2008至2012年的西门塔尔牛为研究群体,利用Illumina 770k SNP芯片,根...; 张静静高会江吴洋朱波齐欣高雪张路培陈燕; 关键词：SNP; 文献传递

基于牛低密度SNP芯片分析我国黄牛品种种间关系和遗传进化: 本研究利用Illumina Bovine(26K)和Illumina Bovine(19K)低密度基因分型芯片,检测了6个本地黄牛品种、6个杂交品种和2个培育品种共计848个样本。通过主成分分析(PCA),研究样本大致分...; 张文刚吴洋张静静牛红高雪张路培高会江陈燕李俊雅; 关键词：遗传进化本地黄牛; 文献传递

一种改进的基于通路的全基因组关联分析算法: 本发明公开了一种改进的基于通路的全基因组关联分析算法，首次使用主成分分析法和最大均值法来构建基因统计量，剔除了SNP之间的互作效应，有效的解决了基因内部SNP连锁的问题，我们将这种策略应用于西门塔尔肉牛GWAS数据中，找...; 高会江樊惠中李俊雅夏江威吴洋张路培高雪陈燕郭鹏

渝B2-20050021-1　渝公网安备 50019002500403号　违法和不良信息举报中心　互联网出版许可证　新出网证(渝)字10号

吴洋