卞坤
- 作品数:5 被引量:14H指数:2
- 供职机构:浙江万里学院生物与环境学院更多>>
- 发文基金:浙江省自然科学基金国家自然科学基金宁波市自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 桃FLA家族基因的生物信息学及表达分析被引量:3
- 2017年
- 从桃基因组数据库筛选出了12个假定的成束状阿拉伯半乳糖蛋白(FLA)基因序列。对其蛋白结构进行分析,结果显示PpFLA7不具有特定的阿拉伯糖或半乳糖糖基化位点,不属于典型的FLA家族。PpFLA6的氨基酸组成和保守域的分布与其他成员相比差别较大。聚类分析结果表明PpFLAs家族可以分为CladeⅠ、CladeⅡ和CladeⅢ3类。利用荧光定量PCR(qPCR)对不同组织和成熟阶段果实中的FLA进行表达分析,发现各个成员在不同时期的组织中差异化表达,其中PpFLA4在果实成熟阶段显著上调表达,暗示其可能在桃果实的成熟阶段扮演重要角色。
- 卞坤邵佳蓉徐利伟沈子明陈伟杨震峰
- 关键词:果实阿拉伯半乳糖蛋白生物信息学
- 桃果实PpSIZ1基因对低温和外源褪黑素处理的响应被引量:11
- 2016年
- 为了探索SUMO E3连接酶(SIZ1)基因与桃(Prunus persica L.Batsch)果实采后低温贮藏期间冷害发生的关系,对桃基因组中的SIZ1基因进行生物信息学分析,同时采用qRT-PCR分析该基因在‘湖景蜜露’桃果实低温贮藏以及外源褪黑素减轻冷害进程中的表达特征。结果表明,Pp SIZ1开放阅读框全长2 637 bp,编码878个氨基酸组成的蛋白质多肽。进化树分析发现,PpSIZ1与梅Pm SIZ1的同源性最高,含有与拟南芥At SIZ1相似的SAP、PHD、PINIT、SP-RING和SXS保守结构域,属于SUMO E3连接酶家族。q RT-PCR分析表明,低温(0℃)胁迫能诱导桃果实PpSIZ1表达水平的提高;100和200μmol·L^(-1)褪黑素处理能显著减轻桃果实低温贮藏期间冷害的发生,其中100μmol·L^(-1)褪黑素处理抑制冷害的效果最好,这种效果可能与PpSIZ1介导的SUMO化有关。
- 邵佳蓉宋春波卞坤陈伟杨震峰
- 关键词:果实冷害褪黑素SUMOE3连接酶
- 桃果实PpSIZ1的生物信息学分析及其对低温和外源褪黑素处理的响应
- 为了探索SUMO E3 连接酶(SIZ1)基因与桃(Prunus persica L.Batsch)果实采后低温贮藏期间冷害发生中的关系,对桃基因组中的SIZ1 基因进行生物信息学分析,同时采用qRT-PCR 分析该基因...
- 邵佳蓉宋春波卞坤陈伟杨震峰
- 关键词:冷害褪黑素
- 桃果实PpSIZ1对低温和外源褪黑素处理的响应
- <正>低温贮藏是果实保鲜的最有效方法,但冰点以上的低温易导致许多冷敏性果实生理代谢失调而发生冷害(Lurie&Crisosto,2005)。因此,研究采后果实对低温胁迫的生理响应及提高果实采后抗冷性技术,一直是国内外水果...
- 邵佳蓉宋春波卞坤陈伟杨震峰
- 文献传递
- 桃果实PpSIZ1的生物信息学分析及其对低温和外源褪黑素处理的响应
- 为了探索SUMO E3 连接酶(SIZ1)基因与桃(Prunus persica L.Batsch)果实采后低温贮藏期间冷害发生中的关系,对桃基因组中的SIZ1 基因进行生物信息学分析,同时采用qRT-PCR 分析该基因...
- 邵佳蓉宋春波卞坤陈伟杨震峰
- 关键词:冷害褪黑素