王建平 作品数:12 被引量:18 H指数:2 供职机构: 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家科技重大专项 国家重点基础研究发展计划 更多>> 相关领域: 医药卫生 更多>>
福氏志贺菌4av和Yv血清型PCR鉴定方法的建立及应用 被引量:2 2015年 目的建立福氏志贺菌4av和Yv血清型PCR鉴定方法。方法根据福氏志贺菌4av和Yv血清型O抗结构,针对O抗合成基因wzx、IV型抗原决定基因gtrIV和MASF IV-1抗原决定基因opt,建立血清型4av和Yv的PCR鉴定方法。并应用该方法对126株福氏志贺菌临床分离株进行血清型检测。结果建立了一种福氏志贺菌4av和Yv血清型PCR鉴定方法,在一个反应中包括4对引物,Yv血清型PCR扩增为wzx及opt阳性;4av血清型PCR扩增为wzx、opt及gtrIV阳性。该方法可将4av和Yv血清型与目前已知的其他福氏志贺菌血清型完全区分。对126株不同血清型福氏志贺菌临床分离株的鉴定结果显示,该方法具有很好的特异性。结论本研究建立的福氏志贺菌4av和Yv血清型PCR鉴定方法,可以用于志贺菌检测和监测。 罗霞 王建平 孙强正关键词:福氏志贺菌 PCR方法 中国福氏志贺菌优势序列型ST91获得SRL和Tn7多重耐药岛分析 2014年 目的分析中国福氏志贺菌优势序列型ST91(sequence type 91)中志贺菌耐药岛(Shigella resistance locus,SRL)和Tn7耐药岛的分布及变化情况。方法对包括14种血清型(1a[7株],1b[1株],1d[1株],2a[5株],2b[1株],3a[3株],3b[1株],4a[1株],4av[1株],4b[1株],X[9株],Xv[25株],Y[2株]和Yv[1株])和7种ST型(ST91[50株],ST109[1株],ST18[3株],ST142[1株],ST143[1株],ST103[2株],ST16[1株])的59株中国福氏志贺菌基因组中SRL、Tn7耐药岛的编码基因及核酸序列进行分析,并与参考菌株2002017和YSH600的SRL和Tn7岛进行比较。结果所有50株中国分离的福氏志贺菌ST91菌株,1株ST109和1株ST142菌株均携带SRL和Tn7岛。1株ST18菌株仅携带2个耐药岛的3个耐药基因。其他ST型菌株均未发现耐药岛。与参考菌株2002017相比,9株ST91菌株的SRL耐药岛发生了插入或缺失。其中,7株ST91菌株缺失了编码四环素耐药性的tet基因;1株ST91菌株缺失了编码β-内酰胺酶的oxa-1和编码氯霉素乙酰转移酶的cat基因;1株ST91的SRL岛上插入了1个编码广谱β-内酰胺酶的blaTEM-1基因。所有50株ST91、1株ST109和1株ST142菌株携带的Tn7岛的核酸序列和编码基因与参考菌株相比未发现差异。结论福氏志贺菌ST91型中国分离菌株均携带SRL和Tn7耐药岛。在SRL岛上发生了基因的插入和缺失。处于进化早期的ST18菌株,在获得耐药岛的过程中可能发挥了重要作用。 张楠 孙强正 王建平 代航 徐建国关键词:福氏志贺菌 山东省人感染猪链球菌基因组特征分析 被引量:5 2021年 对山东省人感染猪链球菌菌株开展基因组流行病学及病原学分析,为制定合理、精准的猪链球菌预防、控制措施提供依据。本研究对分离的猪链球菌菌株开展分子分型、基因组系统进化树、毒力基因型别、耐药谱、耐药基因及其传播元件等方面的分析,并通过比较菌株刺激宿主细胞产生细胞因子的能力评价不同菌株的致病力。结果显示,血清2型、ST1型是山东患者来源猪链球菌的优势型别,其主要临床表现为脑膜炎。系统进化树分析表明山东菌株主要由5个分枝组成。山东菌株均属高致病型菌株,但细胞因子试验表明分枝2的菌株致病力显著强于其他山东菌株。除分枝3的SD2与SD4菌株外,其余山东菌株均携带不同种类的耐药基因及其传播元件。综上,山东猪链球菌的来源及进化途径存在多样性的特征,且致病能力有显著差异,需要在基因组水平开展菌株监测的工作。 胡彬 王建平 徐迎春 刘军 李涛 贾静 姜文国 毕秀娟 曲新艺 寇增强 房明 孙娜 杨莹 康殿民 侯配斌关键词:猪链球菌 携带89K样毒力岛的猪链球菌ST665型与ST107型临床菌株的基因组及致病分析 2024年 目的明确89K样毒力岛(PAI)的基因组特征及其在猪链球菌致病及耐药传播方面的作用。