刘子臣
- 作品数:23 被引量:65H指数:5
- 供职机构:首都医科大学附属北京胸科医院更多>>
- 发文基金:首都卫生发展科研专项北京市科委重大项目北京市科技计划项目更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 脑脊液结核分枝杆菌游离核酸检测在结核性脑膜炎早期诊断中的价值
- 2023年
- 目的探讨脑脊液结核分枝杆菌游离核酸(Cf-TB)检测方法对结核性脑膜炎的早期诊断价值。方法前瞻性纳入2019年9月至2022年3月于首都医科大学附属北京胸科医院结核科、北京朝阳医院神经内科、解放军263医院神经内科就诊的疑诊为脑膜炎的患者189例,其中男性116例,女性73例,年龄7~85(38.5±19.1)岁。留取患者脑脊液标本分别进行Cf-TB检测、结核菌培养和利福平耐药实时荧光定量核酸扩增检测技术(Xpert MTB/RIF)检测,探讨不同检测方法对结核性脑膜炎的诊断价值。应用SPSS 20.0软件进行数据统计分析,以P<0.05差异有统计学意义。结果189例患者中,TBM组患者127例,非TBM组患者62例。Cf-TB检测的敏感度为50.4%(95%CI 41.4%~59.3%),特异度为100%(95%CI 92.7%~100%),阳性预测值为100%(95%CI 92.9%~100%),阴性预测值为49.6%(95%CI 40.6%~58.6%)。在以临床诊断为金标准时,Cf-TB检测的敏感度为50.4%(64/127),显著高于结核菌培养(8.7%,11/127)和Xpert MTB/RIF检测(15.7%,20/127),差异均有统计学意义(均P<0.001)。在以病原学检测方法为金标准时,Cf-TB检测的敏感度为72.7%(24/33),显著高于结核菌培养[33.3%(11/33),χ^(2)=10.28,P=0.001]而与Xpert MTB/RIF检测相似(60.6%(20/33),χ^(2)=1.091,P=0.296)。结论脑脊液Cf-TB检测敏感度高于脑脊液结核菌培养和Xpert MTB/RIF检测,可以为TBM的早期、快速诊断提供可靠的证据支持。
- 李雪莲梁清涛张芸郭茹刘子臣李琨高孟秋车南颖杨新婷段鸿飞
- 关键词:游离核酸结核菌培养
- EGFR敏感型肺腺癌38例TKIs治疗前及进展后EGFR基因变化分析被引量:1
- 2019年
- 目的观察表皮生长因子受体(EGFR)敏感型肺腺癌患者EGFR-TKIs治疗前及进展后EGFR基因变化情况,分析其导致耐药的可能机制。方法回顾性分析38例EGFR-TKIs治疗前及进展后均进行活检取材的肺腺癌患者,所有病例均采用ARMS法检测腺癌组织EGFR和KRAS基因突变状态。结果38例肺腺癌患者中,临床分期为ⅠA期1例,ⅢA期3例,ⅢB期2例.Ⅳ期32例。EGFR-TKIs治疗前,27例患者检测出EGFR基因19外显子缺失突变(19-del),11例患者检测出EGFR基因21外显子L858R点突变(L858R):EGFR-TKIs治疗进展后,17例患者EGFR基因突变状态没有改变(15例19-del和2例L858R);19例患者检测出EGFR基因20外显子T790M点突变(T790M),其中12例19-del+T790M双突变,6例L858R+T790M双突变;1例患者的EGFR基因L858R突变改变为19-del+L858R+T790M复合突变;1例患者的EGFR基因L858R突变改变为KRAS基因突(G12V),1例患者的EGFR基因L858R突变改变为EGFR基因野生型。此外,有2例患者EGFR-TKIs治疗进展后,病理组织学中发现了小细胞癌成分。28例患者给予EGFR-TKIs治疗进展后,T790M突变阳性的患者疾病无进展生存时间为18个月,T790M突变阴性的患者为9个月,差异显著(P<0.05).结论T790M突变是导致EGFR基因产生EGFR-TKIs耐药的主要突变类型,然而EGFR基因也可因发生KRAS基因突变、EGFR敏感突变位点发生丢失或改变等变化而产生耐药。
