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黄冬冬
作品数:
2
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供职机构:
苏州大学
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发文基金:
香港保健协会资助项目
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相关领域:
医药卫生
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合作作者
顾振纶
苏州大学神经科学研究所衰老与神...
周文轩
香港保健协会
王尉平
苏州大学医学部生物化学与分子生...
蒋小岗
苏州大学神经科学研究所衰老与神...
郭次仪
香港保健协会
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C57小鼠
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博来霉素
机构
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苏州大学
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作者
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黄冬冬
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蒋小岗
1篇
王尉平
1篇
周文轩
1篇
顾振纶
传媒
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苏州大学学报...
年份
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2010
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基于BRB-ArrayTools挖掘与TGF-β致肺纤维化疾病的相关分子靶点
目的:基于生物信息学方法在两种肺纤维化疾病模型中探寻TGF-β致肺纤维化疾病的分子靶点。 方法:运用BRB-ArrayTools软件,从TGF-β作用肺成纤维细胞基因芯片数据集GSE1724和BLM作用C57...
黄冬冬
关键词:
基因芯片
肺纤维化
差异表达基因
TGF-Β
文献传递
博来霉素致C57小鼠肺纤维化分子靶点的探寻
2010年
目的探寻博来霉素(BLM)致C57小鼠肺纤维化分子靶点。方法应用BRB-ArrayTools软件中justR-MA算法分析BLM(实验组)和生理盐水(对照组)作用于C57小鼠1、3、14d后肺组织基因表达谱数据集GSE485,找出差异表达基因;应用DAVID在线工具对这些基因进行功能聚类,结合《京都基因与基因组百科全书》和BioCar-ta进行生物学通路分析;应用MSigDB搜寻[-2kb,2kb]区域富集的转录因子结合位点。结果分别筛选出190、345、527个差异表达基因;按功能显著聚集的有趋化因子、膜蛋白、血清蛋白、补体成分、免疫球蛋白、钙黏蛋白、基质金属蛋白酶、前胶原类;受调控的有Toll样受体、CCR5、ECM受体、补体途径、TGF-β生物学通路;富集度较高的有AP1、SRF、NFKAPPAB转录因子。结论 AP1、SRF和RhoA可能是BLM致C57小鼠肺纤维化的分子靶点。
黄冬冬
王尉平
顾振纶
蒋小岗
周文轩
郭次仪
关键词:
博来霉素
肺纤维化
差异表达基因
转录因子
小鼠
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