何晓峰
- 作品数：3 被引量：8H指数：2
- 供职机构：江西科技师范大学生命科学学院江西省生物加工过程重点实验室更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金江西省教育厅科学技术研究项目江西省自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 东乡野生稻内生放线菌FORO54鉴定、全基因组测序及生物活性初步研究
- 东乡野生稻(Oryza rufipogon Griff.)为迄今所发现的世界上分布最北的野生稻,具耐寒、抗旱、耐贫瘠、抗虫抗病等优良品质。本文以课题组前期分离获得的东乡野生稻内生放线菌FORO54为对象,采用形态结合分子...
- 何晓峰
- 关键词：东乡野生稻内生放线菌全基因组测序抑菌活性稳定性
- 文献传递
- 小单孢菌(Micromonosporarosaria)DSM803全基因组测序及分析被引量：2
- 2016年
- 小单孢菌(Micromonospora rosaria)DSM 803是一种高GC含量的革兰氏阳性放线菌,分离自美国德克萨斯州土壤,能够合成玫瑰霉素抗生素。目前,还没有相关研究报道Micromonospora rosaria的全基因组序列,这限制了代谢产物合成途径和比较基因组学等研究。本研究首次通过高通量测序技术对小单孢菌DSM803进行全基因组测序,使用Velvet软件进行组装拼接得到310个Contigs,整个基因组大小约7.38 Mbp,GC含量为73.4%,序列已提交至美国国立生物技术信息中心(NCBI)的Gen Bank数据库(LRQV00000000)。比较基因组学及玫瑰霉素合成途径相关基因分析结果显示:小单孢菌DSM 803在碳水化合物转运和代谢及信号转导功能方面要明显强于其它功能;玫瑰霉素生物合成基因簇由20个基因组成并分散于4个Contigs中。本研究首次报道了一株大环内酯类抗生素玫瑰霉素生产菌小单孢菌DSM 803的全基因组序列,分析了基因组基本特征,预测了次级代谢产物合成基因簇,探讨了玫瑰霉素生物合成途径,为后续的进一步代谢调控与合成生物学提供了理论基础。
- 何晓峰杨慧林张志斌汪涯颜日明朱笃
- 关键词：小单孢菌全基因组测序基因簇
- 3株拮抗内生放线菌的鉴定及其抑菌活性初步研究被引量：6
- 2015年
- 对分离自江西东乡野生稻根部的3株内生放线菌进行鉴定和抑菌活性研究,根据菌株的形态与培养特征、生理生化特性及16S rRNA基因序列系统发育分析,将菌株FRo1、FRo2和FRo3分别鉴定为委内瑞拉链霉菌、娄彻氏链霉菌和肉质链霉菌.采用管碟法和菌丝生长速率法分析菌株拮抗病原细菌与病原真菌的活性.结果表明:菌株FRo1发酵液对所有测试细菌均有抑制作用,显示较广谱抑细菌活性;菌株FRo2显示出较强抑制金黄色葡萄球菌和7种病原真菌的活性,其中对金黄色葡萄球菌抑菌直径为22.33 mm,对小麦赤霉、水稻纹枯病菌、车前草核盘菌及胶胞炭疽菌的抑制率分别为70%、45%、58%和65%;而菌株FRo3发酵液对金黄色葡萄球菌、枯草芽孢杆菌及伤寒杆菌表现出不同程度的抑制,除车前草核盘菌外对所测试的病原真菌均有抑制活性,但抑制率均低于50%,这些菌株抑菌效果良好,显示出较好的生防潜力.
- 熊瑶瑶敖武李怡何晓峰张志斌朱笃
- 关键词：内生放线菌链霉菌属抑菌活性