- 董宇杰刘子臣李琨王宇轩宋妖苏丹车南颖马丽
- 关键词:肺腺癌表皮生长因子受体
- 肺原发性腺样囊性癌的临床病理特征及PD-1、PD-L1、EGFR、ALK基因检测的临床意义
- 2019年
- 目的探讨肺原发性腺样囊性癌(PACC)的临床病理特征及PACC中程序性死亡受体1(PD-1)及其配体1(PD-L1)、表皮生长因子受体(EGFR)、间变性淋巴瘤激酶(ALK)基因表达的临床意义。方法回顾性分析36例PACC的临床病理特征,免疫组化采用EnVision法检测PD-1及PD-L1表达情况,ARMS方法检测EGFR基因突变,VENTANAALK方法检测ALK的蛋白表达情况。结果本组36例PACC患者,男性20例,女性16例,平均发病年龄57岁。其中腺管型15例、筛状型9例、实体型12例。所有PACC患者的PD-1均呈(-),1例PD-L1呈(+)。1例EGFR基因突变(19del),靶向药物(特罗凯)治疗有效。ALK蛋白表达均为(-)。在27例手术根治标本中,晚期分期(Ⅲ-Ⅳ)、残端阳性、神经侵犯、实体/筛状型及淋巴结转移与PACC预后差有明显相关性(P<0.05)。结论PACC是一类低度恶性肿瘤,但因发病部位与主支气管密切相关,手术困难,易出现残端阳性,导致多次复发与转移。EGFR突变率低,PD-L1蛋白阳性率也很低,但此类患者在靶向治疗和生物治疗中可能获益,因此常规肺癌基因检测和PD-L1蛋白检测临床仍需重视。
- 林海峰曲杨张海青周立娟苏丹刘子臣
- 关键词:腺样囊性癌PD-1PD-L1EGFRALK
- 荧光定量PCR技术在骨关节结核石蜡包埋标本检测中的应用价值被引量:17
- 2016年
- 目的探讨荧光定量聚合酶链式反应(fluorescent quantitative polymerase chain reaction,FQPCR)在骨关节结核石蜡包埋标本病理诊断及鉴别诊断中的应用价值。方法搜集2014年10月至2015年4月首都医科大学附属北京胸科医院病理科诊断形态学符合结核的93例患者的石蜡包埋标本,12例骨肿瘤患者的石蜡包埋标本。所有标本以FQ-PCR技术检测结核分枝杆菌DNA,以抗酸染色法查找抗酸杆菌。以卡方检验分析实验数据,比较FQ-PCR技术与传统抗酸染色法在骨关节结核诊断中的敏感度和特异度;观察不同发病部位与两种技术检测阳性率之间的相关性;以PCR-反向点杂交法对7例结核分枝杆菌DNA阴性而抗酸染色阳性患者进行非结核分枝杆菌检测。结果所有93例骨关节结核标本中FQPCR技术检测阳性77例,敏感度82.8%;抗酸染色查到抗酸杆菌64例,敏感度68.8%。FQ-PCR技术检测敏感度明显高于抗酸染色法(X2=5.659,P=0.021)。在不同发病部位FQ-PCR技术敏感度均高于抗酸染色法:在脊柱病变FQ-PCR技术和抗酸染色法阳性率分别为84.0%(42/50)和64.0%(32/50)(X2=0.009,P=0.609);在外周骨关节病变FQ-PCR技术和抗酸染色法阳性率分别为81.4%(35/43)和74.4%(32/43)(X2=12.609,P=0.002)。PCR-反向点杂交法检测确定戈登分枝杆菌1例。结论FQ-PCR技术较抗酸染色法显著提高了结核分枝杆菌阳性检出率,并为进一步检测非结核分枝杆菌做出重要提示,FQ-PCR技术在骨关节结核石蜡包埋标本检测中具有良好的应用价值。
- 穆晶赵丹刘子臣车南颖张海青
- 关键词:结核结核骨关节抗酸染色
- 40岁以下非小细胞肺癌中EGFR突变状态和PD-L1的表达被引量:2
- 2022年
