刘斌
- 作品数：18 被引量：62H指数：5
- 供职机构：内蒙古农业大学动物科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金公益性行业(农业)科研专项内蒙古自治区自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 基于高通量测序技术分析家兔感染猪瘟兔化弱毒株后脾脏的转录组学变化被引量：9
- 2016年
- 本研究基于高通量测序技术对感染猪瘟兔化弱毒株(C株)后0h,12h,24h,30h,36h,48h的家兔脾脏组织进行测序,以家兔基因组作为参考,筛选感染后各时间点和对照组(0h)之间的差异基因。利用Uniprot和NCBI数据库查找各组中变化水平显著的前10个差异基因的生物学功能。结果发现,感染后12h,24h,30h的前10个差异基因只有少数与炎症、免疫、凋亡等相关;感染后36h,48h的前10个差异基因完全相同,其中B2M、RLA-DR-ALPHA、CD74和IGJ参与抗病毒过程。GO功能注释结果显示:感染后各时间点的差异基因都和免疫、代谢、调控途径紧密相关。KEGG通路富集分析发现,感染后24h的差异基因富集到RIG-I样受体信号通路,感染后30h的差异基因富集到黏着斑和细胞外基质-受体相互作用通路,感染后36h和48h的差异基因共同富集到的通路有20个,其中蛋白酶体,溶酶体,核糖体,趋化因子信号通路,B细胞受体信号通路,抗原加工提呈通路和FcγR介导的吞噬通路与抗病毒相关。本研究建立的家兔感染C株后脾脏组织的差异表达基因数据库,将为进一步阐述家兔适应C株的分子机制奠定基础。
- 侯玉臻赵丹彤刘国英贺番刘斌付绍印郝永清张文广
- 动物血液转录组测序的应用研究进展被引量：2
- 2023年
- 近年来,随着转录组测序(RNA-Seq)技术的普及与成本的降低,越来越多地被应用于动物科学研究。一些血液中的基因与疾病紧密相关,参与免疫、应激、代谢与疾病相关的功能,如突触融合蛋白1A(STX1A)基因可能成为预测酮病的分子靶标;血液RNA-Seq可以预测早产、复发性受精失败与流产等早期妊娠诊断相关的血液标记物溶血磷脂酸受体3(LPAR3)基因等;使用血液RNA-Seq鉴定饲料效率的可靠预测因子是减少表型数据收集的一种策略,有助于家畜营养调控基因组学领域的发展;血液中存在家畜生长性状与生产性能的相关标记物,如CD 48基因是调节肉牛生长的关键基因;血液是免疫系统的重要防线,能够运输各种免疫活性物质与免疫细胞,血液RNA-Seq的分析提供了全身免疫的概览;血液RNA-Seq在生态环境与应激反应等多方面的应用取得进展,白细胞介素1受体Ⅱ(IL1R2)基因是野生状态下免疫调控的主要基因。多年来哺乳动物尤其是家畜的血液RNA-Seq的相关应用研究表明,血液富含有关健康状况的信息,有望替代病理组织取样来研究不同生理状况的分子特征并预测疾病;不同饲料营养水平的动物血液中基因的表达量不同,有助于家畜营养调控基因组学领域的发展。综上,血液RNA-Seq的微创诊断不仅有助于动物不同生理状态的分子调控机制解答,更有助于未来家畜分子标记辅助管理的应用,具有成为候选的实用生物样本的可能。
- 孙燕勇马凤英郭丽丽刘在霞刘斌刘斌张文广
- 关键词：免疫调控家畜
- 绒山羊绒毛生长相关基因的筛选、鉴定和多态性分析
- 绒山羊是重要的绒用经济动物,其绒毛生长具有较强的季节性,但不同品种之间有很大的差异,大多数绒山羊在非长绒季节/(5-8月份/)不长绒,而辽宁绒山羊一些品系可以常年长绒/(6月开始长绒/)。埋植褪黑激素可以促进绒山羊在非长...
