宋晓丹 作品数:4 被引量:6 H指数:2 供职机构: 西南大学药学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家高技术研究发展计划 更多>> 相关领域: 生物学 环境科学与工程 轻工技术与工程 化学工程 更多>>
普鲁兰多糖合成通路对聚苹果酸生物合成的影响 宋晓丹 冯骏 李晓荣 邹祥聚苹果酸生产菌出芽短梗霉CCTCC M2012223的全基因组测序及序列分析 被引量:3 2017年 【目的】解析出芽短梗霉CCTCC M2012223的基因组序列信息,分析其代谢产物聚苹果酸、黑色素、普鲁兰多糖合成相关基因,为深入研究遗传多样性和代谢工程改造提供序列背景信息。【方法】使用Illumina Hi Seq高通量测序平台对出芽短梗霉CCTCC M2012223菌株进行全基因组测序,并对测序数据进行序列拼接,基因预测与功能注释,COG/GO聚类分析,比较基因组学分析等。下载其他5株出芽短梗霉基因组序列,比较分析6株菌的种内同源基因、全基因组进化以及代谢产物合成相关基因。【结果】出芽短梗霉CCTCC M2012223基因组序列全长30756831 bp,GC含量47.49%,编码9452个基因。比较基因组分析表明出芽短梗霉CCTCC M2012223的基因组组装长度最长,6株菌的同源基因数达到7092个,普鲁兰多糖和聚苹果酸合成相关基因的蛋白序列有很高的保守性。出芽短梗霉CCTCC M2012223和Aureobasidium pullulans var.melanogenum亲缘关系最近,而这2株菌的黑色素合成相关基因的蛋白序列有一些插入和突变。【结论】本研究解析了出芽短梗霉CCTCC M2012223的基因组序列信息,获得黑色素、普鲁兰多糖和聚苹果酸合成相关基因,为后续的代谢机制解析和改造提供相关依据。 王永康 宋晓丹 李晓荣 杨尚天 邹祥关键词:出芽短梗霉 全基因组测序 代谢机制 聚苹果酸 TOR信号调控真菌细胞的生长与代谢 被引量:3 2018年 TOR(target of rapamycin)是一类进化上保守的丝氨酸/苏氨酸(Ser/Thr)蛋白激酶,是真核细胞响应环境信号调控生长和代谢的关键因子。真菌TOR信号途径在营养、压力环境等刺激下,通过核糖体生物合成、营养物质摄入及代谢等过程调节维持胞内稳态。本文主要综述了酵母细胞TOR及TOR复合物的结构,以及近年来真菌TORC1蛋白在不同营养环境、压力等条件下对细胞生长与自噬、代谢以及胁迫生理响应等生命活动的调控机制进展及未来发展方向,为真菌TOR调控生长和代谢产物提供新思路。 宋晓丹 张园 邹祥关键词:TOR 真菌 细胞生长 代谢 氮响应转录因子Gat1调控出芽短梗霉细胞生长及聚苹果酸合成研究 TOR信号通路在真核生物感受外界营养物质及逆境胁迫、调控细胞生长中起重要作用.课题组前期研究表明环境氮浓度影响出芽短梗霉细胞生长及聚苹果酸生物合成.进一步对TOR信号通路中下游氮响应转录因子Gat1进行生物学功能研究,从... 宋晓丹 王永康 李晓荣 邹祥关键词:出芽短梗霉 细胞生长 聚苹果酸