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基于BRB-ArrayTools挖掘与TGF-β致肺纤维化疾病的相关分子靶点: 目的:基于生物信息学方法在两种肺纤维化疾病模型中探寻TGF-β致肺纤维化疾病的分子靶点。方法:运用BRB-ArrayTools软件,从TGF-β作用肺成纤维细胞基因芯片数据集GSE1724和BLM作用C57...; 黄冬冬; 关键词：基因芯片肺纤维化差异表达基因 TGF-Β; 文献传递

博来霉素致C57小鼠肺纤维化分子靶点的探寻: 2010年; 目的探寻博来霉素(BLM)致C57小鼠肺纤维化分子靶点。方法应用BRB-ArrayTools软件中justR-MA算法分析BLM(实验组)和生理盐水(对照组)作用于C57小鼠1、3、14d后肺组织基因表达谱数据集GSE485,找出差异表达基因;应用DAVID在线工具对这些基因进行功能聚类,结合《京都基因与基因组百科全书》和BioCar-ta进行生物学通路分析;应用MSigDB搜寻[-2kb,2kb]区域富集的转录因子结合位点。结果分别筛选出190、345、527个差异表达基因;按功能显著聚集的有趋化因子、膜蛋白、血清蛋白、补体成分、免疫球蛋白、钙黏蛋白、基质金属蛋白酶、前胶原类;受调控的有Toll样受体、CCR5、ECM受体、补体途径、TGF-β生物学通路;富集度较高的有AP1、SRF、NFKAPPAB转录因子。结论 AP1、SRF和RhoA可能是BLM致C57小鼠肺纤维化的分子靶点。; 黄冬冬王尉平顾振纶蒋小岗周文轩郭次仪; 关键词：博来霉素肺纤维化差异表达基因转录因子小鼠

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黄冬冬