陈超
- 作品数：74 被引量：329H指数：11
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- 相关领域：医药卫生理学文化科学生物学更多>>
- 基于小波包的同源蛋白质特征提取
- 基于小波包分析提出一种新的同源蛋白特征提取的方法,将每个节点的小波包能量均值作为同源蛋白质序列的特征向量分析了血红蛋白的遗传和变异情况,结果表明小波包能量对于同源蛋白质功能的研究具有重要意义.
- 田元新陈超邹小勇蔡沛祥
- 关键词：小波包血红蛋白同源蛋白
- 文献传递
- AB-8型大孔吸附树脂纯化复方通脉颗粒有效部位的工艺优选被引量：4
- 2013年
- 目的:优选复方通脉颗粒的大孔树脂纯化工艺。方法:以总酚酸,葛根素的吸附-洗脱率为指标,采用单因素试验考察上样液质量浓度、径高比、洗脱剂等对复方通脉颗粒大孔树脂纯化工艺的影响。结果:优选的纯化工艺为上样液质量浓度110 g.L-1,树脂柱径高比1∶10,树脂体积与上样量比2.8∶1(吸附3 h),加2BV水洗除杂,用6 BV 50%乙醇洗脱,收集洗脱液。结论:该纯化工艺合理、稳定,可推广于大生产应用。
- 陈超陈国芹陈阿丽崔红花郭嘉雯王淑美
- 关键词：大孔吸附树脂纯化工艺总酚酸葛根素
- 分子对接技术虚拟预测人参治疗缺血性脑卒中的物质基础被引量：3
- 2016年
- 目的:在分子对接技术的基础上研究人参治疗缺血性脑卒中的作用机制。方法:采用分子对接技术筛选人参的活性分子并与20种缺血性关键靶点对接,通过Cytoscape 3.1.1软件构建多成分-蛋白靶点网络模型,同时将人参中的Rb2和20(R)-人参皂苷Rg2两个活性分子与脑缺血的关键蛋白VEGF和Caspase-3进行模式结合分析。结果:经过分子对接发现,与5个及5个以上的蛋白靶点有良好结合活性的人参活性分子31个,其中与10个及10个以上的蛋白靶点有良好结合活性的分子只有4个。人参中的Rb2和20(R)-人参皂苷Rg2这两个活性分子分别与VEGF和Caspase-3靶点有很强烈的结合性,对接得分均大于7.0。结论:分子对接技术被运用于虚拟筛选人参治疗缺血性脑卒中的活性物质具有实际意义,为今后能够更加深入地研究中药复方奠定了基础。
- 邓桂珠吴纯伟林捷欣陈超王淑美
- 关键词：人参分子对接脑缺血
- D-最优设计响应面法优选芪枣口服液提取工艺被引量：2
- 2017年
- 目的采用D-最优设计响应面法优选芪枣口服液提取工艺。方法以提取工艺中加水量、煎煮时间及煎煮次数等参数为自变量,进行D-最优设计;以黄芪甲苷总量为因变量,进行响应面分析。结果优选芪枣口服液最佳提取工艺为:加水量12倍、煎煮时间1.53 h、煎煮次数3次。结论 D-最优设计响应面法能够优选芪枣口服液提取工艺,有利于提高有效成分含量和保证口服液疗效。
- 涂名扬陈超王淑美梁生旺徐吉银成金乐
- 关键词：黄芪甲苷
- 基于随机森林算法的川芎成分-靶点-疾病网络的预测研究被引量：9
- 2014年
- 该研究搜集KEGG数据库中小分子药物及其酶、离子通道、G蛋白、核蛋白等4类药靶数据作为训练集,建立基于随机森林法的药物-靶点相互作用模型;采用十折交叉验证评价模型精度,获得4类药靶模型的预测正确率分别为71.34%,67.08%,73.17%,67.83%。利用该模型对川芎26个化学成分进行靶点预测,并构建其成分-靶点-疾病网络,所得结果得到了较好的文献验证。该文所建模型具有较高的预测精度,可用于发现其他中药成分的潜在作用靶点。
- 苑婕李晓杰陈超宋向岗王淑美
- 关键词：网络药理学川芎心脑血管疾病
- 不同提取方法考察盘龙参药材山奈酚含量测定
- 2013年
- 目的:以山萘酚含量为指标,探讨盘龙参的合适提取方法。方法:盘龙参全草用95%乙醇溶液,经索氏、超声和回流3种提取方法,分别对提取液进行HPLC法测定山萘酚的含量。结果:索氏、超声和回流3种不同提取方法,所得到的山萘酚的含量(mg/g)分别为2.528、0.812、0.968。结论:索氏取方法为从盘龙参药材中提取黄酮的最佳方法。
- 尹永芹崔红花严优芍陶曙红陈超
- 关键词：山奈酚
- 基于分子对接及生物网络功能模块识别的复方丹参滴丸的网络药理学研究被引量：15
- 2017年
