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焦洋

作品数：29 被引量：114H指数：7
供职机构：北京市朝阳区疾病预防控制中心更多>>
发文基金：国家科技重大专项国家自然科学基金北京市朝阳区科技计划项目更多>>
相关领域：医药卫生水利工程更多>>

合作作者

文献类型

  • 27篇期刊文章
  • 1篇会议论文

领域

  • 28篇医药卫生
  • 1篇水利工程

主题

  • 18篇病毒
  • 7篇腹泻
  • 6篇诺如病毒
  • 4篇星状病毒
  • 4篇腺病
  • 4篇腺病毒
  • 4篇基因
  • 4篇HIV-1
  • 3篇型别
  • 3篇突变
  • 3篇流行病
  • 3篇流行病学
  • 3篇流行病学特征
  • 3篇轮状
  • 3篇轮状病毒
  • 3篇患儿
  • 3篇基因型
  • 3篇分子流
  • 3篇分子流行病学
  • 3篇分子流行病学...

机构

  • 27篇北京市朝阳区...
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  • 2篇北京市疾病预...
  • 2篇中国食品药品...
  • 1篇厦门大学
  • 1篇首都医科大学...
  • 1篇传染病预防控...
  • 1篇中国疾病预防...
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作者

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  • 3篇刘洁
  • 3篇李崇

传媒

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  • 2篇中国卫生检验...
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  • 1篇国际检验医学...
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  • 1篇食品安全质量...
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年份

