张志敏
- 作品数:5 被引量:33H指数:5
- 供职机构:中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心更多>>
- 发文基金:国家科技重大专项中美艾滋病防治合作项目北京市科技计划项目更多>>
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- 云南省德宏傣族景颇族自治州中国和缅甸籍吸毒人员HIV感染现状及其影响因素被引量:6
- 2016年
- 目的分析云南省德宏傣族景颇族自治州(德宏州)中国和缅甸籍吸毒人员HIV感染现状及其影响因素。方法于2014年10月至2015年9月期间,对德宏州所辖5个县市所有戒毒所内的7867名吸毒人员进行问卷调查和HIV抗体检测。剔除信息不完整者及非自愿参加本调查者,共7756名吸毒人员纳入本研究,其中,中国籍5389名,缅甸籍2367名。采用x。检验分别比较中国和缅甸籍不同特征吸毒人员HIV感染差异,采用多因素非条件二分类logistic回归模型分别分析两国籍吸毒人员感染HIV的影响因素。结果7756名戒毒人员的年龄为(35.45±10.91)岁,HIV感染率为7.18%(557例),其中中国籍为6.22%(335/5389),缅甸籍为9.38%(222/2367)(X2=24.21,P〈0.001)。中国籍吸毒人员中,与≤25岁者相比,25—34、35~44和〉145岁者感染HIV的0R(95% CI)值分别为2.88(1.46~5.69)、5.72(2.87~11.40)和3.48(1.66~7.27);与在婚者相比,未婚者和离异或丧偶者感染HIV的OR(95% CI)值分别为1.44(1.08—1.93)和1.56(1.09 - 2.24);与汉族相比,景颇族感染HIV的0R(95% CI)值为1.47(1.07—2.04);与非静脉注射者相比,静脉注射者感染HIV的OR(95%CI)值为12.48(9.73~16.01)。缅甸籍吸毒人员中,与女性相比,男性感染HIV的OR(95% CI)值为0.50(0.26—0.93);与≤25岁者相比,25~34、35~44和≥45岁者感染HIV的OR(95% CI)值分别为1.82(1.18-2.77)、2.90(1.82~4.62)和2.31(1.24—4.30);与汉族相比,景颇族感染HIV的0R(95% CI)值为2.22(1.44~3.41);与非静脉注射者相比,静脉注射者感染HIV的OR(95% CI)值为10.61(7.68~14.64)。结论缅甸籍吸毒人员的HIV感染率高于中国籍吸毒人员;中国籍吸毒人员的艾滋病防治重点应在≥25岁、非�
- 唐仁海张志敏杨跃诚冯凯迪杨世江张静娜叶润华邱茂锋段松
- 关键词:HIV吸毒人群
- 云南省德宏傣族景颇族自治州中国与缅甸籍吸毒人员的丙型肝炎病毒基因型分析被引量:6
- 2016年
- 目的分析云南省德宏傣族景颇族自治州(德宏州)中国和缅甸籍吸毒人员的丙型肝炎病毒(HCV)基因型分布特征。方法于2015年1—9月间,选取德宏州内各戒毒所和美沙酮门诊吸毒人员为研究对象,共7545名,对其进行问卷调查并采集血浆样本。其中HCV抗体阳性的样本为752份,采用随机数字表法抽取血浆量为200μl以上的样本共139份(中国籍和缅甸籍样本分别75和64份)进行核酸提取和HCV核酸扩增、测序,采用MEGA6.06软件建立系统进化树,并对不同的基因亚型进行分组后计算样本间的平均基因离散率。采用Fisher确切概率法比较不同特征研究对象HCV亚型分布情况,采用方差分析比较CE1和NS5B区不同亚型基因离散率差异。