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周元
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1
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人类免疫缺陷病毒-1CRF01_AE毒株在我国的分子流行特征分析
被引量:7
2015年
目的了解HIV-1CRF01_AE毒株在我国的分子流行特征。方法计算机检索相关数据库并结合文献追溯的方法提取数据,按地区和研究人群分组进行Meta分析,计算HIV-1CRF01_AE感染者占不同高危人群的比例。从美国洛斯阿拉莫斯国家实验室HIV基因数据库(LosAlamosdatabase)中下载中国地区的CRF01_AEpol区基因序列,利用FastTree2.1构建系统进化树进行成簇分析。根据BEASTV1.6.2和Spread计算贝叶斯因子分析空间地理传播关联。结果HIV-1CRF01_AE毒株在我国6个地区的MSM人群中所占比例均〉45.0%;在东部、北部、西南和中南地区的异性性行为人群中所占比例均〉30.0%;在中南地区的静脉药瘾人群中所占比例最高,为57.3%(95%CI:35.1%~79.6%);而输血传播人群仅在中南地区占有较低的比例,为10.6%(95%CI:6.2%~14.9%)。系统进化分析表明,该毒株在我国形成7个独立的传播簇,其中簇1、3、5主要流行于异性性行为感染人群中,簇2及簇6主要流行于MSM人群中,簇4主要流行于性行为感染人群中。簇1~5均在西南地区流行,中南地区主要流行簇7和簇1,北部地区主要流行簇2和簇6,东部地区主要流行簇2和簇4,东北地区主要流行簇6。贝叶斯因子分析结果显示,该毒株在我国东部、中南部、西南部、北部及东北部的省份之间传播关系错综复杂。结论CRF01_AE毒株活跃在我国各个地区的多个高危人群中,不同地区之间的传播关联错综复杂。
朱可心
庄勋
周元
高蓉
卫平民
钟平
陈颖
李春建
李小杉
关键词:
META分析
系统进化分析
贝叶斯定理
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