孙超 作品数:6 被引量:19 H指数:3 供职机构: 南京农业大学无锡渔业学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目 中国水产科学研究院基本科研业务费专项基金 更多>> 相关领域: 生物学 农业科学 更多>>
水生生物近缘种和产地的分子生物学判别 被引量:5 2011年 随着分子生物学技术的发展,渔业生物近缘种及产地的判别由形态学深入到了蛋白质和DNA水平。本文综述了目前已经应用于水生生物的相关分子生物学技术(包括色谱、免疫学判别以及蛋白的电泳、DNA的序列分析、PCR-RFLP、RAPD、AFLP、SNP、SSRI、SSR、Real-Time PCRs、pecies-specific primer PCR和PCRlab-on-a-chip等)以及它们各自的优缺点;在把握了这些研究进展的基础上,展望了相关技术的发展趋势。 孙超 苏彦平 刘洪波 杨健关键词:分子生物学 水生生物 近缘种 几种鲚属的鱼类分子遗传特征研究 近些年来,由于过度捕捞和环境衰退等原因,鲚属(Coilia)鱼类的资源遭到了严重的破坏,其中以刀鲚(Coilia nasus)最为显著,价格已涨至天价。迄今,部分鲚属鱼类的确切分类仍存在较大争议,如湖鲚(C. nasus... 孙超关键词:刀鲚 凤鲚 文献传递 分子生物学方法在鲚属鱼类遗传学研究中的应用 2013年 对已应用于鲚属鱼类系统发育分析、遗传多样性分析、物种分类和种类判别等遗传学研究的分子生物学方法进行综述,在了解其重要进展的基础上,比较各自的长处和不足,并展望其发展趋势,以期为中国鲚属鱼类系统发育分析、遗传多样性分析、物种分类及种类判别等方面的下一步研究提供借鉴。 孙超 刘洪波 姜涛 杨健关键词:分子生物学方法 物种分类 凤鲚ITS1与Cyt b基因序列的比较研究 被引量:6 2013年 比较分析了分子标记核DNA ITS1序列和Cyt b基因序列在凤鲚遗传多样性分析和凤鲚与其他鲚属鱼类(以刀鲚为例)间亲缘关系研究中的特征。研究发现凤鲚其ITS1序列的GC含量(71.19%)显著高于Cyt b基因序列(42.96%),ITS1序列的单倍型多样性(0.900)和核苷酸多样性(0.00997±0.01116)也显著高于Cyt b基因序列(0.400/0.000369±0.000469)。基于ITS1序列所得的凤鲚与刀鲚间的MCL和K2P遗传距离可明确区两种鲚属鱼类,与Cyt b基因序列的结果相一致。通过ML和UPGMA系统树的构建发现,凤鲚和刀鲚分别形成独立的分支。本研究显示ITS1序列与Cyt b基因序列所得结果一致性较好,可考虑将ITS1序列作为凤鲚的遗传多样性分析及其与其他鲚属鱼类间亲缘关系研究中有效的分子标记。 孙超 刘洪波 姜涛 杨健关键词:CYT B基因序列 凤鲚 亲缘关系 凤鲚ITS1和Cyt b基因序列的比较研究 凤鲚(Coilia mystus)是长江口重要的经济鱼类.本文首次比较分析了分子标记核DNA ITS1序列和Cyt b基因序列在风鲚遗传多样性分析和风鲚与其它鲚属鱼类(以刀鲚(C.nasus)为例)间亲缘关系研究中的特征... 孙超 杨健关键词:CYT B基因序列 凤鲚 亲缘关系 不同鲚属鱼类Cyt b和D-loop序列的比较及其判别早期生活史个体的潜力分析 被引量:6 2018年 使用mtDNA作为分子标记,基于1022 bp和1322 bp左右的部分序列分析刀鲚(Coilia nasus)、湖鲚(C.nasus taihuensis)、七丝鲚(C.grayii)及凤鲚(C.mystus)成鱼之间的遗传关系。结果显示,刀鲚和湖鲚间的遗传距离分别为0.0036±0.0008和0.0038±0.0008,凤鲚与刀鲚、湖鲚的遗传距离分别为0.1215±0.0111、0.1228±0.0111(Cyt b)和0.1075±0.0108、0.1067±0.0107(D-loop),七丝鲚与刀鲚、湖鲚的遗传距离分别为0.0342±0.0056、0.0351±0.0057(Cyt b)和0.0527±0.0069、0.0529±0.0070(D-loop),七丝鲚和凤鲚间的遗传距离分别为0.1158±0.0111和0.1123±0.0111。用Kimura双参数模型构建的2种序列的NJ分子系统树均显示,湖鲚和刀鲚不能形成独立的分支,而是混合聚在一起形成1个分支;七丝鲚和凤鲚则形成另外2个分支。首先根据采样点不同可初步断定未知仔幼鱼为刀鲚,稚鱼为湖鲚,而后对未知种仔幼鱼、稚鱼和刀、凤鲚鱼卵的2种序列的分析发现,不同采集点内部的这些早期生活个体间的遗传距离分别为0.0024~0.0032和0.0025~0.0082。在Kimura双参数模型构建的NJ分子系统树中,未知种仔幼鱼、稚鱼、刀鲚鱼卵与刀鲚、湖鲚聚为一类,凤鲚鱼卵与凤鲚聚为一支。由此可见,Cyt b基因序列和D-loop序列作为分子标记,虽然可以区分刀鲚、凤鲚以及七丝鲚的仔幼、稚鱼及鱼卵,但不能有效区分湖鲚和刀鲚的早期生活个体。 孙超 刘洪波 姜涛 轩中亚 杨健关键词:CYT B基因