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水华对中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)池塘养殖系统细菌群落及潜在致病菌的影响: 2024年; 近年来,水华频发制约着中华绒螯蟹养殖业的发展,环境微生物群落响应水华发生与消退机制是预防与治理水华的重要组成部分。为了解析中华绒螯蟹养殖系统细菌群落对水华的响应特征,采用16S rRNA基因扩增测序技术对拟浮丝藻水华下中华绒螯蟹养殖池塘细菌群落的组成、结构和潜在病原菌的变化进行了研究。结果显示,水体中的优势细菌类群为伯克霍尔德菌科(Burkholderiaceae)和微杆菌科(Microbacteriaaceae),底泥中的优势类群为Steroidobacteraceae菌科和Burkholderiaceae等;科水平下的蓝细菌门类群和其他大部分细菌群落呈显著正相关。养殖水体中潜在病原菌的丰度与水华的生消呈现出相反的趋势,OTU365和OTU1614(均属于Candidatus Similichlamydia epinepheli)是其主要的潜在病原菌,而在底泥中潜在致病菌表现出富集的特征,以OTU1280(大肠杆菌,Escherichia coli)为主。CCA结果显示,蓝藻暴发过程中,Tem、NO3--N、NO2--N及NH4+-N驱使水体蓝藻门细菌类群的变异,NO2--N是驱动养殖水体潜在致病菌群落变异的主导因子。研究结果为防治中华绒螯蟹养殖水华发生提供了宝贵的数据支撑。; 李彤李彤成永旭杨筱珍杨筱珍张德民张德民; 关键词：中华绒螯蟹水华细菌群落

健康和患病凡纳滨对虾幼虾消化道菌群结构的比较被引量：19: 2016年; 凡纳滨对虾养殖过程中,早期阶段是病害易感阶段,而消化道菌群结构与对虾健康关系密切。因此,探讨幼虾的消化道菌群尤其是弧菌类细菌与对虾发病的关系对病害有效防治具有重要意义。本实验采用Illumina测序研究了凡纳滨对虾健康和患病幼虾的消化道细菌群落结构,并基于纯培养和16S r DNA,rec A和pyr H基因序列比对,分析了幼虾消化道中弧菌的主要种类组成。结果发现,健康幼虾消化道中α-变形菌纲和厚壁菌门丰度较高,而患病幼虾中γ-变形菌纲、拟杆菌门、放线菌门和β-变形菌纲较高,其中放线菌门丰度差异显著。基于科水平的响应比分析,发现患病幼虾消化道中动性球菌科和噬菌弧菌科的丰度显著降低,而弧菌科的丰度显著升高。相似度分析发现,驱动群落变异的OTU主要来源于弧菌属、海洋杆状菌属、冷杆菌属、假交替单胞菌属以及未分类至属的红杆菌科和微杆菌科。健康幼虾消化道弧菌组成以锡那罗亚州弧菌为主,而患病幼虾消化道弧菌组成以坎氏弧菌为主。尽管健康和患病幼虾消化道内细菌群落结构整体差异不显著,但一些重要类群丰度变化显著,其特征与已知的生态功能一致。; 杨坤杰王欣熊金波裘钱玲琳黄雷张化俊郭安南李来国张德民; 关键词：凡纳滨对虾消化道菌群弧菌

用于检测哈维弧菌群的基因芯片及其使用方法: 本发明公开了用于检测哈维弧菌群的基因芯片及其使用方法，特点是芯片载体上固载有用于检测溶藻弧菌、坎氏弧菌、哈维氏弧菌、需钠弧菌、副溶血弧菌和轮虫弧菌的核苷酸探针，各个弧菌的探针均使用<i>toxR</i&...; 张德民郑嘉来唐姝闫永伟熊金波张化俊; 文献传递