- 刘斌
- 关键词：绒山羊褪黑激素基因芯片差异表达基因
- 文献传递
- 绒山羊次级毛囊基因表达滞后性的转录组分析被引量：2
- 2016年
- 毛囊是具有高度的自我更新能力、独特的可再生器官,其周期性变化是一个动态过程,为了研究毛囊差异基因表达变化情况,文章以内蒙古绒山羊生长期毛囊为研究对象,利用Illumina高通量测序技术方法,检测6~10月皮肤毛囊差异基因表达变化情况,寻找对绒毛生长及质量具有调控作用的特异表达基因。试验发现,多数差异基因分别在初级毛囊（PF）的7、8月份和次级毛囊的（SF）8、9月份表达;在绒毛生长期的相邻月份中,发现FAM83C、LOC102185501、FYCO1、CTTNBP2 NL、C6orf132、KRTAP29-1和CRYBG3 7个共同差异表达基因呈现相同的表达趋势,且在次级毛囊上的表达变化均比初级毛囊滞后1个月。综上所述,次级毛囊在基因表达调控中存在一定的滞后性,这将为绒毛周期生长发育和分子育种提供重要的理论基础。
- 季小阳刘斌白雪王宏付绍印苍真伟吴江鸿张文广
- 关键词：绒山羊毛囊滞后性转录组
- 无尾鸡骨骼发育关键信号通路研究进展被引量：1
- 2021年
- 骨骼系统对机体的生命活动至关重要,它为生物体提供了造血微环境、机械支撑、保护脏器等功能,同时也是钙和其他矿物质等的储存库。家鸡尾骨的表型多样性是研究骨骼系统发育及形成机制的良好资源。Notch、Wnt信号通路的靶基因及其相互作用可以形成周期性表达的特点,是调节体节形成及尾部骨骼终止延伸的分子通路。为了解无尾鸡骨骼发育终止的分子机制,作者分别总结了骨骼发育、无尾鸡骨骼研究进展,并重点讨论影响无尾性状的关键信号通路Notch、Wnt及其在无尾鸡研究中的进展。但是,受体和配体之间相互作用的精确调节以及信号通路中的核心元素仍不清楚,需要通过更多的功能基因组和蛋白质组等方法进行深入研究。
- 齐旺梅徐斯日古楞哈登楚日亚刘斌胡斯乐孙燕勇孙燕勇
- 关键词：骨骼发育分子机制NOTCH信号通路WNT信号通路
- 光控和埋置褪黑激素促进绒山羊长绒的皮肤毛囊差异表达基因网络分析被引量：1
- 2017年
- 为研究光控增绒和埋置褪黑激素促进绒山羊在非产绒季节(5—8月份)长绒的皮肤毛囊差异表达基因之间的互作关系,并筛选出皮肤毛囊发育相关的重要功能基因,以Agilent绵羊的全基因组表达谱芯片杂交获得的光控增绒羊皮肤差异表达的99个基因及埋置褪黑激素绒山羊皮肤差异表达的83个基因作为研究对象,结合NCBI数据库,利用RStudio程序包和Cytoscape 3.3.0构建差异基因网络并分析。光控增绒试验组差异基因构建了1个主网络和4个小网络;对照组差异基因构建了1个主网络和5个小网络。与表达量结合分析基因网络发现,K25、KAP16-2基因上调促进ISG17、RSRP1、GIMAP1和CYTIP基因的下调,间接促进TNFAIP6基因的下调;CYP17A1、V15和K2-12(K85)基因的上调促进ddit3基因的下调;KAP16-3基因促进CYP17A1基因的同时抑制CYP1A1基因。埋置褪黑激素试验组差异基因构建了2个主网络和7个小网络,对照组差异基因构建了3个主网络和1个小网络。与表达量结合分析基因网络发现,CTNNB1基因的上调促进COL3A1基因的下调;FLT-1基因的上调促进CGA基因的上调和COL1A2基因的下调;PAX6基因的上调促进DOK4基因的上调和LOC101110099基因的下调;P450基因的上调促进BLG基因的下调。光控增绒羊皮肤中筛选出来的基因中角蛋白、角蛋白关联蛋白、CYP17A1、SP-D等23个显著上调基因和CYP1A1、COL6A5、LOC100101238、ddit3等13个显著下调基因对光控增绒羊皮肤毛囊提前进入兴盛期有重要作用;埋置褪黑激素的绒山羊皮肤中筛选出来的基因中CTNNB1、PAX6、DOK4、LOC105602529等13个显著上调基因和酪蛋白家族、胶原蛋白类、LOC101110099等12个显著下调基因之间的信号传导增强,从而促进绒山羊绒毛进入兴盛期。
