韩珊珊
- 作品数:2 被引量:0H指数:0
- 供职机构:东北农业大学农学院更多>>
- 发文基金:博士科研启动基金更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 整合七种方法解析北美大麦花期及Alpha淀粉酶QTL
- 2017年
- 本研究以北美大麦双单倍体资源群体(DH)为研究对象,针对花期和Alpha淀粉酶的QTL定位进行研究。采用单QTL模型分析、四种贝叶斯方法和两种QTL后验概率推断七种方法分别分析了花期及Alpha淀粉酶两个性状QTL,最后将七种方法整合来共同筛选"可信的"QTL。结果显示:贝叶斯方法通常具有极高的QTL检测效力,特别是对处于连锁的QTL;此外,即使不同方法都发现了同一个QTL,其位置估计有时略有偏差,可能是由于单QTL方法对QTL位置估计的有偏性造成的。最后经过整合我们发现了2个"可信的"影响北美大麦花期的QTL和4个"可信的"影响Alpha淀粉酶的QTL。
- 韩珊珊欧娜音姜丹郭剑邵祺张雪峰方铭杨德光
- 关键词:QTL定位花期贝叶斯分析
- 影响北美大麦糖化力和蛋白质含量QTL的贝叶斯解析
- 2017年
- 大麦的糖化力和蛋白质含量是影响大麦品质的重要指标,对此类性状进行QTL定位具有重要的经济意义。本研究分别采用传统的单QTL扫描方法和3种贝叶斯LASSO方法实现此类性状的QTL精细解析。在对大麦蛋白质含量的QTL检测上,单QTL扫描方法共检测到了3个QTL,而3种贝叶斯方法检测到了7个QTL,其中2个与单QTL扫描方法检测的QTL吻合。在大麦糖化力的QTL检测上,传统的单QTL扫描方法共检测到了3个QTL,而3种贝叶斯方法除了检测到这3个QTL外,还检测发现了额外的2个连锁的QTL;表明贝叶斯方法在北美大麦蛋白质含量和糖化力QTL检测中可以更加有效地分离处于连锁位置或接近状态的QTL进而提高QTL的检测效力。
- 姜丹韩珊珊郭剑杨德光
- 关键词:QTL