一种绿色高产的南美白对虾养殖方法: 本发明公开了一种绿色高产的南美白对虾养殖方法，特点是包括养殖前期准备、角毛藻培养、碳源添加、饲养管理和水质监测等步骤，养殖前添加有益角毛藻占领生态位，养殖期间调节饲料和葡萄糖的输入比例，可刺激异养细菌吸收氮磷代谢废物大量...; 张德民黄雷刘紫丹张化俊杨坤杰陈伟; 文献传递

象山港硅藻赤潮过程中真菌群落演替及互作特征被引量：2: 2021年; 【背景】近岸海域赤潮的发生能显著改变包括真菌在内的微生物群落组成,进而影响海洋中碳氮元素循环。真菌是海洋中重要的分解者,但赤潮过程对真菌群落的影响少有报道。【目的】探明赤潮过程对真菌群落的影响,对进一步阐释赤潮对生态系统中物质循环的影响具有重要意义。【方法】针对2017年春季象山港硅藻赤潮,对真菌内源转录间隔区1 (Internally Transcribed Spacer 1,ITS1)序列进行高通量测序,研究赤潮过程中真菌群落响应及共现性特征。【结果】真菌群落的α多样性指数在赤潮暴发的各阶段差异显著,而且均与磷酸盐、硝酸盐和亚硝酸盐有显著相关性(P<0.05)。子囊菌门(Ascomycota,90.2%)和担子菌门(Basidiomycota,8.27%)是本次硅藻赤潮的优势菌门,其中子囊菌门遍布赤潮暴发的4个阶段;锤舌菌纲(Leotiomycetes,16.1%)和散囊菌纲(Eurotiomycetes,9.3%)是纲水平上的主要优势类群。赤潮暴发过程中硝酸盐、亚硝酸盐、磷酸盐和温度等环境因素的改变,驱动真菌群落组成及结构发生显著变化。Helotiales、Eurotiales、Xylariales、Saccharomycetales和Agaricostilbales构成了真菌群落共现网络的主体。【结论】真菌群落在赤潮的各阶段具有显著的演替特征,赤潮藻生消是引起真菌群落演替的主要因素,但是环境因子也扮演着重要角色。赤潮过程中,真菌群落同类群内的互作要强于不同类群间的互作,这对维持群落的稳定性具有重要意义。; 谢伟娟陈晨赵志颖张继宁侯繁荣张德民张化俊; 关键词：真菌群落高通量测序象山港

漂白粉消毒后对虾养殖源水细菌群落的响应特征研究: 2024年; 漂白粉消毒是凡纳滨对虾养殖源水常见的管控措施,可有效控制病原菌传播;然而,消毒会强烈扰动水体微生物群落,但源水细菌群落对漂白粉消毒的响应特征尚未阐明。在室内条件下,设置高浓度(60 mg/L)和低浓度(20 mg/L)漂白粉消毒源水,通过高通量测序及荧光定量PCR技术探究消毒后源水细菌群落、病原菌及抗生素抗性基因(ARGs)的动态响应规律。结果显示,消毒后,拟杆菌门(Bacteroidota)丰度上升,高浓度组变形菌门(Proteobacteria)的丰度显著降低;至第3天,两组源水的细菌群落组成趋于一致。此外,漂白粉消毒显著改变了源水的细菌群落结构及共现网络的复杂性。在控制水体病原菌方面,消毒后病原菌的总丰度降低,但种类增加,高浓度漂白粉消毒对病原菌的抑制作用更加显著。漂白粉消毒对ARGs的去除具有选择性,仅对sul1、floR、cfr、tetQ有一定的去除作用,且高、低浓度对ARGs的去除无差异。综上,60 mg/L可以作为漂白粉消毒养殖源水的更好浓度选择。研究结果从微生物生态视角评价了不同浓度漂白粉的消毒作用,可为对虾养殖生产中的源水管控提供理论支撑。; 王庚申王庚申李彤李彤谢建军许文军谢建军许文军; 关键词：漂白粉细菌群落抗性基因

