赵雅楠
- 作品数：14 被引量：48H指数：5
- 供职机构：黑龙江八一农垦大学食品学院更多>>
- 发文基金：“十二五”国家科技计划农村领域黑龙江省研究生创新科研项目国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学轻工技术与工程更多>>
- 基于SSR技术的水稻DNA指纹图谱构建被引量：4
- 2016年
- 水稻是我国重要的粮食作物,具有种植面积大、分布范围广等特点,然而由于水稻的遗传基础比较狭窄,在新品育种、品种区分及质量监控等方面经常出现问题。SSR技术作为第二代分子标记的典型代表,具有标记数量丰富、定位精准等优点,在水稻SSR指纹图谱的构建中提到不可替代的重要作用。该文主要综述了基于SSR技术构建的水稻DNA指纹图谱,对其技术要点及其构建意义进行分析,并对其发展趋势进行展望。
- 赵雅楠王颖张东杰沈琰杨义杰
- 关键词：SSR技术水稻DNA指纹图谱
- 食品中植物基因组DNA提取方法的分类及其研究进展被引量：4
- 2015年
- 食品中植物基因组DNA的提取是其进行DNA指纹图谱构建、遗传多样性分析、种质资源评估等研究的基础工作,选择合适的DNA提取方法 ,分离出高纯度、足产量的DNA是进行基因检测的重要前提。该文对近些年食品中植物基因组DNA的提取方法进行初步归类总结,并对技术研发前景进行展望。
- 赵雅楠王颖张东杰沈琰孙大庆杨义杰
- 关键词：食品DNA基因组
- 中国东北地区绿豆种质资源遗传多样性的SSR分析被引量：5
- 2017年
- 为了解东北地区绿豆种质资源的多样性,本研究基于SSR荧光标记毛细管检测技术,利用15对多态性丰富的SSR引物对东北三省地区156份绿豆种质资源进行遗传多样性分析。结果表明,15对SSR引物共检测到71个等位基因,平均等位基因数为4.7个,平均多态信息含量(PIC)为0.401。遗传相似系数变幅介于0.116~1.000之间,平均为0.542,大于0.5的相似系数占全部数据的73.69%。在遗传相似系数为0.478的阈值处可将参试个体分为5个组群,相同地理来源品种大多成簇分布。中国东北地区绿豆资源遗传多样性不够丰富,遗传基础狭窄,建议加强东北地区绿豆种质资源创新,拓宽遗传基础,丰富绿豆资源的遗传多样性。本研究结果为分析东北地区绿豆品种亲缘关系及新品选育提供了技术支持和理论依据。
- 赵雅楠王颖张东杰张东杰王丽侠
- 关键词：绿豆SSR荧光标记
- EST-SSR标记在谷类作物中的通用性研究进展
- 2016年
- EST-SSR标记是基于表达序列标签(Express Sequence Tags,EST)开发简单重复序列(Simple Sequence Repeats,SSR)的一种与功能基因直接相关的新型分子标记技术,因其在不同作物间具有较好的通用性而被广泛应用于作物基因组学研究。不同谷类作物间EST-SSR的通用性可降低引物开发成本、提高效率,为遗传研究较薄弱的作物奠定基础。文章概括介绍了EST-SSR标记,对其在不同谷类作物间及相比较于G-SSR标记的通用性情况进行简单归类分析,评述了EST-SSR标记的不足及其优化措施,以期利用EST-SSR高通用性的特点推动谷类作物基因组学的发展。
- 赵雅楠王颖张东杰沈琰杨义杰
- 关键词：谷类作物
- 辽宁地区绿豆品种SSR指纹图谱构建及品种鉴定被引量：6
- 2018年
- 目的:构建辽宁地区绿豆品种的DNA指纹图谱,建立一种快速准确的品种鉴定方法。方法:利用15对多态性丰富的简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)引物构建辽宁地区48份绿豆品种的指纹数据库及SSR指纹图谱。结果:15对引物共扩增出58个等位基因,每对引物检测到2~7个不等,平均为3.9,其中特异性条带13个,占总数的22.4%。多态信息含量介于0.114 5~0.776 4之间,平均为0.378 4。选择鉴别能力较强的5对引物组合,区分率为75%;15对引物组合,区分率为89.68%。构建了0/1形式的指纹数据库和SSR指纹图谱,除个别品种外均具有唯一性,可用于品种鉴定。结论:SSR指纹图谱的构建为绿豆品种鉴定提供了新的途径,为绿豆资源评价、保护及新品选育提供技术支撑和科学参考。
- 赵雅楠王颖张东杰
- 关键词：SSR指纹图谱绿豆
- 基于SSR标记的黑龙江省绿豆品种遗传多样性分析及指纹图谱构建被引量：2
- 2017年
- 目的:为明确黑龙江地区绿豆品种遗传多样性水平并构建SSR指纹图谱,为绿豆育种研究及品种鉴定奠定基础。方法:基于SSR荧光标记技术,利用筛选得到的14对SSR引物对黑龙江地区35份绿豆品种进行遗传多样性分析及SSR指纹图谱构建。结果:14对SSR引物在35个绿豆品种中共检测到49个等位基因,每对引物检测到2~7个,平均3.5个;多态性信息含量PIC值介于0.106~0.761之间,平均为0.398。参试品种遗传相似系数变幅介于0.6966~1.0000之间,平均为0.894,其中在0.82~0.86之间的遗传相似系数占全部数据的51.2%。在遗传相似系数为0.83的阈值处可将参试材料分为三大类群。构建了35份具有品种特异性的绿豆SSR指纹图谱及分子身份证,具有唯一性,可用于绿豆品种鉴定。结论:黑龙江地区绿豆品种遗传多样性水平不够丰富,SSR指纹图谱具可应用于绿豆品种真伪鉴定。
