王晓娜
- 作品数：2 被引量：1H指数：1
- 供职机构：中国科学院动物研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 牛痘病毒感染人巨噬细胞基因表达谱的RNA-Seq分析
- 2021年
- 【目的】利用RNA-Seq,分析人巨噬细胞在牛痘病毒(VACV)感染前后基因表达的变化,探索牛痘病毒与宿主细胞相互作用的机制。【方法】用牛痘病毒感染人巨噬细胞,采用RNA-Seq比较感染组和对照组的差异表达基因,并进行KEGG、GO以及STRING网络分析。【结果】感染组与对照组相比,筛选出显著性差异表达基因4796个,其中上调表达2416个,下调表达2380个。KEGG富集分析表明差异基因主要参与新陈代谢、信号转导、免疫系统和感染疾病等通路。GO功能注释显示这些基因富集在细胞功能调控、物质代谢和免疫调控等生命过程。运用STRING在线蛋白互作数据库,对NOD样信号通路进行分析,鉴定出以JUN、CHUK、IL1B和PYCARD为核心的调控基因。【结论】牛痘病毒感染可以诱导人巨噬细胞基因差异性表达,涉及的生物学过程有很多,对免疫相关的信号通路进行深入的分析,发现C型凝集素受体信号通路(C-type lectin receptor signaling pathway)、Toll样受体信号通路以及NOD样通路等多条通路可能参与调控牛痘病毒感染引起的炎症反应,该研究为解析牛痘病毒的感染机制和免疫逃逸机制以及其在临床上治疗感染性疾病和癌症提供了新思路。
- 霍娆娆孙钦秒王晓娜
- 关键词：RNA-SEQ基因差异表达牛痘病毒巨噬细胞
- 果蝇卵巢中的piRNA发生被引量：1
- 2016年
- piR NA（Piwi-interactiing RNA）是一类长度约为24~32 nt（nucleotides）的非编码RNA.在所有的非编码RNA中,piR NA数量最多,主要存在于生殖系统.piR NA和Argonaute家族的PIWI蛋白特异结合并相互作用,piR NA的生成及其功能依赖于PIWI蛋白.piR NA序列来源于基因组的转座子、编码基因区和特异的基因间位点（intergenic loci）.piR NA作为PIWI的向导调控靶基因的表达以及转录和转录后水平的修饰.在果蝇卵巢生殖细胞中,pi RNA簇的转录子转运到胞浆后经过初级加工途径形成初级piR NA,结合到Piwi和Aub上.生殖细胞的初级piR NA还会进入次级加工途径,经PIWI家族蛋白的协同、加工,使细胞中的piR NA大量扩增,称为乒乓循环（＂Ping-Pong＂cycle）,但是目前对乒乓循环的细节和具体机制还所知甚少.本文以果蝇卵巢为例主要对piR NA的生成、piR NA的初级加工途径和＂乒乓循环＂,以及piR NA的转录沉默等方面的研究进展进行简要综述.
- 王海龙王晓娜陈大华
- 关键词：PIRNAPIWIARGONAUTE