结果64份缅甸籍样本扩增成功43份(67%),其中CE1和NS5B区分别成功扩增31和38份;75份中国籍样本扩增成功52份(69%),其中CE1和NS5B区分别成功扩增43和45份。成功扩增的样本中,中国籍和缅甸籍的吸毒人员HCV基因亚型均以3b和6n为主,中国籍中分别占27%(14份)和37%(19份),缅甸籍中分别占28%(12份)和33%(14份);其他亚型中(6u、3a、1a、1b型),中国籍样本分别占14%(7份)、19%(10份)、2%(1份)、2%(1份),缅甸籍样本分别占16%(7份)、5%(2份)、16%(7份)、2%(1份),1a亚型缅甸籍高于中国籍(P=0.015),3a亚型中国籍高于缅甸籍(P=0.031)。CE1区1a、1b、3a、3b、6n和6u亚型的基因离散率分别为0.048±0.007、0.091±0.013、0.074±0.008、0.061±0.006、0.136±0.009、0.031±0.005(F=516.26,P〈0.001),NS5B区1a、1b、3a、3b、6n和6u亚型的基因离散率分别为0.032±0.006、0.065±0.012、0.058±0.008、0.041±0.005、0.059±0.008、0.045±0.006(F=45.11,P〈0.001)。结论德宏州吸毒人员中HCV存在6种亚型,6n�
- 王译葵冯凯迪王继宝张志敏唐仁海叶润华张静娜杨跃诚邱茂锋段松
- 关键词:丙型肝炎病毒吸毒人员基因型
- 高通量测序技术用于丙型肝炎病毒感染溯源调查被引量:7
- 2016年
- 目的:建立检测丙型肝炎病毒(HCV)准种群的Hiseq高通量测序(Hiseq测序)技术,并调查一起疑似通过共用针具传播HCV的案例。方法针对2015年1月15日在美沙酮门诊发现的1例HCV抗体阳转静脉注射吸毒者(编号P1),调查在其可能感染HCV的时期内(2014年3月24日之后)与其共用针具、HCV抗体阳性的4例静脉注射吸毒者(编号P2~P5)的流行病学信息,并以与P1在同一美沙酮门诊服药或者居住在同一乡镇、HCV抗体阳性的28例静脉注射吸毒者(编号C1~C28)作为研究对照。分别采集上述33名的全血样品5 ml,提取血浆中的RNA并逆转录后进行HCV基因亚型分析,对亚型与P1相同的样品进行Hiseq测序,分析样品中HCV的准种分布情况,计算样品内和样品间的基因离散率,绘制系统进化树。结果 P1样品的基因亚型为3b,与其亚型相同的样品有P2、C7、C12、C14、C15、C16、C19、C20、C28。其中9份成功进行了Hiseq测序,获得的有效序列数为249753~1086333条(平均869608条)。剔除重复序列后,获得3~172个(平均48个)独特准种群的序列。9份样品的样品内基因离散率中位数(P50)为0.4%~12.3%;P1与其余8份样品间基因离散率的P50(P25,P75)分别为19.0%(18.4%,19.8%)、10.4%(2.8%,18.3%)、19.6%(17.8%,21.4%)、24.9%(23.8%,26.1%)、19.8%(18.7%,20.7%)、20.1%(18.9%,21.2%)、20.6%(20.0%,21.1%)、23.6%(22.4%,24.8%),差异无统计学意义(T=9.40,P=0.100);P1与C7个别准种群间的基因离散率为0。系统进化分析显示, P1与P2之间无传播关系,但与C7之间可能存在传播关系。结论 Hiseq测序技术可以在准种水平上有效地用于HCV感染溯源调查,具有高通量、操作较简便、成本相对低、实用价值较高的特点。
- 张静娜王译葵蒋岩龙玉存王继宝冯凯迪唐仁海张志敏段松赵琦张桂云邱茂锋