方法通过生物信息学方法分析89K样PAIs的基因组特征;通过接合实验比较两种89K样PAIs的转移能力;采用最小抑菌浓度法测定临床分离株及接合子的耐药谱;通过C57BL/6小鼠和斑马鱼感染模型分别评估两个临床菌株及其89K样PAIs的接合子的致病性。结果携带89K样PAIs的猪链球菌临床菌株GX54和GX82的序列型(ST)分别为ST665和ST107。菌株GX54携带的PAI大小为75Kb,在核苷酸水平上与ST7流行型菌株携带的89K PAI具有99.21%的相似性和79.00%的覆盖率,而菌株GX82携带的PAI大小为87Kb,与89K PAI具有98.80%的相似性和86.00%的覆盖率。这两个PAIs的插入位点与89K PAI相同,均位于rplL位点,且PAIs的两端均含有一段15 bp的att序列(5’-TTATTTAAGAGTAAC-3’)。此外,这两个PAIs均具有完整的模块化结构,包含完整的NisK-NisR样双组分信号转导系统和IV型分泌系统(T4SS)。而在SalR-SalK样双组分信号转导系统中,仅SalR基因保持完整,SalK基因发生错义突变。与89K PAI相比,本研究中的两个PAIs在基因组成上呈现出一定的差异。75K PAI插入了4个基因,包括两个假定蛋白基因和两个耐药基因tet(O)和erm(B)。而87K PAI则插入了12个基因,主要涉及编码与质粒相关的重组酶和假基因,以及与耐药相关的cat、tet(L)、erm(B)基因。此外,还包括编码转座酶、拓扑异构酶等基因。菌株GX54携带的75K PAI的转移频率为4.61×10−5,显著高于菌株GX82携带的87K PAI的转移频率8.46×10^(−6)。与受体菌P1/7RIF相比,两个89K样PAIs的接合子P1/7RIF-GX54与P1/7RIF-GX82的四环素类和大环内酯类抗生素的抗性水平,以及对斑马鱼的致病力均显著增加,且两接合子组间的致病力差异无统计学意义(P>0.05)。菌株GX54和菌株GX82感染C57BL/6小鼠后,菌株GX54感染组小鼠死亡率显著高于菌株GX82感染组(P<0.05)。攻毒8 康娓铭 王鸣柳 王建平 张西燕 吴宗福 郑翰关键词:猪链球菌 耐药性 致病 福氏志贺菌血清型单重PCR鉴定方法的建立及应用 被引量:1 2012年 目的建立基于O抗修饰基因的福氏志贺菌血清型PCR鉴定方法。方法根据福氏志贺菌O抗原合成及修饰特异基因设计引物,以常见的14种福氏志贺菌血清型(包括1a、1b、1c、2a、2b、3a、3b、4a、4b、5a、Y、X、Xv和F6)为标准菌株,建立福氏志贺菌血清型单重PCR鉴定方法;并以痢疾志贺菌、宋内志贺菌、鲍氏志贺菌和腹泻相关的其他菌属菌株验证特异性;应用该方法对106株福氏志贺菌临床分离株进行PCR血清分型。结果建立一种福氏志贺菌血清型单重PCR鉴定方法,通过8个PCR反应,能够鉴定目前已知的15种血清型中的14种(Xv除外)。检测灵敏度在10pg至1ngDNA(20gl反应体系)。对106株福氏志贺菌临床分离株的检测结果提示,PCR分型方法与玻片凝集法具有很高的一致性。结论本研究建立的福氏志贺菌血清型单重PCR鉴定方法具有特异性、灵敏性,可用于临床检测。 张曙霞 王建平 金东 陈道利 刘凯 王艺婷 李振军 徐建国 孙强正关键词:福氏志贺菌 聚合酶链式反应 血清型 福氏志贺菌Xv血清型聚合酶链反应鉴定方法的建立及应用 被引量:3 2014年 目的建立福氏志贺菌Xv血清型聚合酶链反应(PCR)鉴定方法。方法根据福氏志贺菌Xv血清型O抗结构,针对O抗合成基因wzx、7;8群抗原决定基因gtr X和MASF IV-1抗原决定基因opt,建立PCR扩增鉴定方法。并应用该方法对139株福氏志贺菌临床分离株进行血清型检测。结果建立一种福氏志贺菌Xv血清型PCR鉴定方法,该体系在一个反应中包括3对引物,Xv血清型PCR扩增全部为阳性,可将Xv血清型与目前已知的其他18种福氏志贺菌血清型完全区分。非福氏志贺菌菌属及腹泻相关菌属菌株检测结果发现无任何PCR扩增产物。对139株不同血清型福氏志贺菌临床分离株的鉴定结果显示,该方法可将Xv血清型鉴定,与血清凝集结果一致。结论本研究建立的福氏志贺菌Xv血清型PCR鉴定方法具有快速、特异的优点,可以用于检测和监测。 罗霞 王建平 孙强正关键词:福氏志贺菌 聚合酶链反应