陈旭
- 作品数：1 被引量：4H指数：1
- 供职机构：四川农业大学玉米研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 玉米microRNAs及其靶基因的生物信息学预测被引量：4
- 2009年
- microRNAs(miRNAs)是一类非编码的小分子RNA,通过碱基互补调控靶基因的表达。鉴定和发现新的miRNAs及其靶基因,对揭示miRNAs在基因表达调控中的作用至关重要。玉米全基因组测序工作开展较晚,已经鉴定登记的miRNAs很少,对靶基因的调控作用尚待解明。文章根据miRNA进化上的保守性,以已知的植物miRNAs为探针,与相关数据库中玉米表达序列标签(EST)和基因组序列(GSS)中的非编码序列比对,共发现11个新的miRNA前体。虽然在序列长度和二级结构方面各有变化,但这11个前体均可折叠形成miRNA家族的标准二级结构。通过靶基因预测,找到其中7条miRNAs的26个靶基因,分别编码与新陈代谢、信号转导、转录调节、跨膜运输、生物和非生物胁迫及叶绿体组装等相关的蛋白。这些miRNAs及其靶基因的鉴定,补充了miRNA数据库的不足。
- 陈旭李晚忱付凤玲
- 关键词：生物信息学玉米MICRORNA靶基因