用于检测哈维弧菌群的基因芯片及其使用方法: 本发明公开了用于检测哈维弧菌群的基因芯片及其使用方法，特点是芯片载体上固载有用于检测溶藻弧菌、坎氏弧菌、哈维氏弧菌、需钠弧菌、副溶血弧菌和轮虫弧菌的核苷酸探针，各个弧菌的探针均使用<I>toxR</I>基因为靶基因，各探...; 张德民郑嘉来唐姝闫永伟熊金波张化俊

宁波象山海域表层沉积物细菌群落季节性分布特征研究被引量：2: 2017年; 分别在2013年夏季及2014年冬季采集宁波象山海域7个站位的表层沉积物样品,利用16S rRNA基因扩增子MiSeq测序技术研究了沉积物细菌群落的季节性分布特征.研究发现:宁波象山海域海洋沉积物细菌群落主要由γ-变形菌纲、δ-变形菌纲、酸杆菌门、α-变形菌纲、绿弯菌门和拟杆菌门组成;沉积物细菌群落的时空分布同时受地理距离、季节和环境理化因子等影响,其中地理距离占主导地位,且冬季地理距离对群落的影响更大.; 钱鹏王思鹏梁春玲张化俊王凯刘莲费岳军张德民; 关键词：近海沉积物细菌群落生物地理学

三门湾微型浮游生物丰度的时空变化特征被引量：1: 2018年; 粒径小于20μm的微型浮游生物能迅速响应海洋环境变化,因而在海洋环境监测中起着重要作用。本文应用流式细胞技术研究了三门湾表层与底层海水中微型浮游生物(包括细菌、聚球藻、微型真核生物以及病毒)丰度的时空分布特征,探讨了微型浮游生物丰度与水体理化因子之间的关系。结果表明,三门湾海域微型浮游生物丰度范围:细菌,6.98×10~5~9.84×10!6 cells/mL;聚球藻,1.10×10~3~3.71×10~4 cells/mL;微型真核生物,1.04×10~3~3.75×10~4 cells/mL;病毒,1.01×10~6~3.47×10~7 mL^(-1)。夏、秋两季表层微型浮游生物丰度均高于底层;秋季细菌、聚球藻和病毒丰度低于夏季,但微型真核生物丰度高于夏季;温度是造成微型浮游生物丰度季节差异的主要因素。微型浮游生物丰度的水平分布在夏季无显著规律,但秋季表底层均由内湾向外湾递减。秋季,除底层的细菌外,微型浮游生物丰度水平分布与pH和盐度呈显著负相关,同时与亚硝氮、硝氮、铵氮、叶绿素a呈显著正相关。; 沈丽新王思鹏梁春玲张化俊王凯彭欣刘俊峰张德民; 关键词：微型浮游生物流式细胞术

蔗糖输入对凡纳滨对虾养殖系统真核微生物群落的影响被引量：2: 2021年; 利用18S rRNA基因高通量测序,研究蔗糖输入条件下凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)养殖系统中水体与絮团的真核微生物群落组成及其相互作用关系。结果表明,输入蔗糖能显著改变对虾养殖系统中真核微生物群落组成,促进水体中纤毛虫和轮虫的生长,对水体绿藻的过度生长有一定抑制作用。Mantel分析发现,在第28天时,蔗糖添加以及系统中的溶解氧、亚硝酸盐和磷酸盐对真核微生物群落结构变异有显著影响。利用共线性网络分析表明碳氮比的增加可以增强水体和絮团中不等鞭毛类、纤毛虫和轮虫的相互作用,对养殖体系中藻类的过度繁殖具有一定的抑制作用。研究揭示了在蔗糖输入条件下凡纳滨对虾养殖系统中真核微生物群落的演替规律及絮团和水体微生物相互作用特征,为生物絮团技术持续稳定的应用于对虾养殖系统提供理论支持。; 鲍方剑黄雷陈伟王思鹏陈琛黄晓林张德民张化俊; 关键词：对虾养殖凡纳滨对虾

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张化俊

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