郑佳文
- 作品数：1 被引量：1H指数：1
- 供职机构：中国科学院北京基因组研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- TGIF1在红细胞分化中的功能和机制研究被引量：1
- 2016年
- 目的筛选潜在的促红系分化因子,并验证其对红系分化的促进作用,探讨促分化机制。方法首先通过对高通量组学测序数据的分析,找到潜在红系调控转录因子;之后在红系分化的细胞模型TF-1细胞系中干扰该因子的表达,观察该因子的异常表达对红系分化的影响;进一步对目的基因敲低的细胞系进行转录组测序,同时利用生物信息学的手段分析受影响的红系相关因子以及通路。结果高通量组学测序分析得到潜在促红系分化调控因子TGIF1。TGIF1敲低细胞中,ε-珠蛋白、γ-珠蛋白、红系特异转录因子(GATA1、KLF1)、以及红系细胞表面特异糖蛋白标志分子CD235a的m RNA表达量及血红蛋白浓度均低于对照组。TGIF1过表达细胞的γ-珠蛋白m RNA高于对照组;促红细胞生成素诱导3天后,TGIF1过表达细胞表面CD235a的表达高于空白细胞组。进一步对稳定敲低TGIF1的TF-1细胞系进行高通量转录组测序分析,发现Smad复合物和相关靶基因表达上调,而GATA1和ALAS2的表达量则降低。结论 TGIF1是一个促红系分化的转录调控因子,可能通过影响转化生长因子β(transforming growth factor-β,TGFβ)通路中Smad复合物和相关靶基因的表达,或通过影响GATA1和ALAS2的表达来调控红系分化过程。
- 刘淑阁郑佳文李艳明张昭军方向东
- 关键词：红系分化转录因子转录组测序
