马建青
- 作品数:3 被引量:1H指数:1
- 供职机构:河北农业大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家现代农业产业技术体系建设项目更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- ASIP蛋白与AgRP相关蛋白生物信息比较分析被引量:1
- 2014年
- 利用生物信息学的方法研究人、绵羊和牛等18个物种Agouti信号蛋白(ASIP)和Agouti相关蛋白(AgRP)的编码区及其对应氨基酸序列的相关特征,以期探明两种蛋白的遗传分化特点。结果表明,在ASIP与AgRP均为399bp的CDS序列中,其核苷酸保守区域的位置分别在262~399bp和230~399bp处;ASIP和AgRP在各自CDS序列多态位点变异的各项指标数值及其百分率大小上均极为接近;在46条ASIP的CDS序列及32条AgRP的CDS序列中,二者的单倍型数分别为22种和23种,ASIP和AgRP在基因的进化以及不同物种的遗传分化上具有相似性;两者的氨基酸序列在98~140aa片段处保守性较高,该区域同时富含半胱氨酸(Cys);ASIP和AgRP一级结构的理化性质表现为共性与差异并存;二者的肽链C端具有相似的三维结构,但各自也具有其结构特异性。
- 马建青李祥龙周荣艳李兰会杨清芳
- 关键词:AGOUTIASIPAGRP
- 不同毛色山羊内脏器官Agouti基因mRNA及其编码蛋白差异表达研究
- Agouti基因除了对黑色素的形成具有调控作用外,其与机体的能量代谢调控也密切相关。山羊是重要的农业经济动物,研究和探讨不同毛色山羊不同内脏器官Agouti基因mRNA及其编码蛋白的差异表达特征,可以为进行转录调控等基因...
- 马建青
- 关键词:山羊毛色ASIP
- 文献传递
- 不同物种Hsf2基因编码区生物信息分析
- 2012年
- 采用比较基因组学和生物信息学方法,分析了人、黑猩猩、长臂猿、猕猴、狨、欧洲兔、大熊猫、野猪、牛、非洲象、褐家鼠、小家鼠、荷兰猪和灰仓鼠共14个物种的热休克转录因子2(或称热激因子2,heat shock transcription factor 2,HSF2)基因编码区(CDS)的遗传多样性,并对该基因的氨基酸序列、组成成分等进行预测和推断。结果表明,在来自14个物种的40条基因序列中共检测到多态位点数203个,其中有单一多态位点68个,百分率约为9.81%,检测到单体型17种,Hsf2基因CDS在种内表现较为保守,种间则表现有较丰富的遗传多样性。Hsf2的氨基酸序列表现为亲水性,理论等电点大多小于7,表现为酸性;肽链的不稳定系数在51.90~58.13,表明多肽不稳定。
- 马建青李祥龙周荣艳李兰会任玉红
- 关键词:物种生物信息学