- 目的回顾性分析47例手术切除的青年NSCLC患者的临床资料、EGFR突变特点和PD-L1的表达,了解这一群体的临床病理特点和分子特征。方法收集2014年1月—2019年12月于首都医科大学附属北京胸科医院行手术切除的年龄≤40岁的NSCLC患者,使用R语言进行倾向性评分,并按1:2匹配94例老年NSCLC患者的手术标本(≥60岁),采用ARMS-PCR检测EGFR突变,免疫组织化学方法检测PD-L1的表达。结果47例青年NSCLC患者的中位年龄为37岁,女性多见,腺癌为主。与老年组相比,青年组19外显子缺失(19del)和20外显子插入(20ins)比例更高,老年组21外显子L858R点突变比例更高。实体亚型成分为主的腺癌PD-L1阳性率明显增高。分组分析显示,青年组19del组PD-L1表达高于L858R组,老年组两种突变类型之间PD-L1表达差异无统计学意义。结论青年NSCLC以女性、腺癌、不吸烟患者为主,EGFR 19del和20ins构成比例高。实体型成分为主的腺癌PD-L1阳性率高于其他亚型。青年组EGFR 19del患者PD-L1表达高于L858R患者。
- 胡明明刘子臣张红梅鲁葆华李杰王群慧胡范彬林海峰李宝兰张同梅
- 关键词:非小细胞肺癌青年EGFRPD-L1
- EGFR突变晚期非小细胞肺癌患者后线接受免疫治疗的疗效分析被引量:11
- 2021年
- 背景与目的免疫检查点抑制剂单药治疗在驱动基因阳性的晚期非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer, NSCLC)患者中疗效甚微。研究表明,部分驱动基因阳性患者靶向治疗耐药后对免疫联合治疗仍有效。国内研究甚少。本研究旨在分析人表皮生长因子(epidermal growth factor receptor, EGFR)敏感突变NSCLC患者后线接受免疫治疗的疗效,评价真实世界免疫联合化疗在EGFR突变晚期患者后线治疗中的价值。方法收集2018年6月-2020年11月在首都医科大学附属北京胸科医院确诊的EGFR突变的初治晚期肺腺癌患者共27例,均在靶向治疗进展后接受了程序性死亡受体1(programmed cell death protein 1, PD-1)检查点抑制剂联合化疗以及抗血管生成药物治疗。结果27例晚期NSCLC患者中,未合并T790M突变的有19例(70.4%),合并T790M点突变的有8例(29.6%)。总客观缓解率为40.7%。Kaplan-Meier生存分析显示,不同EGFR突变类型之间接受含PD-1单抗治疗的无进展生存期(progression-free survival, PFS)均无统计学差异(χ^(2)=4.15, P=0.23)。未合并T790M突变的患者PFS较合并T790M突变的患者显著延长(9.2个月vs 3.3个月,χ^(2)=2.81,P=0.041),两者总生存时间未见统计学差异(12.2个月vs 7.3个月,χ^(2)=3.22,P=0.062)。未合并T790M的客观缓解率明显优于合并T790M的患者(52.63%vs 12.5%, P=0.045)。结论 EGFR突变患者人群能从后线免疫联合治疗中获益,但合并T790M突变的患者后线接受免疫联合治疗疗效差。因此,这部分患者的后续治疗和全程化管理需要探索更优的治疗策略来提高获益。
- 马丽秦娜张新勇吴羽华李浩洋俞孟军刘子臣王敬慧
- 关键词:肺肿瘤表皮生长因子受体免疫治疗
- HIV感染/AIDS患者感染性浅表淋巴结病的临床病理特征分析被引量:3
- 2021年
- 目的探讨HIV感染/AIDS患者感染性浅表淋巴结病组织病理学特征、致病病原体形态学特点和分布部位。方法回顾性分析2018年1月至2019年6月广西壮族自治区龙潭医院收治的,经组织病理学明确诊断为浅表性淋巴结感染性疾病的88例HIV感染/AIDS患者的淋巴结活检组织病理学特点,并对其标本进一步行抗酸染色、过碘酸雪夫(periodic acid schiff,PAS)染色及六胺银染色查找病原体,应用荧光定量PCR技术检测MTB DNA和荧光定量PCR熔解曲线法进行分枝杆菌菌种鉴定。结果88例患者淋巴结活检组织病理学诊断结果为MTB感染50例(56.8%)、马尔尼菲蓝状菌(Talaromyces marneffei,TM)感染32例(36.4%)、非结核分枝杆菌(nontuberculous mycobacterium,NTM)感染3例(3.4%)、MTB并发TM感染2例(2.3%)、隐球菌感染1例(1.1%)。