- 目的运用分子对接及生物网络功能模块识别等网络药理学技术,阐述复方丹参滴丸治疗动脉粥样硬化的物质基础和作用机制。方法首先通过分子对接技术确定复方成分和靶点的对应关系,结合由分子相似性构建的复方成分-成分网络,以及靶点相互作用网络,建立了二阶异质网络;然后经模式分析,将二阶异质网络拆解为不同功能的模块。结果模块分析结果显示,复方丹参滴丸治疗动脉粥样硬化的机制涉及炎症、免疫和氧化应激;进一步分析复方成分作用通路,得出了复方主要作用成分,包括丹参素、原儿茶醛、丹参酮Ⅵ等。结论本方法为阐释中药复方多成分、多靶点、多途径的作用机制等同类研究提供了参考。
- 袁文锋涂铭扬陈超王淑美梁生旺
- 关键词：分子对接复方丹参滴丸
- 基于小波包能量的血红蛋白序列特征提取被引量：2
- 2007年
- 本文基于小波包变换研究了不同物种血红蛋白α链和β链的能量分布情况,结果表明小波包能量作为同源蛋白质的特征向量,不仅能够体现出蛋白质的同源性,而且也能反映出蛋白质在进化过程中的遗传变异情况,并从分子水平揭示了医学上用猪血代替人血解决血液短缺问题的缘由,为蛋白质功能的研究提出了一种新的研究思路。
- 田元新陈超邹小勇蔡沛祥
- 关键词：特征向量同源蛋白
- 基于BiPLS和cPLS的苯丙酮尿症FTIR/ATR光谱筛查模型的建立与优化
- 2015年
- 目的：基于反向区间偏最小二乘法（BiPLS）和多模型共识偏最小二乘法（cPLS）,建立新生儿苯丙酮尿症的FTIR/ATR光谱筛查模型。方法：利用BiPLS将全光谱划分成若干个子区间,优化子区间数目,优选特征子区间组合,然后分别建立基于全光谱和BiPLS优选波段的定量模型,以均方根误差（RMSE）、平均相对误差（MRE）、预测准确率（Acc）、灵敏度（Sens）、特异性（Spec）为指标,比较2种模型的性能。结果：与全光谱相比,BiPLS优选波段将波长压缩了85.0%~90.5%,但所建模型的多项性能指标却有不同程度地提高。在最优条件下,Phe浓度模型的R、RMSE、MRE分别为0.93、87.0、0.27,Sens、Spec、Acc分别为98.2、98.7和98.4;Phe/Tyr比值模型的R、RMSE、MRE分别为0.93、3.55、0.36,Sens、Spec和Acc均为100。Phe浓度模型对接近筛查切值的样本会产生误判,而辅以Phe/Tyr比值模型可将Sens和Spec提高到100。结论：BiPLS极大地压缩了建模所需波段,降低了模型复杂度,提高了模型精度;与cPLS相结合,本文建立的Phe浓度和Phe/Tyr比值的定量校正模型,有望用于新生儿苯丙酮尿症的大人群快速筛查。
- 王伟伟魏伟伟宋向岗程雅婷陈超王淑美梁生旺
- 关键词：苯丙酮尿症
- 基于基因表达谱与分子指纹技术研究复方丹参滴丸治疗颈动脉粥样硬化的物质基础和作用机制被引量：9
- 2015年
- 该文利用基因表达谱和分子指纹技术研究探讨复方丹参滴丸治疗颈动脉粥样硬化的物质基础和作用机制。首先,收集人颈动脉粥样硬化和正常组织的基因表达谱数据,采用芯片显著性分析(significance analysis of microarray,SAM)方法筛选出差异基因;利用DAVID软件对差异基因进行GO分析和KEGG通路分析;为了避免遗漏部分差异表达不显著却有重要生物学意义的基因,文中进行了GSEA分析;将差异基因集输入到Cmap,获得7个负性富集分数较大的药物分子,预示这些药物能逆转调控疾病组织的基因表达谱;最后,根据结构相似的分子具有相似活性的特点,将复方丹参滴丸的336个成分与7个药物分子进行2D分子指纹的相似度比较。结果显示:SAM法筛选得到147个差异基因,其中上调基因60个,下调基因87个。GO分析中,生物过程(biological process)主要涉及生物附着、损伤反应和炎症反应等;细胞组成(cellular component)主要涉及胞膜外区、细胞外隙和质膜等;分子功能(molecular function)主要涉及抗原结合、金属内肽酶活性和多肽结合等。KEGG通路分析主要涉及JAK-STAT,RIG-I样受体和PPAR等信号通路。复方中有10个成分与Cmap筛选出的药物分子具有非常相似的结构(Tanimoto系数均大于0.85),如hexadecane,提示可能是复方丹参滴丸治疗颈动脉粥样硬化的主要药效成分。该方法可用于研究中药复方的药效物质基础和分子作用机制。
- 周威宋向岗陈超王淑美梁生旺
- 关键词：基因表达谱分子指纹丹参滴丸
