黄平 作品数:15 被引量:119 H指数:8 供职机构: 中国林业科学研究院林业研究所 更多>> 发文基金: 国家科技支撑计划 国家林业公益性行业科研专项 博士科研启动基金 更多>> 相关领域: 农业科学 政治法律 生物学 更多>>
月季品种分子鉴定与遗传关系分析 植物品种保护是一种新型的知识产权,主要宗旨是保护育种者合理权益。植物品种保护在不断发展的过程中也面临一些问题,与结合现代生物技术成为了未来植物品种保护实践工作的重要主题,分子标记技术在植物新品种保护中有着广阔的应用前景。... 黄平关键词:月季品种 分子鉴定 等位基因 刀状黑黄檀基因组特征与种群遗传变异分析 被引量:2 2022年 [目的]本研究旨在分析刀状黑黄檀基因组基本特征,发掘一套多态性好、重现性高的基因组SSR分子标记并用于评估其野生种群遗传变异程度。[方法]利用二代测序(NGS)方法初步评估刀状黑黄檀基因组大小、杂合度和重复序列;利用MISA对基因组上潜在的SSR位点进行检索,解析SSR类型与特征;利用Primer Premier v 5.0设计合成300对引物,通过琼脂糖凝胶电泳、非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳对潜在的SSR位点进行初筛与复筛,最后采用荧光标记毛细管电泳进行SSR位点多态性与种群遗传多样性分析。[结果]刀状黑黄檀基因组特征分析结果显示:其基因组大小约为706.92 Mb,杂合度为1.26%,重复序列比率为55.74%。通过筛选实验,发掘了27个具有良好多态性的SSR标记,并进行了验证。结果显示27个SSR位点共扩增得到117个等位基因,多态性信息含量(PIC)介于0.149~0.803。对3个野生种群遗传多样性分析结果显示:种群水平的平均期望杂合度(H_(e))为0.504,遗传分化系数(F_(ST))为0.034;AMOVA分析显示:种群间变异占比3.46%,种群内变异占比96.54%,这表明遗传变异主要来源于种群内。[结论]刀状黑黄檀基因组属于高杂合、高重复的复杂基因组,研究结果为制定基因组精细组装策略提供了参考依据;发掘与验证的27个SSR标记具有较好的多态性与扩增稳定性;3个野生种群具有中等遗传多样性和较低的遗传分化,本研究为开展刀状黑黄檀的种质资源收集保存与分析评价提供科学依据。 刘宇 郑勇奇 李长红 林富荣 黄平关键词:基因组SSR 多态性 皂荚EST-SSR分子标记开发与分析评价 被引量:19 2017年 本研究旨在开发皂荚EST-SSR分子标记,为今后皂荚种质资源评价与分析提供基础。首先通过对已公布的皂荚转录组数据进行拼接得到41003个Unigenes,总长度70.4 Mb,平均长度1716 bp,N50为2533 bp。进一步在7009个Unigenes中检测到8494个EST-SSR位点,其中1200条Unigenes含有2个及以上的SSR位点,复合型SSRs有369个。针对所有EST-SSR位点设计得到6494条特异性引物,随机挑选60个位点进行试验验证与分析,其中44对引物可扩增出特异性片段,17对具有多态性,PIC值范围为0.195~0.742,均值为0.501,且大部分多态性位点位于UTR区域。通过对皂荚近缘种进行跨种PCR扩增试验,结果显示在开发的44对有效引物中,9个近缘种美国皂荚、日本皂荚、绒毛皂荚、滇皂荚、华南皂荚、小果皂荚、野皂荚、肥皂荚和美国肥皂荚分别有32、31、23、24、7、40、25、18和18对引物可获得有效扩增片段,说明EST-SSR标记在皂荚近缘种之间具有良好的通用性。研究表明利用转录组数据挖掘的EST-SSR位点具有扩增稳定、多态性良好、近缘种间通用等优点,是林木物种开发分子标记的有效途径之一。 林富荣 邢俊连 孟艳琼 黄平 郑勇奇关键词:皂荚 转录组 EST-SSR 多态性 风对黄花蒿水力学性状和生长的影响 被引量:19 2015年 吹风会影响到植物的水力学结构、光合作用、生物量分配以及植物的力学性状,研究风对植物的综合影响有助于深入了解植物应对风胁迫的响应机制。以黄花蒿为研究对象,每天吹风4h,风速为5m/s,吹风处理60d,测定了风吹条件下黄花蒿的水力学特征、光合作用、生物量分配和茎干力学特性。结果表明:在风吹条件下,黄花蒿正午水势显著低于对照,茎干导水损失率(PLC)增加了16%,最大光合速率仅为对照的62%,气孔导度为对照的55%。在试验结束时风吹植株株高仅为对照的68%,但基茎显著高于对照,同时风吹显著降低了黄花蒿的总生物量,但根冠比显著高于对照,风吹显著减小了茎导管直径和导管密度,风吹植物导管直径和导管密度分别为对照的77%和55%,同时,风吹植物茎干导水率显著低于对照,但茎干的抗弯刚度显著高于对照。以上结果表明风吹抑制了植物的水分输导能力,导致叶片水分匮缺,限制了植物的光合作用。风吹增加了茎干的力学稳定性,但同时降低了茎干的水分输导能力,这是植物茎在力学性状和水分输导之间的权衡。这种改变有利于在有风条件下维持植物的力学稳定性,但同时降低了水分输导能力。 