其中苏木精-伊红(hematoxylin-eosin,HE)染色条件下,不同病原体感染的88例患者可有相同组织病理学表现,如23例(26.1%)MTB、TM、MTB并发TM、隐球菌感染患者可共同表现为典型肉芽肿伴坏死,19例(21.6%)MTB、MTB并发TM、TM感染患者可共同表现为不典型肉芽肿伴坏死;38例(69.1%,38/55)分枝杆菌感染患者可经抗酸染色找到分枝杆菌,34例TM和1例隐球菌感染患者可经PAS染色和六胺银染色找到真菌;分子病理检测MTB DNA阳性52例,菌种鉴定NTM感染3例。结论HIV感染/AIDS患者感染性浅表淋巴结病的组织病理学形态表现多样,不具有特异性,特殊染色和分子检测技术可提高确诊率。
- 林静张晨董宇杰刘子臣李琨车南颖
- 关键词:HIV感染淋巴结炎活组织检查
- 分子病理学诊断颈部淋巴结结核及其耐药性的应用价值
- 2019年
- 目的评价分子病理学方法诊断颈部淋巴结结核及其耐药性的临床应用价值.方法搜集2010年3月至2013年10月首都医科大学附属北京胸科医院病理科收治的符合纳入标准(临床症状和体征均符合颈部淋巴结结核、抗结核药物治疗均有效)的全部97例颈部淋巴结结核患者(结核组);以及符合纳入标准(通过病理学或临床检测结果明确诊断为其他淋巴结疾病)的全部20例其他淋巴结病变患者(非结核组)的石蜡包埋标本。所有标本以萋-尼(Z-N )抗酸染色法查找抗酸杆菌,荧光定量聚合酶链式反应(FQ-PCR)检测结核分枝杆菌特异基因序列IS6110;以临床最后诊断为标准,比较两种方法的检测效能;并对FQ-PCR检查结果为阳性且结核分枝杆菌DNA含量满足耐药突变检测下限的标本,以探针熔解曲线法检测利福平、异烟腓耐药相关基因突变情况.结果以临床最后诊断为标准,抗酸染色和FQ-PCR检测结核组的敏感度分别为22.7%( 22/97 )和67.0%(65/97 );FQ-PCR技术检测敏感度明显高于抗酸染色法,差异有统计学意义(X^2=38.53, P<0.001 ).抗酸染色和FQ-PCR检测非结核组标本均为阴性,特异度均为100.0%(20/20 ).抗酸染色和FQ-PCR的阳性预测值分别为100.0%(22/22)和100.0%( 65/65 ),阴性预测值分别为 21.1%(20/95 )和 38.5%(20/52 ),符合率分别为 35.9%(42/117)和 72.6%(85/117).对41例FQ-PCR检查结果为阳性且结核分枝杆菌DNA含量满足耐药突变检测下限的患者标本进行结核分枝杆菌耐药基因突变检测,利福平和异烟耕可评估标本分别为10份(例)和27份(例),其中利福平耐药1份(例),异烟腓耐药13份(例).结论分子病理学诊断技术在颈部淋巴结结核石蜡包埋标本中检测结核分枝杆菌DNA的敏感度和特异度较高,并且能筛查可能的耐药患者,可为颈部淋巴结结核的正确诊断与合理化治疗提供依据。
- 穆晶刘子臣宋婧李琨车南颖刘红刚
- 关键词:核酸扩增技术DNA探针
- 肺结核患者肺组织微生物组特征研究
- 2019年
- 目的探讨肺结核患者肺部病灶坏死区、肉芽肿区和正常肺区的微生物组基本特征.方法选取2016-2017年首都医科大学附属北京胸科医院10例临床及病理确诊为肺结核患者的福尔马林周定石蜡包埋(FFPE)的组织标本.通过显微切割技术分别获得FFPE组织的坏死区、肉芽肿区和正常肺区。采用高通量测序的方法,检测其微生物组特征.结果肺结核患者肺部切除标本中主要的微生物类群(门水平,相对丰度>1%)有Proteobacteria、Actinobacteria、Firmicutes、TM7和Bacteroidetes。在门水平上,坏死区、肉芽肿区和正常肺区的微生物群落组成未见差异。