  • 3篇2023
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  • 4篇2021
  • 3篇2020
  • 2篇2019
  • 4篇2018
  • 2篇2017
  • 3篇2016
  • 2篇2015
  • 2篇2014
  • 1篇2013
共 29 条 记 录，以下是 1-10
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排序方式：
不同治疗效果的艾滋病患者抗病毒治疗前HIV-1 gp120准种特征差异被引量：1
2017年
目的探讨HIV-1 gpl20准种在不同治疗效果的艾滋病患者抗病毒治疗前的特征差异。方法回顾性收集治疗方案为AZT＋NVP＋3TC的艾滋病患者在抗病毒治疗前的血浆样本，包括病毒抑制（vs）组12例，治疗失败（TF）组12例。采用单基因组扩增技术获得gp120准种序列，分析比较遗传多样性、氨基酸长度、潜在糖基化位点及特征性氨基酸的特点。结果本研究共获得gpl20序列365条序列，其中vs组168条（6-20条），TF组197条（7-28条）。TF组的gpl20准种复杂度高于vs组，差异有统计学意义（P=O．003）；TF组的gpl20准种ds及dN中位数均高于vs组（P=0．017；P=0．002）。TF组HIV-1准种gpl20氨基酸长度长于VS组（P=0．001）。TF与vs组的gpl20准种相比共有9个氨基酸位点存在明显差异，多数分布在V1/V2区（6／9，66．6％）。结论不同治疗效果的艾滋病患者治疗前的HIV-1gpl20准种基因特征存在差异，TF组患者来源的HIV-1准种遗传多样性更高。
欧阳雅博孔德生王彦王琛李臻鹏焦洋殷倩倩陈德喜马丽英
关键词：GP120准种
2018—2019年北京市朝阳区16株腮腺炎病毒基因特征分析被引量：1
2022年
目的分析2018—2019年北京市朝阳区腮腺炎病毒(mumps virus, MuV)小疏水蛋白(small hydrophobic, SH)编码基因序列变异特点, 掌握朝阳区MuV型别构成及其变化规律, 为朝阳区流行性腮腺炎(简称流腮)防控提供基础资料。方法对2018—2019年朝阳区临床诊断为流腮患者的腮腺管口拭子样本进行MuV核酸检测及病毒分离培养, 并对MuV进行SH段基因扩增、序列分析和基因分型。结果 362份流腮患者的腮腺管口拭子样本中检出30份MuV核酸阳性标本, 并从中分离出16株MuV毒株, 将其SH基因序列与各基因型参考株和疫苗株序列进行比对, 其中15株MuV毒株为F基因型, 其核苷酸一致性为95.98%~100.00%, 氨基酸同源性为91.23%~100.00%, F基因型MuV毒株(19009株)的第28~30位置上的氨基酸三联体为IIL;1株MuV毒株为G基因型, 其与辽宁流行的G基因型毒株核苷酸一致性为98.85%, 氨基酸同源性为98.25%。本研究中F基因型与G基因型MuV毒株的核苷酸差异为12.07%。16株MuV北京分离株与Jeryl-Lynn疫苗株的核苷酸差异为13.22%~18.39%。结论 2018—2019年北京市朝阳区流腮病例中检出的MuV存在F和G两种基因型, 并以F基因型流行为主, 建议进一步加强对流腮的病原学监控。
赵剑虹焦洋韩桃利张建赵玉倩高艳
关键词：腮腺炎病毒基因型别
HIV-1 CRF07_BC病毒适应性的体外生长竞争试验的建立
2021年
目的:通过突变的方式构建含有鼠Thy1.1基因或鼠Thy1.2基因的HIV-1 CRF07_BC感染性克隆,建立CRF07_BC亚型体外竞争试验。方法:用鼠Thy1.1基因和鼠Thy1.2基因替换CRF07_BC亚型感染性克隆pXJDC6291-13 Nef区前218个碱基,构建成CRF07_BC感染性克隆BCEA1和BCEA2质粒。BCEA1和BCEA2进行293T细胞转染后获得病毒,测定病毒滴度,以等比例病毒含量共感染PM1细胞,在感染的第3、4、5、6天收集细胞并用Thy1.1和Thy1.2特异性抗体标记细胞,并进行流式细胞检测病毒适应性。通过"TFitness"程序(http://bis.urmc.rochester.edu/vFitness)计算病毒相对适应性。并观察耐药位点K103 N、多态性位点K166R相对于CRF07_BC亚型相对适应性的影响。结果:CRF07_BC亚型BCEA1和BCEA2两病毒的相对适应性(1+s)结果为1.06±0.23693,无统计学差异,建立了CRF07_BC亚型体外生长竞争性试验。利用该体外生长竞争试验验证K103 N和K166R突变株与野生株的相对适应性,BCEA2-K103 N/BCEA1相对适应性是0.728282±0.16608、BCEA2-K166R/BCEA1是0.883385±0.19023、BCEA2-K103 N+K166R/BCEA1是0.804604±0.06164。K103耐药位点突变株与野生株相对适应性存在统计学差异。结论:建立HIV-1 CRF07_BC病毒适应性的体外生长竞争试验,基于该体外竞争试验,HIV-1 K103 N的耐药毒株的病毒适应性降低。
何林焦洋丁奕博张媛媛林倩茹汪立杰李丹洪坤学马丽英
关键词：HIV-1
进口轮状病毒疫苗RotaTeq的热稳定性被引量：3
2020年
