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陈娜娜
作品数:
2
被引量:11
H指数:2
供职机构:
南京农业大学园艺学院
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发文基金:
江苏高校优势学科建设工程资助项目
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相关领域:
农业科学
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合作作者
刘金义
南京农业大学园艺学院
王刚
南京农业大学园艺学院
王敏
南京农业大学园艺学院
程宗明
南京农业大学园艺学院
蔡斌
南京农业大学园艺学院
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机构
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南京农业大学
作者
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陈娜娜
1篇
蔡斌
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程宗明
1篇
王敏
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王刚
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刘金义
传媒
1篇
中国农学通报
年份
2篇
2013
共
2
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苹果SnRK2基因家族的鉴定和生物信息学分析
被引量:8
2013年
SnRK2是植物特有的一类Ser/Thr类蛋白激酶,在植物逆境生理过程中扮演了重要的角色。利用隐马可夫模型搜索和系统建树的方法,在苹果基因组中鉴定出了16个SnRK2基因家族成员,然后从系统发生、理化性质、二级结构、motif、C末端序列和EST等方面对其进行了预测和分析。结果表明,苹果SnRK2家族为亲水性蛋白,二级结构主要以α-螺旋和不规则卷曲为主;在系谱发生上与拟南芥、水稻、玉米所有的SnRK2蛋白一起分成了3个亚族;motif和C末端序列分析显示,苹果SnRK2蛋白激酶家族具有较高的保守性;EST表达分析显示,16个MdSnRK2在不同组织中呈不均匀分布,具有组织特异性。本研究为苹果SnRK2基因家族生物学功能的研究奠定了生物信息基础。
陈娜娜
刘金义
蔡斌
王刚
王敏
程宗明
关键词:
苹果
蛋白激酶
基因组
葡萄SnRK2基因家族的全基因组鉴定、表达分析及VvSnRK2.2基因的功能验证
葡萄(Vitis vinifera L.)是葡萄科葡萄属落叶藤本植物,是世界上广泛栽培的重要经济果树之一。随着社会的发展和人口的增多,环境日益恶化。干旱、盐渍化、高温、低温以及氧化胁迫等都严重影响植物的生长和发育,进而影...
陈娜娜
关键词:
葡萄
非生物胁迫
生物信息学
基因克隆
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