- 赵雅楠王颖张东杰
- 关键词：SSR分子标记技术绿豆遗传多样性分析指纹图谱构建
- 黑龙江省和吉林省谷子品种遗传多样性分析被引量：11
- 2016年
- [目的]探究黑龙江省、吉林省谷子种质资源的遗传基础和遗传多样性。[方法]利用黑、吉两省20个典型谷子品种及5对扩增良好且具有多态性的谷子SSR引物,分析各引物等位基因数、位点杂合度、Shannon′s指数（I）、有效等位基因数（Ne）及两省谷子品种聚类分析结果。[结果]每对引物检测出的等位基因数为4~6个,共得到26个等位基因,平均5.2个;各引物的多态信息含量（PIC）在0.645~0.767间变化,其中引物DG2831最高,引物QG7172最低。不同引物间位点杂合度、Shannon′s指数（I）、有效等位基因数（Ne）均存在差异,DG2831、JG13656分别是黑、吉两省的位点杂合度及多态信息含量最高的引物。对20个谷子品种进行聚类分析,在遗传相似系数在0.64处,20个谷子品种可聚为3大类。[结论]吉林省谷子品种基因多样性略比黑龙江省丰富;部分同地区的谷子品种聚为一类,说明不同地理来源的谷子资源,一部分品种的亲缘关系可能与地理来源有关。
- 沈琰王颖张东杰杨义杰赵雅楠张桂芳
- 关键词：谷子SSR遗传相似系数聚类分析
- 内蒙古地区绿豆品种遗传多样性SSR分析及DNA指纹图谱构建被引量：1
- 2017年
- 目的:分析内蒙古地区绿豆品种的遗传多样性并构建其DNA指纹图谱,为探明绿豆种质资源遗传背景及真伪鉴定提供科学依据。方法:以内蒙古地区92份绿豆品种为模板,利用筛选得到的10对多态性丰富的简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)引物对其进行遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建。结果:10对SSR引物共检测到58个等位基因,每对引物检测到3~10个不等;不同引物揭示的多态信息含量变幅介于0.371 4~0.773 7,平均为0.52。92份绿豆种质的遗传相似系数变幅介于0.033 4~1.000 0之间,平均为0.46。非加权组平均法聚类分析结果显示,在遗传相似系数为0.294 4时,可将92份绿豆种质分为两大类群。构建了92份绿豆品种的SSR指纹图谱及分子身份证,除个别品种外,大部分具有唯一性,可用于品种鉴定。结论:内蒙古地区绿豆种质资源的遗传多样性相对较丰富,但存在一定程度的近交现象,有待进一步加强引进基因资源,创新绿豆育种材料;构建绿豆SSR指纹图谱和分子身份证,对绿豆品种真伪鉴定、身份识别、溯源管理及原产地保护具有重要意义。
- 赵雅楠王颖张东杰王丽侠佐兆杭
- 关键词：SSR荧光标记绿豆遗传多样性分析指纹图谱构建
- 吉林省绿豆种质资源遗传多样性SSR分析及指纹图谱构建被引量：5
- 2018年
- 为分析吉林地区绿豆种质资源遗传多样性并构建DNA指纹图谱,明确吉林省绿豆资源遗传背景及品种真伪鉴定提供依据,以吉林省74份绿豆品种为材料,利用9对多态性丰富的SSR引物对其进行遗传多样性分析及SSR指纹图谱构建。9对SSR引物共检测到40个等位基因,每对引物检测到2~9个,平均为4.44,PIC值变幅介于0.076 8~0.725 4之间,平均为0.45;品种间遗传相似系数变幅介于0.111 1~1.000 0之间,平均为0.499 0。遗传相似系数在0.6~1.0之间有1 159个,占全部数据的42.91%;UPGMA聚类分析结果显示,在遗传相似系数为0.503 7的阈值处,可将74份绿豆材料分为三大类群,相同地理来源品种大多成簇分布;基于检测结果构建了0/1格式的DNA指纹图谱和分子身份证,为吉林省绿豆品种区分鉴别提供参考。吉林省绿豆品种间亲缘关系较近,遗传背景狭窄,遗传相似度较高,今后应加强种质资源引进与创新以丰富该地区绿豆资源遗传多样性;SSR指纹图谱及分子身份证的构建对绿豆品种真伪鉴定、溯源管理及原产地保护具有重要意义。
- 赵雅楠王颖张东杰
- 关键词：SSR荧光标记绿豆DNA指纹图谱
- 不同SSR标记检测技术在芸豆品种的遗传多样分析中的应用被引量：2
- 2017年
- 以黑龙江省20份芸豆品种为材料,分别应用银染法和荧光检测法检测8对SSR引物的扩增产物。聚类分析表明,两种方法均能将供试品种鉴别开,荧光检测法的等位变异及PIC较聚丙烯酰胺凝胶电泳检测更多更高,荧光检测法检测出的遗传多样性指数略高于银染法。结果表明荧光检测法较银染法灵敏度更高、检测结果更准确,更适于用于遗传多样性分析。
- 杨义杰王颖张东杰张东杰张桂芳赵雅楠
- 关键词：芸豆SSR银染法荧光检测法