目的分析进口轮状病毒(rotavirus,RV)疫苗RotaTeq(RV5)的热稳定性。方法采用荧光定量PCR法分别测定22~25和37℃条件下放置不同时间的RV5疫苗滴度,以参考疫苗株滴度为标准,计算RV5疫苗5个型别毒株(G1、G2、G3、G4、P1)滴度和总滴度。同时扩增RV5疫苗G3型毒株的VP7序列,并与GenBank中登录的原型病毒株r G3的VP7序列进行比较。结果22~25℃条件下,G1、G2、G3、G4、P1型毒株滴度和总滴度每天下降速度分别为3.51%、2.26%、3.19%、5.22%、3.18%和3.61%,各型别毒株间差异无统计学意义(P>0.05);37℃条件下,G3型毒株滴度的下降速度(31.20%/h)明显高于其他型别毒株(G1、G2、G4、P1下降速度分别为每小时0.75%、0.31%、1.08%和2.07%),差异有统计学意义(P<0.05)。G3型毒株滴度于37℃的半衰期仅为0.07 d,其原型株rG3的半衰期可达2.10 d。RV5疫苗G3型疫苗株与其原型株的差异包括散在的氨基酸差异(F32L、T69A、L83F、I118T、D151G、P275L)及位于5′UTR(T25C)和3′UTR(G1041A、A1045G、G1046A、G1047A、C1048T、A1053T)较聚集的核苷酸差异。结论RV5疫苗中各型别毒株在22~25℃时热稳定性良好,但在37℃时G3型疫苗株是影响RV5疫苗热稳定性的关键,位于VP7 UTR的核苷酸突变可能是导致其热稳定性降低的主要原因。
杜加亮刘艳焦洋于晴川刘悦越赵荣荣高加梅范行良国泰
关键词：轮状病毒热稳定性非翻译区
HIV-1 CRF_BC重组亚型耐药相关新突变位点的复制动力学研究
2015年
目的研究HIV-1CRF_BC重组亚型逆转录酶（RT）区耐药相关新突变位点1132L、T139K／R对非核苷类逆转录酶抑制剂（NNRTIs）药物敏感性和病毒复制动力的影响。方法通过点突变的方法将HIV-1B亚型感染性克隆PNL4—3RT区的第132位和第139位氨基酸分别突变为亮氨酸（L）和苏氨酸（T）／精氨酸（R），与本课题组已经构建的HIV．．CRF07-BC亚型RT区1132L和T139K／R突变感染性克隆，共同转染293T细胞系进行病毒包装并检验病毒感染性。检测突变病毒对于NNRTIs的药物f依曲韦林（TMC-125）、地拉夫定（DLV）、奈韦拉平（NVP）、依非韦伦（EFV）]敏感性，及其复制动力学特征。结果通过点突变的方法成功构建感染性克隆PNL4-3-RT—1132L、PNL4—3-RT．T139K和PNL4—3-RT—T139R。1132L和T139K／R在B亚型和CRF07-BC亚型中均能降低HIV．1对于NNRTIs的药物敏感性，体现为半数有效浓度（EC50）的升高。在CRF07-BC亚型中，1132L分别使EC50升高2．55、19．35、28．05和6．13倍；T139K分别使EC50升高4．67、3．66、7．35、3．30倍；T139R分别使EC50升高1．82、4．69、25．12和1．89倍；在B亚型中，1132L分别使EC50升高3．91、4．61、6．38和3．56倍；T139K分别使EC50升高3．13、1．78、2．26和2．10倍；T139R分别使EC50升高5．79、3．99、5．78和2．75倍。PNL4．3．RT-132L／139K／139R与野毒株PNL4—3的复制速度相近，且P24均在第11天达到峰值。但与对照株BC—wT相比，BC—RT—1132L／T139R推迟了P24到达峰值的时间，BC—RT-T139R的P24值在第14天达到峰值，BC—RT-I132L在第21天达到峰值，且峰值略低。结论HIV-1CRF_BCRT区新的耐药相关位点1132L和T139K／R在B亚型及CRF07-BC亚型感染性克隆上均可降低病毒对NNRTIs的药物敏感性，1132L在CRF_07BC亚型的感染性克隆上能够降低病毒的复制能力。
焦洋黄洋李书明李臻鹏王彦殷倩倩马丽英
关键词：HIV-1药物敏感性
2017年北京市朝阳区婴幼儿腹泻病毒多病原监测结果分析被引量：9
2018年
目的及时总结和掌握北京市朝阳区2017年婴幼儿腹泻病毒多病原流行特征,并与历史数据进行比较,分析其病原谱变化情况,为制订该地区病毒性腹泻疾病的预防控制措施提供科学依据。方法收集北京市朝阳区2017年首都儿科研究所送检的婴幼儿腹泻粪便监测样本,应用实时荧光定量-聚合酶链反应(qPCR)和PCR技术对样本中的诺如病毒、肠道腺病毒、星状病毒进行核酸检测,应用酶联免疫吸附试验(ELISA)对样本中的轮状病毒进行抗原检测。结果 2017年共收集5岁以下婴幼儿腹泻粪便监测样本180份,经确诊轮状病毒44例,诺如病毒33例,肠道腺病毒15例,星状病毒15例,其中双重感染者8例[全部与诺如病毒和(或)轮状病毒有关]。男女性别比为2.2∶1,男女性别间阳性检出率差异无统计学意义(P>0.05)。0~4岁均可检出,4岁以上只检出轮状病毒。轮状病毒冬春季高发(12月至次年3月),诺如病毒全年均可发生(5~6月和8~12月感染比例较高),肠道腺病毒为秋冬季高发(8~12月),星状病毒流行季节性不明显。结论北京市朝阳区2017年监测腹泻患儿轮状病毒和诺如病毒感染率较高,且全部混合感染均与诺如病毒和(或)轮状病毒有关。应加强对病毒性腹泻的监测,预防暴发疫情尤其是轮状病毒和诺如病毒感染的发生。
焦洋高艳齐啸张士尧张玉松顾琳张越孙灵利