王林 代永欣 樊兴路 张芸香 黄平 万贤崇关键词:黄花蒿 力学特性 基于SSR标记的山茶属位点组合品种鉴别能力分析评价 2023年 【目的】筛选多态性高、通用性强等的SSR位点,评估筛选所得SSR位点的组合在山茶属品种中的鉴别能力;在保持最大鉴别能力的基础上,确定可用于山茶属品种鉴别所需的最少SSR位点的组合,提高品种鉴别效率。【方法】本研究以111份山茶属品种为材料,结合凝胶电泳、荧光毛细管电泳、位点多态性分析和位点组合品种鉴别力(VDP)分析等方法,筛选评价SSR位点并对SSR位点组合的品种鉴别力进行分析与评价。【结果】本研究筛选获得17个SSR位点,占筛选位点总数的30.9%,在111份山茶属品种中,共检测到166个等位基因,单位点基因型数量范围为6~35,均值为23.353个,观测等位基因数(Na)范围为3~15,均值为9.765个,多态性信息含量(PIC)的范围为0.447~0.835,均值为0.696,位点缺失率的范围为0~4.50%,均值为0.90%。当差异位点数=1时,17个SSR位点在全部品种(系)、红山茶组品种和金花茶组无性系中达到的R-VDP最大值均为1,可将SSR位点数量分别缩减到11、10、5个,分别占筛选所得位点数的64.7%,58.8%和29.4%;当差异位点数=2时,17个SSR位点在全部品种(系)、红山茶组品种和金花茶组无性系中达到的R-VDP最大值分别为0.964,0.952和1.000,可将SSR位点数量分别缩减到12、12、和7个,分别占筛选所得位点数的70.6%、70.6%和41.2%;当差异位点数=3时,17个SSR位点在全部品种(系)、红山茶组品种和金花茶组无性系中达到的R-VDP最大值分别为0.946,0.929,1.000,可将SSR位点数量分别缩减到8、7和8个,分别占筛选所得位点数的47.1%、41.2%和47.1%。当差异位点数≤6时,17个SSR位点组合对山茶属测试品种(系)群的RVDP最大值可保持相对稳定的水平。【结论】本研究筛选验证获得17个多态性高、通用性强等的SSR位点;这些位点的组合在山茶属品种(系)群中均表现出良好的品种鉴别能力;确定了山茶属不同类群品种(系)鉴别所需的最少SSR位点的组� 李丰钰 黄平 郑勇奇 郑勇奇 张雨婷 薛克娜 宗亦臣 宗亦臣关键词:山茶属 SSR标记 一种鉴定白皮松种质资源的SNP位点引物组合及应用 本发明属于分子标记及其检测领域,具体涉及一种鉴定白皮松种质真实性的核心SNP位点、引物组合,基于SNP位点的DNA指纹数据库、数据库构建方法,以及基于SNP位点的白皮松种质真实性的鉴定方法、应用。所述SNP位点选自第一S... 李斌 郑勇奇 林富荣 郭文英 黄平文献传递 基于SSR标记月季品种鉴定及遗传关系分析 被引量:17 2012年 以36个月季品种为材料,应用荧光SSR标记进行月季品种分子鉴定和品种间遗传关系研究。结果显示8个SSR位点检测出85个等位基因变异,等位基因变异范围为6~15个,平均每个位点产生10.6个等位基因变异。结合8个SSR位点,每个品种均具有独特的等位基因表现型,其中位点Ra043a品种鉴定的分辨率最高,产生32个等位基因表现型,区分所有品种最少需要2个SSR位点。品种间成对遗传相似度变幅介于0.105~0.791之间,聚类结果显示36个品种聚为6类;中国月季聚为一类,与其他月季品种存在遗传差异,起源相近月季品种分别聚为一类。研究认为SSR标记在月季品种鉴定中具备可行性,还可用于品种的遗传关系分析。现代月季遗传背景的深入研究可为未来月季新品种培育、种质资源保存等提供参考依据。 黄平 崔鹏娇 郑勇奇 张川红 于雪丹关键词:月季品种 简单序列重复 国际植物新品种保护公约的变迁及日本和韩国经验借鉴 被引量:4 2012年 国际植物新品种保护公约1991文本与1978文本的差异主要体现在品种权范围、保护植物范围、保护期限、实质性派生品种保护及农民特权等方面。文中总结日本经历公约文本转变过程以及韩国直接加入1991文本的经验,指出我国加入国际植物新品种保护公约1991年文本所面临的问题,并提出相应的政策建议。 黄平 郑勇奇关键词:植物新品种保护 国际植物新品种保护联盟 植物新品种保护发展现状与趋势 被引量:2 2015年 本文简要介绍了国际植物新品种保护制度,国内外植物新品种保护发展现状,并且就未来植物新品种保护的发展趋势进行分析,指出了我国植物新品种发展道路上可能面临的挑战和机遇。另外,针对植物新品种保护、品种审定以及国际栽培品种登录三者在相关概念、品种申报与管理等方面的差异进行了比较分析。旨在让更多的育种者了解植物新品种保护相关的基本知识与概念,提高育种者知识产权保护意识,使得育种者的合理权益得到保护。 郑勇奇 张川红 黄平 程蓓蓓关键词:品种权 植物新品种保护 品种审定 风和光照对侧柏、栓皮栎生长和形态建成的影响 被引量:9 2014年 疏伐是一项重要的林业管理措施,其可以通过降低森林密度、减少树木对资源的竞争来提高树木的生长(Martín-Benito et al.,2010)。然而,在疏伐后的若干年内这种生长释放作用经常不能体现出来(Yang,1989;Youngblood,1991),而且疏伐带来微环境的突然改变还可能引起存留树木的生长停滞、甚至顶端坏死(Bladon et al.,2006;2007)。 徐湘婷 王林 黄平 万宇轩 李建中 万贤崇关键词:光照 风吹 侧柏 栓皮栎