- 关键词:分子流行病学高通量测序技术
- 深度测序用于分析抗病毒治疗急性期感染者的HIV-1准种群变化被引量:8
- 2017年
- 目的建立针对艾滋病病毒I型(HIV-1)三个基因区片段的Illumina Hiseq深度测序(简称Hiseq测序)方法,并尝试用于分析抗病毒治疗急性期感染者的HIV-1准种群变化规律。方法对2例在急性期启动抗病毒治疗的HIV-1感染者进行随访检测,直至第96周。提取外周血单个核细胞(PBMC)中的脱氧核糖核酸(DNA),对基线血液样本进行HIV-1基因亚型分析。分别以gag、pol和env基因区为目的片段,对基线及随访样本进行巢式聚合酶链反应(PCR),扩增产物经一代测序确认无误后纯化、混合构建DNA文库,进行Hiseq测序。分析HIV-1准种群分布,计算基因离散率,并做系统进化树分析。结果接受抗病毒治疗后,2例感染者体内的HIV-1病毒载量下降,到第12周后无法检出;CD4+T淋巴细胞数在治疗第2、4周时有所下降,随后回升。2例感染的HIV-1毒株分别为CRF01_AE亚型和CRF07_BC亚型。核酸扩增成功的样本全部成功进行了Hiseq测序,每个目的基因区片段都获得了十万级的序列数。在基线点,频数最高的第一个准种群序列的频数占全部序列总频数的比例均超过50%。抗病毒治疗后,准种群的分布发生不同程度的变化,其中频数第一准种群频数所占比例先减小,从第12周起多数增大,第72周再减小。样本内平均基因离散率整体稳定,小范围波动。每个样本3个基因区各随访时间点与基线点之间的平均基因离散率在治疗第2周增大,随后保持稳定。系统进化树显示,不同时间的准种群序列散在分布且距离接近。结论针对HIV-1 gag、pol和env基因区的Hiseq测序方法可有效用于分析HIV-1准种群的变化规律,早期抗病毒治疗可降低病毒载量调定点且延长准种群分散时间。
- 冯凯迪张志敏张秋月宋爱心蒋岩于凤娇马仲慧潘品良张彤吴昊粟斌邱茂锋
- 关键词:艾滋病病毒I型抗病毒治疗准种进化
- 2010-2012年北京市部分地区MSM中HIV-1急性期感染者的毒株亚型和流行状况被引量:6
- 2017年
- 目的研究北京市男男性行为者(MSM)艾滋病病毒1型(HIV-1)感染者的毒株亚型、流行现状和变化规律。方法采用单纯随机抽样的方法,抽取北京佑安医院2010-2012年新发现的MSM HIV-1急性期感染者的血样共100人份,采样前均未进行抗病毒治疗。提取外周血单核细胞(PBMC)中的脱氧核糖核酸(DNA),用巢式聚合酶链式反应(PCR)扩增病毒env、gag和pol基因区序列,三区中如有扩增失败,则尝试提取血浆中的核糖核酸(RNA),反转录后进行巢式PCR扩增。PCR产物测序后进行基因亚型分析。计算pol基因区样本间基因离散率,并做系统进化树分析。结果有96份样本的基因序列扩增成功,检出的基因亚型有CRF01_AE、CRF07_BC、B、B′、CRF55_01B、CRF65_cpx和未知亚型,所占比例依次为42.7%、25.0%、15.6%、1.0%、1.0%、3.1%和11.5%。前3种亚型合计占83.3%。各亚型所占比例与相关文献相比有明显变化,表现为CRF07_BC亚型所占比例的快速上升和B亚型所占比例的显著下降。发现了新亚型CRF65_cpx、CRF55_01B和一些未知亚型。结论 2010-2012年,北京市MSM HIV-1急性期感染者的HIV-1毒株亚型分布与相关报道相比已经发生改变,建议对北京地区HIV-1毒株的流行和变异进行密切监测。
- 张志敏夏炜周月芳蒋岩吴昊冯凯迪于凤娇粟斌邱茂锋
- 关键词:艾滋病病毒1型男男性行为者基因亚型系统进化树