郭月
- 作品数：32 被引量：27H指数：3
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- 相关领域：农业科学自动化与计算机技术生物学医药卫生更多>>
- 一种批量提取基因组基因信息并翻译比对分析序列的方法
- 本发明公开了一种批量提取基因组基因信息并翻译比对分析序列的方法。本发明所提供的批量提取基因组基因信息并翻译比对分析序列的方法综合运用了基于多序列比对分析的MUSCLE程序，并结合多个Perl脚本语言编程的方法。实验证明，...
- 郭月刘静胡茂龙浦惠明张洁夫龙卫华张维周晓婴孙程明
- 文献传递
- 一种非转基因抗除草剂油菜基因及其应用
- 本发明公开了一种非转基因抗除草剂油菜突变型基因，所述突变型基因仅在BnALS1基因片段的第1696位碱基由G突变为T。本发明还公开了含有所述突变型基因编码的突变蛋白以及用于扩增所述突变型基因片段的等位特异性引物对。本发明...
- 胡茂龙浦惠明龙卫华高建芹张洁夫郭月彭琦陈锋周晓婴张维王晓东
- 文献传递
- 粳稻茬肥油两用油菜品种筛选及肥田潜力分析
- 2025年
- 油菜是我国最主要的油料作物,同时也是良好的用地养地作物。为充分利用冬闲田扩种油菜,缓解晚熟粳稻油菜轮作茬口矛盾并筛选肥油兼用油菜品种,选取了江苏省生产上8个代表性油用品种,含4个品种间杂种和4个三系杂交种,连续2年在南京江宁区和南京玄武区2个晚熟粳稻田开展试验,比较不同品种翻压还田时的生物量,全氮、全磷、全钾含量和全氮、全磷、全钾养分累积量。结果表明,在正常肥力投入情况下,品种间杂种的生物量总体高于三系杂交种。其中,宁R201>宁R101>宁杂127>宁杂1818,且宁R201、宁R101和宁杂127的生物量均超过对照秦优10号10%以上。说明这3个品种作绿肥可以为土壤提供更多的有机质。全氮、全磷、全钾总养分的累积量分析结果表明,宁R101、宁R201、宁杂127和宁杂1818均超过对照10%以上,说明这4个品种均具有较高的肥田潜力。综上,宁R101、宁R201和宁杂127品种不管是盛花期总生物量,还是氮磷钾的肥田潜力,均符合肥用品种的筛选要求,可作为江苏省粳稻茬肥油两用品种。
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- 关键词：甘蓝型油菜生物量
- 大豆HGm1 helitron转座元件的鉴定与生物信息学分析
- 2016年
- [目的]helitron转座元件是近年来发现的一种结构新颖和转座方式独特的DNA转座子。我们从全基因组水平上对大豆基因组中拷贝数最多的helitron HGm1家族进行深入分析,旨在为后续进一步明确helitron转座元件在大豆及其近缘种基因和基因组演化中所起的作用提供帮助。[方法]利用基因组学和生物信息学的研究手段,我们对大豆HGm1家族的数量、结构特征、染色体分布、插入基因情况,基因片段的捕获及表达模式等进行了详细的研究。[结果]从公开发表的大豆基因组序列中共鉴定出254个HGm1转座元件。这些元件的3'末端十分保守,主要由GC含量较高的碱基组成。HGm1元件主要分布在AT丰富的区域,并在重组受到显著抑制的异染色质区域富集。研究还发现,68个元件被83个外源的转座元件插入;64个元件插入到编码蛋白的基因附近(<2 kb);115个元件携带154个完整的外源基因;52个元件有潜在的转录活性,在根、茎、叶、花和种子中,以及干旱胁迫和组织培养条件都有所表达。[结论]与玉米中有关helitron的研究结果相似,HGm1家族在大豆基因组中经常以巢式的结构存在,具有频繁插入到基因附近和捕获基因的现象,并且部分成员具有潜在的转录活性。而与玉米helitron不同的是,大豆HGm1 helitron家族主要分布在基因贫乏的异染色质区域。因此,HGm1家族在改变大豆基因结构和调节基因表达以及影响大豆基因组的演化过程中具有较为重要的作用。
- 彭珍刘静郭月李英杜建厂
- 关键词：大豆捕获转录
- 一种批量合并分枝角度测量文件的方法
- 本发明公开了一种批量合并分枝角度测量文件的方法，将所有的单株测量文件放在同一个文件夹中，遍历文件夹下文本文件，将文件名放入一个列表；循环读取文件，如果文件的行数非3的整数倍，将文件名添加至error_sample.txt...
- 孙程明张洁夫胡茂龙付三雄浦惠明王晓东彭琦高建芹陈锋张维龙卫华郭月陈松周晓婴
- 基于matK基因的江苏地方豆类植物的亲缘关系研究
- 豆类,泛指能够产生豆荚的豆科作物,在植物学分类上属于豆科(Leguminosae)蝶形花亚科(Papilionaceae).叶绿体matK 基因位于叶绿体赖氨酸trnK 基因的内含子中,为长度1500 bp 的单拷贝编码...
- 王彤刘静郭月袁娜杜建厂
- 关键词：豆类植物MATK基因亲缘关系
- 一种批量提取基因组基因信息并翻译比对分析序列的方法
- 本发明公开了一种批量提取基因组基因信息并翻译比对分析序列的方法。本发明所提供的批量提取基因组基因信息并翻译比对分析序列的方法综合运用了基于多序列比对分析的MUSCLE程序，并结合多个Perl脚本语言编程的方法。实验证明，...
- 郭月刘静胡茂龙浦惠明张洁夫龙卫华张维周晓婴孙程明
- 一种批量计算基因组直系同源基因进化速率的方法
- 本发明公开了一种批量计算基因组直系同源基因进化速率的方法。本发明所提供的计算基因组直系同源基因进化速率的方法综合运用了基于Blast成对比对结果后进行聚类搜索直系同源基因的InParanoid程序，基于多序列比对分析的M...
- 郭月刘静杜建厂
- 文献传递
- 一种批量计算近缘物种间基因组编码区SNP位点的方法
- 本发明公开了一种批量计算近缘物种间基因组编码区SNP位点的方法。本发明所提供的计算近缘物种间基因组编码区SNP位点(coding SNP，cSNP)的方法综合运用了基于Blast成对比对结果后进行聚类搜索直系同源基因的I...
- 郭月刘静杜建厂胡茂龙浦惠明张洁夫龙卫华张维周晓婴
- 全基因组分析鉴定正向选择基因并揭示其在白菜基因组中的分布、表达和甲基化概况
- 普遍认为,正向选择是生物机体表型多样化背后的主要进化力量之一。然而,正向选择基因的特征性质尚缺乏具体详细的研究。本研究中,我们对白菜和甘蓝间的直系同源基因进行了全基因组分析,最终得到468个潜在的正向选择基因。结果表明:...
- 郭月刘静彭珍李英候喜林杜建厂
- 关键词：甲基化白菜
- 文献传递
