许家磊
- 作品数：4 被引量：61H指数：2
- 供职机构：中国农业科学院甘薯研究所更多>>
- 发文基金：江苏省农业科技自主创新基金国家现代农业产业技术体系建设项目国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 基于甘薯徐781和徐薯18转录组测序的SNP标记开发
- 单核苷酸多态性(SNP)是近年来被认为最有发展潜力的第三代分子标记。本实验室利用Illumina RNA-seq技术，从淀粉含量、薯干产量和茎线虫病抗性差异明显的徐781和徐薯18测序结果中已获得1，386个SNP候选位...
- 许家磊
- 关键词：甘薯单核苷酸多态性
- 文献传递
- SNP检测方法的研究进展被引量：55
- 2015年
- 作为近年来最有发展潜力的第三代分子标记,单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)在遗传分析中得到了广泛应用。目前SNP的检测方法大致可以分为两大类:一大类是以单链构象多态性(SSCP)、变性梯度凝胶电泳(DDGE)、酶切扩增多态性序列(CAPS)、等位基因特异性PCR(allele-specific PCR,AS-PCR)等为代表的以凝胶电泳为基础的传统经典的检测方法。另一大类是以直接测序、DNA芯片、变性高效液相色谱(DHPLC)、质谱检测技术、高分辨率溶解曲线(HRM)等为代表的高通量、自动化程度较高的检测方法。本文综述了两大类SNP检测方法中主要检测技术的原理和应用,并分析在实际应用中各种检测技术的优缺点。
- 许家磊王宇后猛李强
- 关键词：SNP
- 基于甘薯转录组测序的基因差异表达分析
- 基因的差异表达是细胞形态和功能多样性的根本原因，也是各种生理及病变过程的物质基础。通过基因差异表达分析挖掘有利性状基因是分子生物学的重要研究内容之一，也是分子植物育种工作的重要环节。随着研究的发展，差异表达基因的分析方法...
- 苏在兴王宇许家磊后猛刘亚菊马代夫李强
- 关键词：甘薯基因差异表达转录组淀粉茎线虫病
- 甘薯(Ipomoea batatas L.)SNP标记快速高效检测方法被引量：2
- 2015年
- 单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)广泛存在于甘薯基因组中,可用于甘薯遗传图谱的构建、关联分析和分子标记辅助选择等重要研究。本研究采用两种特异性扩增的方法:等位基因特异性PCR(AS-PCR)和四引物扩增受阻突变体系PCR(Tetra-primer ARMS-PCR),以及酶切扩增多态性序列(CAPS)酶切的方法,对甘薯徐781和徐薯18之间的2个SNP位点T2-32906(C/G)和T3-30695(G/A)进行检测,并通过比较3种检测方法的检测效果,找出快速高效的甘薯SNP分子标记检测方法。琼脂糖凝胶电泳结果显示:AS-PCR的检测结果在2个样本之间出现假阳性而没有明显的差异条带,Tetra-primer ARMS-PCR和CAPS两种方法的检测结果在2个样本间呈现出明显的差异条带,并且能够根据条带数目区分等位基因是否纯合。三种方法的检测结果表明:相对于其他两种检测方法,Tetra-primer ARMS-PCR呈现出更理想的检测效果。另外通过成本比较,Tetra-primer ARMS-PCR成本明显低于CAPS。因此,Tetra-primer ARMS-PCR是一种可用于甘薯SNP位点快速、高效且费用低廉的分子检测方法。
- 许家磊李强后猛刘亚菊王欣唐维闫会张允刚马代夫
- 关键词：甘薯SNP标记
