王泽锋
- 作品数:1 被引量:0H指数:0
- 供职机构:北卡罗来纳大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金安徽大学博士科研启动基金更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 一个RNA剪接调控元件分类方法的研究
- 2012年
- 序列分类方法被广泛应用于各种生物信息学问题,例如转录调控元件识别和蛋白结构预测。本研究设计了一个新的基于序列特征的分类方法,并将其用于RNA剪接调控元件的研究。该方法从已知剪接元件中抽取序列特征,构建一个打分算法,由此预测未知元件RNA剪接调控功能。作为应用实例,采用已知外显子剪接增强子和沉默子(ESE和ESS)八联体作为实验数据,对本方法和若干已知常用方法的预测结果进行比较,3类计算验证实验中的平均预测精度为93%,表现出良好预测精度,且其透明的预测结构可帮助进行生物解释。该研究提供了一种可用于分析生物序列数据的新方法,给出了一个从生物信息学角度来研究基因调控问题的新途径。
- 马猛汪洋汝颖王泽锋
- 关键词:数据挖掘选择性剪接