在属水平上,主要有7个类群(相对丰度>1%):坏死区、肉芽肿区、正常肺区相对丰度Ochrobactrum分别为( 50.70 ±6.76)%,(56.18 土 7.50 )%、( 61.31 ±7.95 )%;Sphingomonas 分别为(7.50 ±2.07 )%、(7.69 ±1.29 )%、( 3.81 ±2.08 )%;Corynebacterium 分别为(5.39 ± 2.39 )%、(5.23 ± 1.39 )%、( 7.43 ± 3.56 )%;Brevundimonas 分别为(1.67 ± 0.42 )%、(1.75 ± 0.67 )%、( 2.09 ± 0.34 )%;Brevibacterium 分别为(2.38 ± 2.23 )%、(2.60 ± 2.60 )%,(2.29 ±0.64)%;Sphingobacterium 分别为(0.72 ± 0.31 )%、( 0.78 ± 0.26)%,( 1.20 ± 0.38 )%和Enhydrobacter 分别为(1.25 ± 1.28 )%.(0.31 ±0.19)%.(0.67 ±0.80)%..基于Bray-Curtis距离的Adonis分析结果表明,在属水平上,坏死区和正常肺区,肉芽肿区和正常肺区中微生物群落组成差异有统计学意义(F值分别为3.94和4.76,P值分别为0.005和0.002 )。Mycobacterium的相对丰度非常低,主要存在于肺结核病灶的坏死区[(0.81 ± 1.92 )%].配对样品检验结果表明Mycobacterium的相对丰度在坏死区[(0.81 ± 1.92 )%]和肉芽肿区[(0.01 ±0.01 )%]、坏死区和正常肺区[(0.01 ±0.02)%]中差异有统计学意义(Z值分别为2.10和-2.37, P值分别为0.036和0.018 ).结论结核病患者肺部自坏死区、肉芽肿区到止常肺的组织变化中,Sphingomonas. Enhydrobacterx Kocuria和Mycobacterium的相对丰度�
- 王宇轩王冲董宇杰杜伟丽宋婧刘子臣李琨刘树库车南颖
- 关键词:活组织检查石蜡包埋
- 扩增子测序技术检测石蜡包埋组织标本耐药结核基因的研究
- 2020年
- 目的用基于多重PCR(mutiplex PCR,mPCR)扩增子的二代测序(next-generation sequencing,NGS)技术(mPCR-NGS)检测MTB的耐药基因突变,并评估其检测石端包埋组织标本诊断耐药结核病的临床应用价值。方法选取北京市昌平区结核病防治所2013年4月至2015年10月常规进行了利福平、异烟阱、乙胺丁醇、链霉素、卷曲霉素、卡那霉素、阿米卡星和氧氟沙星比例法检测且具有药敏试验结果的50栋MTB临床分离株,包括42株耐药MTB和8株敏感MTB菌株。参考耐药基因数据库及相关文献,针对以上8种抗结核药物主要耐药基因及常见位点设计耐药基因组合,建立有效的检测方案。收集首都医科大学附属北京胸科医院病理科2017年11月至2018年9月耐药结核病患者55例的石蜡包埋组织标本,探针熔解曲线法检测结果为利福平、异烟腓、乙胺丁醇和氟喹诺酮类至少存在一种耐药相关基因突变。首先对已知表型药敏试验结果的MTB临床分离株进行mPCR-NGS检测,验证该方法检测纯菌样本的有效性,再进一步检测结核病患者石蜡包埋组织标本进行临床验证。主要评价指标为敏感度和特异度以及一致性。结果以比例法为金标准,mPCR-NGS检测利福平、异烟阱、链霉素和乙胺丁酶的敏感度分别为95%(3840)、93%(2729)、93%(217129)和72%(13/18),特异度分别为100%(10/10)、95%(20/21)、100%(21/21)和94%(30/32);二线注射类药物卷曲霉素、卡那霉素和阿米卡星敏感度均为100%(22,3/3,3/3),特异度分别为9%(47148)、100%(3/33)和100%(4747),氧氟沙星的敏感度为70%(710),特异度为100%(40/40)。总符合率为94%,一致性检验Kappa值为0.87。纳人的55例石蜡包埋组织标本经探针熔解曲线法检测,28例利福平耐药,37例异烟腆耐药,13例乙胺丁醇耐药,17例氟喹诺酮类耐药。mPCR-NGS与探针熔解曲线法比较,利福平、异烟阱、乙胺丁醇和氟喹诺郦类的敏感度分别为100%(28/28)95%(35/37)、:100%(1
- 宋婧张治国董宇杰杜伟丽王宇轩刘子臣李琨张倩孙倩车南颖
- 关键词:石蜡包埋组织抗药性基因测定