关键词：轮状病毒诺如病毒肠道腺病毒星状病毒
实时逆转录环介导等温扩增检测GⅡ.4型诺如病毒的研究被引量：3
2018年
目的建立快速检测诺如病毒GⅡ.4型的实时逆转录环介导等温扩增方法(RT-LAMP)。方法选取GⅡ.4型诺如病毒的ORF1与ORF2接头处较为保守的基因序列设计RT-LAMP引物并进行筛选,优化反应条件,分析方法的灵敏度、分析特异性和稳定性,采用优化的方法检测40例临床病毒性腹泻样本,结果与实时荧光逆转录PCR(RT-PCR)比较。结果该研究建立的诺如病毒GⅡ.4型RT-LAMP的最佳反应温度为65℃;该方法检测GⅠ型和GⅡ非诺如病毒4型、轮状病毒、札如病毒、星状病毒、腺病毒、CA16、EV71、CA6和CA10等常见10种其他腹泻病毒的结果为阴性;该方法对诺如病毒GⅡ.4型的检测能力与实时荧光RT-PCR相当;与实时荧光RT-PCR相比,该研究建立的RT-LAMP法检测诺如病毒GⅡ.4型阳性样本和诺如病毒阴性样本的符合率为100%。结论该研究建立的诺如病毒GⅡ.4型RT-LAMP快速检测方法灵敏度高,特异性好,为建立诺如病毒其他基因型的RT-LAMP检测方法奠定了基础。
赵剑虹张登城高艳焦洋张士尧李书明
北京市朝阳区1例输入性SARS-CoV-2全基因组序列分析被引量：1
2020年
北京市朝阳区在连续40d没有新增本土COVID-19确诊病例的情况下,出现了1例潜伏期超过14d的境外回国COVID-19确诊病例。为分析北京市朝阳区1例COVID-19患者是否为输入病例,进行了全基因组序列测定和遗传特性分析,本研究采用高通量测序技术配合Ion Torrent系列仪器和试剂对患者咽拭子中的SARS-CoV-2进行测序,同时应用对应插件或软件分析其全基因组同源性和变异情况。结果显示,该病例标本中测得1株SARS-CoV-2毒株,共29 876 bp,BLAST结果显示与其他国家和地区分离株的相似性高于与中国分离株的相似性。系统进化树中该毒株与2003年感染人的SARS冠状病毒和蝙蝠中分离的SARS冠状病毒明显不同,分处不同进化分支;该毒株与中国分离株分处不同的簇,而和美国分离株聚集在一簇。另外,突变分析显示存在3个改变氨基酸性质的非同义突变。本研究提示,该病例为美国输入的SARS-CoV-2感染病例,应注意境外输入性COVID-19的传播,并适当延长隔离观察期限;该毒株在患者的1例关联病例中发生了部分核苷酸突变,对SARS-CoV-2的致病力等的影响有待进一步研究。
韩桃利王海滨焦洋雷娜高艳赵剑虹田甜董歧段杉孙灵利
关键词：高通量测序输入病例
腹泻患儿粪便中沙门菌的血清型、药敏分析及脉冲场凝胶电泳分子分型研究被引量：9
2020年
目的研究2019年北京市朝阳区0~10岁腹泻患儿粪便中分离出的沙门菌的血清型、脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE)分子分型研究及耐药特点。方法对分离自腹泻患儿病例的47株沙门菌进行血清分型,采用微量肉汤稀释法进行27种抗生素的药敏实验;采用PFGE脉冲场凝胶电泳进行指纹图谱分型研究。结果47株沙门分为8种血清型,优势血清型有2种,分别为肠炎沙门菌23株占48.94%,鼠伤寒沙门菌14株占29.79%。47株沙门菌对磺胺异恶唑耐药率(57.45%)最高,其次为氨苄西林(48.94%)和链霉素(48.94%)。23株肠炎沙门菌可分成8个PFGE指纹图谱,14株鼠伤寒沙门菌可分成13个PFGE指纹图谱。结论北京市朝阳区0~10岁儿童食源性沙门菌血清主要为肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌,各血清型的耐药性有所不同,PFGE指纹图谱呈多样性。
顾琳高艳刘丹焦洋段杉张越
关键词：食源性疾患沙门菌血清型药敏实验脉冲场凝胶电泳
北京市朝阳区2011-2017年5岁以下腹泻患儿星状病毒感染的分子流行病学特征被引量：6
2019年
目的分析北京市朝阳区5岁以下儿童腹泻患者星状病毒感染的分子流行病学特征,为该地区制定相应的疾病防控策略提供依据。方法收集2011-2017年北京市朝阳区首都儿科研究所送检的1 451份5岁以下婴幼儿腹泻粪便监测样本和流行病学信息,利用逆转录-聚合酶链式反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)进行星状病毒核酸检测,对阳性PCR产物测序并进行系统进化分析。结果星状病毒检出的阳性率为4.76%(69/1 451)。对69份星状病毒阳性标本进行测序,获得36株序列。入托前(3岁以下)年龄段所检出的星状病毒占全部检出病毒株的80.56%(29/36)。系统进化分析结果显示,31株(86.11%,31/36)为经典的HAstV-1型星状病毒,同时检测到3株HAstV-4型星状病毒,2株HAstV-5型星状病毒,其他型未检出。HAstV-1型呈现典型的冬春季流行特点,HAstV-4和5型只在夏季和/或冬季检出。结论星状病毒是北京市朝阳区5岁以下儿童腹泻的重要病原体之一,主要感染3岁以下儿童;HAstV-1型是流行优势株,且不同基因型具有不同的季节流行特点。
焦洋孙灵利高艳齐啸张士尧顾琳张玉松赵剑虹张越马建新赵伟
关键词：星状病毒病毒性腹泻分子流行病学
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