- 勿都巴拉刘斌郭俊阿云嘎杨军乌日格希拉图李金泉李玉荣
- 关键词：绒山羊褪黑激素差异表达基因
- 光周期对于绒山羊毛囊干细胞激活的影响被引量：4
- 2017年
- 为了延长绒山羊毛囊兴盛期,提高羊绒产量,本试验通过人工缩短内蒙古阿尔巴斯型绒山羊的日照时间,利用组织切片技术对比人工短光照和自然光照周期下绒山羊皮肤组织形态变化,利用免疫组织化学方法研究毛囊细胞增殖及相关信号通路重要蛋白的表达。结果显示,人工短光照周期下绒山羊毛囊细胞增殖强烈,干细胞标记角蛋白15(cytokeratin 15,K15)阳性信号大量分布于外根鞘,β-catenin信号活跃表达于毛母质及根鞘,毛囊提前进入兴盛期;而自然光照周期下绒山羊毛囊仍停留在休止期,相应蛋白信号表达较弱。综上表明,短日照对毛囊生长具有明显的促进作用,人工短光照周期可以提前激活毛囊干细胞,使其提前进入兴盛期,引起多种毛囊生长相关蛋白的表达。
- 刘斌郭俊勿都巴拉马跃军辛雷勇赵存发李玉荣尹俊
- 关键词：绒山羊短日照细胞增殖干细胞
- 猪链球菌病的综合防治与公共卫生安全被引量：7
- 2009年
- 猪链球菌病是由猪链球菌引起的人兽共患传染性疾病,主要引起猪的败血症、脑膜炎、肺炎、多发性关节炎和浆膜炎等。该病呈世界性分布,给养猪业造成巨大的经济损失。近年来,除西藏等少数地区尚未发现该病外,我国大多数省、市、自治区均有不同程度的发生与流行,并且该病的发生和危害日趋严重,已成为影响我国养猪业发展的重要传染病之一。从病原、流行病学、诊治等方面进行了阐述,以期为该病的科学防治提供参考依据。
- 马跃军李玉荣刘斌高玉林
- 关键词：猪链球菌病病原流行病学诊治
- 蒙古羊尾椎数与尾型变异分析被引量：5
- 2017年
- 为了揭示蒙古羊尾椎数与尾型的变异规律,试验选择内蒙古四子王旗所养殖的蒙古羊作为研究对象,对其尾椎数和尾型进行测定。结果表明:通过对蒙古羊尾巴的扫描,将蒙古羊的尾型分为直尾、弯尾和逗号尾三种类型,蒙古羊的尾椎数在7~13个之间,平均为9.78个,整个尾椎长度在18~34 cm之间,平均为24.58 cm;蒙古羊的第一尾椎到第五尾椎的宽度呈递减变化趋势,通过模拟得到尾椎宽度的函数方程为y=-5.884ln x+17.082,根据此数学方程式可以计算出每个尾椎的宽度。通过对蒙古羊尾型测定得到成年蒙古羊尾长在3.00~20.00 cm之间,平均为11.14 cm,尾宽在3.00~19.00 cm之间,平均为11.26 cm;羔羊尾长在3.50~15.00 cm之间,平均为9.61 cm,尾宽在5.50~15.00 cm之间,平均为9.75 cm,蒙古羊的尾长略小于尾宽。
- 何小龙王位王艳欣王月星付绍印付绍印李虎山刘斌祁云霞郭建平蔡宇钿刘永斌张文广
- 关键词：蒙古羊尾椎
- 猪瘟病毒核心蛋白研究进展被引量：3
- 2015年
- 核心蛋白是猪瘟病毒(Classical swine fever virus,CSFV)的结构蛋白之一,除了构成病毒核衣壳保护内部的基因组RNA外,还参与转录调节,并可和多种宿主蛋白相互作用,在病毒感染过程中发挥重要作用。本文结合当前对CSFV核心蛋白的无序性,结构特点,功能特点,以及和病毒的非结构蛋白NS3、NS5B,宿主蛋白SUBMO-1、UBC9、OS9、IQGAP1相互作用的研究,综述了CSFV核心蛋白在猪瘟病毒致病力、毒力和基因组RNA复制中发挥的重要作用,以期为CSFV核心蛋白的进一步研究提供参考。
- 侯玉臻赵丹彤刘国英贺番刘斌付绍印郝永清张文广
- 关键词：猪瘟病毒核心蛋白相互作用
